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基于普通转录组和孟德尔随机分析探讨肾透明细胞癌中PANoptosis相关基因的诊断价值
1
作者
王智超
仇梦真
+2 位作者
高兴华
高相芹
张龙洋
《临床医学进展》
2024年第4期156-173,共18页
肾透明细胞癌(KIRC)是一种常见的泌尿生殖系统恶性肿瘤,但其早期发现和诊断相当困难。泛凋亡(PANoptosis)强调细胞焦亡、细胞凋亡和坏死之间的作用和协调。本研究的目的是通过孟德尔随机分析方法(MR),确定PANoptosis相关基因(PRG)在KIR...
肾透明细胞癌(KIRC)是一种常见的泌尿生殖系统恶性肿瘤,但其早期发现和诊断相当困难。泛凋亡(PANoptosis)强调细胞焦亡、细胞凋亡和坏死之间的作用和协调。本研究的目的是通过孟德尔随机分析方法(MR),确定PANoptosis相关基因(PRG)在KIRC中的作用,并揭示其因果关系。通过对3446个差异表达基因(DEGs)和347个PRGs进行交叉分析,我们发现66个差异表达的PANoptosis相关基因(DE-PRGs)存在表达量性状位点(eQTL)。分别进行双样本单变量和多变量MR分析后发现,PRF1 (P = 0.030,OR 95% 置信区间[CI] = 1.599 [1.047~2.441])、TNFRSF10B (P = 0. 008, OR 95% CI = 1.238 [1.058~1.447])、PDGFRB (P = 0.012, OR 95% CI = 0.546 [0.340~0.876])基因与KIRC疾病有关,以上3个标记基因同时存在时,PDGFRB基因是一个直接因素。此外,基于生物信息学分析,建立了具有良好诊断价值的KIRC模型。最后,通过数据分析和实时荧光定量PCR (RT-qPCR)验证标记基因的表达。
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关键词
肾脏透明细胞癌(KIRC)、泛凋亡相关基因(PRG)、
差异
表达基因(DEG)、孟德尔
随机
化(MR)分析、诺模图
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职称材料
基于洪水过程预报误差的水库防洪调度风险的分析
2
作者
高滢钦
于琦
赵培根
《中文科技期刊数据库(全文版)工程技术》
2021年第12期119-120,共2页
基于洪水过程预报误差的水库防洪调度风险的分析,推论了相对性水灾气象预报偏差的标准偏差与可预测性指数的关联,明确提出了一种根据预测分析偏差遍布规律性的水利枢纽调洪优化算法和一种新的水利枢纽调洪优化算法。将水灾全过程气象预...
基于洪水过程预报误差的水库防洪调度风险的分析,推论了相对性水灾气象预报偏差的标准偏差与可预测性指数的关联,明确提出了一种根据预测分析偏差遍布规律性的水利枢纽调洪优化算法和一种新的水利枢纽调洪优化算法。将水灾全过程气象预报转换为水利枢纽水位线的可变性,剖析了水利枢纽防汛气象预报的风险性水准,并以隔河岩水利枢纽为例子实现了实例分析。测算了不一样水灾气象预报精密度情况下水利枢纽极限风险性率和堤坝溢流式风险性率,为定编水灾气象预报汇报给予了科学论证。
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关键词
风险分析
随机差异
洪水预测误差
预报计划
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职称材料
应用差异显示技术克隆胶质瘤细胞诱导分化相关基因
被引量:
11
3
作者
孙立军
黄强
+3 位作者
王爱东
李晓楠
兰青
杜子威
《中华神经外科杂志》
CSCD
北大核心
2003年第2期89-92,共4页
目的 克隆胶质瘤细胞诱导分化相关新基因。方法 应用RNA随机引物差异显示、SSCP纯化、PCR产物快速克隆、反Northern杂交及生物信息学分析等方法 ,观察人脑胶质瘤细胞株SHG 44 9分化过程中的基因表达变化。结果 克隆了诱导分化前后...
