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阿拉伯岩芥AP2基因家族的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
付春
刘晓伟
+2 位作者
王玲
江纳
杨瑶君
《安徽农业科学》
CAS
2020年第8期114-123,共10页
AP2基因作为一种调控植物花发育的功能基因,参与花分生特性建立。利用生物信息学方法对阿拉伯岩芥AP2蛋白的理化性质、高级结构和系统进化关系等进行了详细的预测和分析。结果表明,除了成员AA40G00375、AA54G00162为稳定蛋白,其余AP2蛋...
AP2基因作为一种调控植物花发育的功能基因,参与花分生特性建立。利用生物信息学方法对阿拉伯岩芥AP2蛋白的理化性质、高级结构和系统进化关系等进行了详细的预测和分析。结果表明,除了成员AA40G00375、AA54G00162为稳定蛋白,其余AP2蛋白均为不稳定蛋白,且大多数蛋白定位在细胞核。只有成员AA8G00350属于分泌蛋白,其余均为非分泌蛋白,且均不属于跨膜蛋白。磷酸化位点分析表明AP2蛋白的生物功能主要是通过在丝氨酸(Ser)位点进行磷酸化来实现的。AP2蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,各个成员的二级结构元件组成含量大小排列顺序为无规则卷曲>α-螺旋>延伸链>β-转角。其中14个AP2蛋白成员有2个保守结构域,其余均有1个保守结构域。系统进化树表明阿拉伯岩芥AP2基因家族与拟南芥、小麦有较近的亲缘关系。这些结果可为进一步研究其生物学功能提供一定的参考依据。
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关键词
阿拉伯岩芥
AP2基因
生物信息学
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职称材料
题名
阿拉伯岩芥AP2基因家族的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
付春
刘晓伟
王玲
江纳
杨瑶君
机构
乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室
乐山师范学院生命科学学院
乐山师范学院数学与信息科学学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2020年第8期114-123,共10页
基金
四川省科技厅项目(17ZZ019)
乐山师范学院人才启动项目(XJR17005)。
文摘
AP2基因作为一种调控植物花发育的功能基因,参与花分生特性建立。利用生物信息学方法对阿拉伯岩芥AP2蛋白的理化性质、高级结构和系统进化关系等进行了详细的预测和分析。结果表明,除了成员AA40G00375、AA54G00162为稳定蛋白,其余AP2蛋白均为不稳定蛋白,且大多数蛋白定位在细胞核。只有成员AA8G00350属于分泌蛋白,其余均为非分泌蛋白,且均不属于跨膜蛋白。磷酸化位点分析表明AP2蛋白的生物功能主要是通过在丝氨酸(Ser)位点进行磷酸化来实现的。AP2蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,各个成员的二级结构元件组成含量大小排列顺序为无规则卷曲>α-螺旋>延伸链>β-转角。其中14个AP2蛋白成员有2个保守结构域,其余均有1个保守结构域。系统进化树表明阿拉伯岩芥AP2基因家族与拟南芥、小麦有较近的亲缘关系。这些结果可为进一步研究其生物学功能提供一定的参考依据。
关键词
阿拉伯岩芥
AP2基因
生物信息学
Keywords
Aethionema arabicum
AP2 gene
Bioinformatics
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
阿拉伯岩芥AP2基因家族的生物信息学分析
付春
刘晓伟
王玲
江纳
杨瑶君
《安徽农业科学》
CAS
2020
3
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