致病性钩端螺旋体限制性内切酶酶切分析分型研究

为了建立一种简便、稳定的钩体分型方法，我们采用限制性内切酶ＥｃｏＲＩ对致病性钩端螺旋体八个血清群５４个血清型６４株国内外钩体参考株及２７株野生株进行限制性内切酶酶切分析（ＲＥＡ）。结果表明：９１株菌中共有５９种不同的限制性内切酶图谱（ＲＥＰｓ），根据前５条高分子酶切片段可以区分不同的ＲＥＰｓ；除部分血清群中个别不同的血清型有相同的ＲＥＰ型外，大部份血清型都有其独特的ＲＥＰ型，同一血清群往往拥有共同的酶切片段；所研究的同一血清型的国内和国际参考株的ＲＥＰｓ不同；大多数野生株的ＲＥＡ型和参考株相同，差异仅表现为个别高分子带的缺少和增加，ＲＥＡ分型和血清分型吻合较好，通过ＲＥＡ分型基本可区分不同的血清型。

鹑源减蛋综合征病毒QAVc-94株的酶切图谱分析

选HindⅢ、EcoRⅠ、PstⅠ、SphⅠ、BamHⅠ和BglⅠ 6种限制酶 ,对QAVc_94株和AV_12 7国际标准株的DNA进行酶切图谱比较结果发现 ,QAVc_94株用上述 6种酶酶切得到的片段数分别为 10、3、12、4、6、9条 ,将各片段碱基数相加得出其基因组长 34 7kb ,略高于国内的报道 ,而与Zask等的结果相接近 ,从分子水平上将QAVc_94鉴定为一株EDSV。对照AV_12 7株的酶切结果与文献报道相符。QAVc_94株酶切图谱分析显示 :HindⅢ和EcoRⅠ的酶谱与报道的其他EDSV分离株基本相似 ,HindⅢ的酶谱与国内研究最多的AA_2长春分离株一致 ,EcoRⅠ的酶谱结果与Zask等报道的B8/ 78株相同。而其他 4种限制酶的酶切图谱与已报道的各地分离株相比 ,差异较大 ,如PstⅠ和BglⅠ多出 2～ 5个识别位点。说明鹌鹑源EDSV已与鸡源、鸭源、鹅源EDSV有较大的变异 ,是一株血清型相同而基因型不同的鹌鹑减蛋综合征病毒。

食管癌新鲜肿瘤组织中MT-3基因CpG岛甲基化的临床意义

目的:金属硫蛋白(metallothionein,MT)-3不仅具有其它MT共有的细胞解毒功能,还有很强的生长抑制活性,是目前所知唯一一个具有独特生理功能的MT亚型。本研究旨在明确MT-3基因CpG岛在食管癌组织中的甲基化状况及其临床意义。方法:选取2005年5月至7月河北医科大学第四医院胸外科食管癌手术治疗患者68例,其中男49例,女19例;年龄42～76岁;其中食管上段癌6例,中段癌46例,下段癌16例。国际TNM分期:Ⅰ期3例,ⅡA期13例,ⅡB期29例,Ⅲ期22例,Ⅳ期1例。组织学分级:高分化癌8例,中分化癌54例,低分化癌6例。全组患者均为鳞状细胞癌,且随访满30个月。取其新鲜手术标本及切缘正常组织,提取组织DNA及RNA,应用重亚硫酸钠处理限制性酶切图谱分析研究其MT-3基因的甲基化情况;应用实时RT-PCR技术,研究其MT-3mRNA的表达情况,然后与各临床病理参数及随访资料进行比较。结果:全组患者共11例(16.2%)肿瘤组织发现MT-3基因甲基化,而所有患者的上或下切缘的正常组织均未检测到甲基化。存在和不存在甲基化的肿瘤组织中MT-3mRNA的表达水平分别为2.54±1.11和5.13±1.86(P=0.027)。MT-3基因甲基化与TNM分期(P=0.031)、淋巴结转移情况(P=0.001)及术后生存时间(P=0.037)有关,而与患者的性别、肿瘤部位、组织分化程度及肿瘤侵犯深度均无关(P均>0.05)。结论:食管癌组织MT-3基因的甲基化影响该基因的表达水平,此事件易发生于肿瘤晚期患者,与淋巴结转移及预后较差相关。

