基于SLAF-Seq的阿拉比卡咖啡遗传多样性分析

【目的】采用特异性位点扩增片段测序(SLAF-Seq)技术对阿拉比卡咖啡种质资源进行遗传多样性分析,明确本地咖啡种质遗传背景,为阿拉比卡咖啡新品种选育提供理论依据。【方法】以国内外40份阿拉比卡咖啡和4份非阿拉比卡咖啡(外类群对照)种质资源为材料,采用SLAF-Seq技术对其进行SNP标记开发及系统发育、群体遗传结构及主成分分析。【结果】所有供试咖啡属种质资源测序共获得220.54 Mb数据,测序样品平均Reads数量为5012189条,测序平均Q30为95.90%,平均GC含量为39.48%。定位到参考基因组的Clean reads占所有Clean reads总数的百分比平均为95.05%。从44份咖啡属种质资源中共检测到214254个SLAF标签,平均每份样品SLAF标签数量为140742。SLAF标签在每份样本中的分布数量为46234~171026个。共开发出1186433个群体SNP分子标记,每个样品的SNP分子标记数目为381105~903823个,SNP分子标记完整度为32.12%~76.18%,杂合率为6.23%~17.49%。阿拉比卡咖啡SNP分布具有一定的区域集中性,主要集中在1c~11c这套来自其中一个亲本卡尼弗拉咖啡(中粒种)染色体组上。系统发育、群体遗传结构及主成分3种聚类结果显示,阿拉比卡咖啡铁皮卡型、阿拉比卡咖啡波邦型和含有Catimor的类群被明显区分开来独立成群,并明确了18份阿拉比卡咖啡种质的遗传背景。【结论】40份阿拉比卡咖啡主要分为铁皮卡型类群、波邦型类群和含有Catimor商品种质的类群。采用SLAF-Seq技术所开发的SNP分子标记可准确分析阿拉比卡咖啡资源遗传多样性。

不同初加工工艺对云南阿拉比卡咖啡品质的影响

为了挖掘优质的云南精品咖啡,以云南普文南岛河卡蒂姆系列品种、成熟全红果为试材,探索带果胶非浸泡式发酵(鲜果发酵和水洗干发酵、日晒、黑蜜、干红蜜)和浸泡式发酵(三重水洗发酵、全水洗)等六种不同初加工工艺对生豆粗蛋白质、粗脂肪、咖啡因等内含物质及密度的影响,并采用模糊数学法对熟豆感官风味进行统计学分析。感官评审结果表明:采用黑蜜加工处理和日晒加工处理的咖啡感官品质最佳,综合评分为5.49和5.44,评定为"优";采用三重水洗发酵处理的咖啡豆感官品质最差,综合评分为3.37,评定为"中";干红蜜加工处理的咖啡感官品质综合评分为3.85,评定为"良好";鲜果发酵和水洗干发酵、全水洗发酵加工感官品质综合评分为3.72,3.70,评定为"良"。理化检测结果:带果胶非浸泡式发酵的四种加工方式所得咖啡生豆的粗蛋白质、粗脂肪、咖啡因含量高于两种浸泡式发酵加工所得咖啡生豆;不同的初加工工艺对咖啡生豆密度的影响差异不显著。

咖啡中丙烯酰胺检测方法及含量研究进展

由于丙烯酰胺对人体有神经毒性和潜在的致癌性,在美国,咖啡烘焙、咖啡粉末和速溶咖啡中丙烯酰胺都有限量。目前测定咖啡中丙烯酰胺的方法较多,每种方法各有利弊。主要介绍测定咖啡中丙烯酰胺的4种方法:气相色谱法,高效液相色谱法,气相色谱串联质谱法和液相色谱串联质谱法。总结在各种类咖啡中丙烯酰胺含量检测方法的最新进展。

咖啡中葫芦巴碱检测方法及含量变化研究进展

葫芦巴碱是从豆科植物蝶形花亚科葫芦巴属葫芦巴的干燥种子中分离的一种生物碱。在中西医药典中有多种功效。葫芦巴碱也可以从咖啡豆中提取出,它可以合成很多重要的芳香物质,饮用咖啡可以降低癌症和一些慢性病的风险。目前测定咖啡中葫芦巴碱的方法较多,各有利弊。主要介绍了测定咖啡中葫芦巴碱的五种方法:分光光度分析法,离子色谱法,纸色谱法,高效液相色谱法和液相色谱-质谱法。总结了各种咖啡中葫芦巴碱含量检测方法的最新进展。

咖啡中生物胺含量测定方法研究进展

生物胺是低分子量有机碱,存在于蛋白质丰富的食品尤其是发酵食品中。测定食品中的生物胺方法较多,每种方法都有自己优点和缺点。主要介绍了咖啡中生物胺测定的三种方法:反相高效液相色谱法、离子色谱法和薄层色谱法。重点介绍了三种方法的特点及其在咖啡中的生物胺测定中的应用,并总结了在各种类咖啡生豆、烘焙咖啡中的生物胺含量检测方法与技术,给出了咖啡中的生物胺含量检测结果。

咖啡中国行

100年前,法国传教士田德能把一株阿拉比卡咖啡树幼苗种在朱苦拉的土地上,中国大陆从此与咖啡结缘。然而,对于饮茶大国——中国来说,咖啡的中国之旅并不是一路坦途。在传入中国后相当长的一段时间里,咖啡种植在幅员辽阔的中国也只是"星星点点"。直到近代。

云咖妙意 滇味飘香

云南省是我国最重要的咖啡产区,咖啡种植主要分布在临沧、保山、普洱、德宏等地。它们所处的“咖啡带”( 咖啡一般适合种植在南北回归线之间)为高海拔,地形以山地、坡地为主,且起伏较大,土壤肥沃、日照充足、雨量丰富、昼夜温差大,这些独特的自然条件造就了云南特产阿拉比卡(小粒)咖啡的独特风味一浓而不苦,香而不烈,略带果味。与常见的埃塞俄比亚耶加雪菲咖啡、巴拿马瑰夏咖啡等广大咖啡爱好者熟知的咖啡拥有广大市场空间不同,云南咖啡是随着国内咖啡市场发展及推广而慢慢出圈的。