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HPV病毒检测分型芯片的研制和优化
1
作者
危敏
马文丽
+3 位作者
孙朝晖
张晋芳
李凌
郑文岭
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2009年第3期240-245,共6页
研制和优化寡核苷酸芯片以初步实现对多种常见HPV(Human papillomavirus)病毒的分型检测.应用生物学软件对四型常见HPV病毒(6、11、16、18型)的全基因组序列进行分析,设计具有型特异性、熔解温度(Tm)相近的-60mer寡核苷酸探针...
研制和优化寡核苷酸芯片以初步实现对多种常见HPV(Human papillomavirus)病毒的分型检测.应用生物学软件对四型常见HPV病毒(6、11、16、18型)的全基因组序列进行分析,设计具有型特异性、熔解温度(Tm)相近的-60mer寡核苷酸探针,对玻片片基进行优化处理后,点样制备成寡核苷酸基因芯片.将含HPV全长基因序列的质粒作为阳性标准品,利用梯度限制性荧光标记技术对其进行荧光标记,标记好的样品与芯片杂交.结果显示HPV样品与相应的型特异性探针杂交有明显的荧光信号,而与阴性对照探针和空白对照探针没有杂交信号.通过对芯片片基处理和样品荧光标记方法的优化,可以提高芯片检测的杂交特异性和荧光信号强度.
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关键词
人乳头瘤病毒(HPV)
寡核苷酸芯片
限制性荧光标记技术
检测
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职称材料
题名
HPV病毒检测分型芯片的研制和优化
1
作者
危敏
马文丽
孙朝晖
张晋芳
李凌
郑文岭
机构
南方医科大学基因工程研究所
广州军区广州总医院检验科
华南基因组研究中心
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2009年第3期240-245,共6页
基金
广东省自然科学基金资助项目(D07300239)
广东省医学科学技术研究基金(WSTJJ20071201360103197802270749)资助
文摘
研制和优化寡核苷酸芯片以初步实现对多种常见HPV(Human papillomavirus)病毒的分型检测.应用生物学软件对四型常见HPV病毒(6、11、16、18型)的全基因组序列进行分析,设计具有型特异性、熔解温度(Tm)相近的-60mer寡核苷酸探针,对玻片片基进行优化处理后,点样制备成寡核苷酸基因芯片.将含HPV全长基因序列的质粒作为阳性标准品,利用梯度限制性荧光标记技术对其进行荧光标记,标记好的样品与芯片杂交.结果显示HPV样品与相应的型特异性探针杂交有明显的荧光信号,而与阴性对照探针和空白对照探针没有杂交信号.通过对芯片片基处理和样品荧光标记方法的优化,可以提高芯片检测的杂交特异性和荧光信号强度.
关键词
人乳头瘤病毒(HPV)
寡核苷酸芯片
限制性荧光标记技术
检测
Keywords
human papillomavirus
oligonucleotide microarray
RD-PCR
detection
分类号
R372 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HPV病毒检测分型芯片的研制和优化
危敏
马文丽
孙朝晖
张晋芳
李凌
郑文岭
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2009
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