中国人Wilson病患者基因高频突变位点的快速检测

目的建立可用于临床的中国人Wilson病(WD)患者快速、高效的基因检测方法。方法PCR扩增142例非同源家系的WD患者ATP7B基因第8、12、13外显子(以30例健康人为正常对照),分别以限制性内切酶MspI、TaiI和BstDsI消化扩增产物,2%琼脂糖凝胶电泳分离,根据各外显子的限制性酶切图谱分析有无突变,其结果经DNA测序验证。结果48.59%(69/142)的患者在第8外显子检出Arg778Leu突变,其中纯合突变13例,杂合突变56例,染色体突变频率为28.87%(82/284);5.63%(8/142)的患者在第12外显子检出Thr935Met杂合突变,染色体突变频率为2.82%(8/284);24.65%(35/142)的患者在第13外显子检出Pro992Leu突变,其中纯合突变3例,杂合突变32例,染色体突变频率为13.38%(38/284)。检出突变的患者中有12例为Arg778Leu/Pro992Leu复合杂合突变,1例Arg778Leu/Thr935Met复合杂合突变,1例Arg778Leu纯合突变合并Pro992Leu杂合突变,总检出率为69.01%(98/142)。以上结果均经DNA测序证实。结论13外显子Pro992Leu突变是中国人WD患者的基因突变热点之一。采用限制性酶谱分析法能快速、准确检出WD患者基因高频突变位点,可用于对WD疑诊患者及其家系成员的基因诊断。

40例α地中海贫血的实验诊断及基因型

在2992例贫血原因待查者中,采用血红蛋白生化分析,诊断α地中海贫血40例,其中,HbH 14例,HbH-Bart′s 9例,α地中海贫血1 12例,α地中海贫血2 5例。继采用限制性内切酶图谱分析结合聚合酶链反应技术,检出基因型:--SEA/-α3.723例,--SEA/αα12例,αα/-α3.75例。

分子流行病学常用实验方法及其应用

分子流行病学常用实验方法及其应用潘赛贻分子生物学技术的发展使传染病的快速诊断更敏感、更特异，为流行病学研究提供了新方法，并提高了流行病学研究的能力。进入８０年代以来，不少的流行病学研究是以分子生物学技术进行的。因此分子流行病学应运而生，它是将分子生物...

分子流行病学

分子流行病学莫美仪分子流行病学（ＭｏｌｅｃｕｌａｒＥｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ）是应用分子生物学的原理和技术，从分子乃至基因水平上去研究疾病的群体现象及其规律，探索病因，预防疾病的科学。它是近十年来逐步发展形成的流行病学一门新的分支学科。分子流行病学的研...

福建畲族葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因突变型

目的研究福建畲族葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因突变型特点,调查其G6PD缺乏症发生率及基因频率。方法用硝基四氮唑蓝(NBT)纸片法进行G6PD缺乏症定性筛查,用突变特异性扩增系统、错配碱基PCR介导酶切位点/限制性内切酶图谱分析、聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)和DNA测序进行基因突变型鉴定。结果在1820名青水畲族和764名穆云畲族人中,分别发现101例和104例酶活性异常,两地的致病基因频率分别为0.0607和0.1706。在穆云乡54例纯畲族血缘的样本中,共检出nt1376G→T突变38例、nt1388G→A突变12例、nt95A→G突变6例,三种基因突变型分别占70.3%,18.5%和11.1%;并发现1例nt1376G→T复合nt95A→G突变、1例nt1376G→T复合nt1388G→A突变。在青水畲族中发现6例nt1024C→T突变,占8.6%;发现1例392G→T突变。结论①nt1376G→T、nt1388G→A是福建畲族中主要的基因突变型,中华民族具有共同的G6PD基因突变型,因而可能源于共同的祖先。②在畲族人群中发现nt1376G→T、nt1388G→A、nt95A→G、nt1024C→T和nt392G→T5种基因突变型。③发现nt1376G→T复合nt95A→G突变、nt1376G→T复合nt1388G→A突变。④nt95A→G是穆云畲族中另一种常见的基因突变型;1024C→T是青水畲族中常见的一种G6PD基因突变型。⑤明确青水畲族中G6PD基因频率为0.0607,穆云畲族中为0.1706,为上述地区G6PD缺乏症的防治提供决策参考。