目的 克隆胶质瘤细胞诱导分化相关新基因。方法 应用RNA随机引物差异显示、SSCP纯化、PCR产物快速克隆、反Northern杂交及生物信息学分析等方法 ,观察人脑胶质瘤细胞株SHG 44 9分化过程中的基因表达变化。结果 克隆了诱导分化前后表达差异显著的 1 5个基因 ,其中诱导后下调基因 4个 ,上调基因 1 1个。同源性分析表明 ,5个是已知基因 ,1 0个是未知基因。诱导后上调的DIG 1基因与c myc内含子结合蛋白 1 (MIBP1 )基因高度同源 ,此基因具有转录因子活性 ,表达的蛋白可抑制c myc基因的表达。结论 克隆了 1 5个人脑胶质瘤细胞诱导分化相关基因 ,其中控制c myc基因表达的MIBP1基因诱导分化后上调提示 ,它可能是调控胶质瘤细胞分化基因 ,值得进一步研究。
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关键词
差异
显示技术
克隆
MIBP1
胶质瘤
细胞分化
RNA
随机
引物
差异
显示
基因表达
原文传递
题名
基于普通转录组和孟德尔随机分析探讨肾透明细胞癌中PANoptosis相关基因的诊断价值
1
作者
王智超
仇梦真
高兴华
高相芹
张龙洋
机构
山东大学附属济南市中心医院泌尿外科
山东第一医科大学附属中心医院泌尿外科
出处
《临床医学进展》
2024年第4期156-173,共18页
文摘
肾透明细胞癌(KIRC)是一种常见的泌尿生殖系统恶性肿瘤,但其早期发现和诊断相当困难。泛凋亡(PANoptosis)强调细胞焦亡、细胞凋亡和坏死之间的作用和协调。本研究的目的是通过孟德尔随机分析方法(MR),确定PANoptosis相关基因(PRG)在KIRC中的作用,并揭示其因果关系。通过对3446个差异表达基因(DEGs)和347个PRGs进行交叉分析,我们发现66个差异表达的PANoptosis相关基因(DE-PRGs)存在表达量性状位点(eQTL)。分别进行双样本单变量和多变量MR分析后发现,PRF1 (P = 0.030,OR 95% 置信区间[CI] = 1.599 [1.047~2.441])、TNFRSF10B (P = 0. 008, OR 95% CI = 1.238 [1.058~1.447])、PDGFRB (P = 0.012, OR 95% CI = 0.546 [0.340~0.876])基因与KIRC疾病有关,以上3个标记基因同时存在时,PDGFRB基因是一个直接因素。此外,基于生物信息学分析,建立了具有良好诊断价值的KIRC模型。最后,通过数据分析和实时荧光定量PCR (RT-qPCR)验证标记基因的表达。
关键词
肾脏透明细胞癌(KIRC)、泛凋亡相关基因(PRG)、
差异
表达基因(DEG)、孟德尔
随机
化(MR)分析、诺模图
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于洪水过程预报误差的水库防洪调度风险的分析
2
作者
高滢钦
于琦
赵培根
机构
海河水利委员会引滦工程管理局
出处
《中文科技期刊数据库(全文版)工程技术》
2021年第12期119-120,共2页
文摘
基于洪水过程预报误差的水库防洪调度风险的分析,推论了相对性水灾气象预报偏差的标准偏差与可预测性指数的关联,明确提出了一种根据预测分析偏差遍布规律性的水利枢纽调洪优化算法和一种新的水利枢纽调洪优化算法。将水灾全过程气象预报转换为水利枢纽水位线的可变性,剖析了水利枢纽防汛气象预报的风险性水准,并以隔河岩水利枢纽为例子实现了实例分析。测算了不一样水灾气象预报精密度情况下水利枢纽极限风险性率和堤坝溢流式风险性率,为定编水灾气象预报汇报给予了科学论证。
关键词
风险分析
随机差异
洪水预测误差
预报计划
分类号
TV697.13 [水利工程—水利水电工程]
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职称材料
题名
应用差异显示技术克隆胶质瘤细胞诱导分化相关基因
被引量:
11
3
作者
孙立军
黄强
王爱东
李晓楠
兰青
杜子威
机构
苏州大学附属第二医院神经外科暨脑肿瘤研究室
出处
《中华神经外科杂志》
CSCD
北大核心
2003年第2期89-92,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(39870 82 6 )
文摘
目的 克隆胶质瘤细胞诱导分化相关新基因。方法 应用RNA随机引物差异显示、SSCP纯化、PCR产物快速克隆、反Northern杂交及生物信息学分析等方法 ,观察人脑胶质瘤细胞株SHG 44 9分化过程中的基因表达变化。结果 克隆了诱导分化前后表达差异显著的 1 5个基因 ,其中诱导后下调基因 4个 ,上调基因 1 1个。同源性分析表明 ,5个是已知基因 ,1 0个是未知基因。诱导后上调的DIG 1基因与c myc内含子结合蛋白 1 (MIBP1 )基因高度同源 ,此基因具有转录因子活性 ,表达的蛋白可抑制c myc基因的表达。结论 克隆了 1 5个人脑胶质瘤细胞诱导分化相关基因 ,其中控制c myc基因表达的MIBP1基因诱导分化后上调提示 ,它可能是调控胶质瘤细胞分化基因 ,值得进一步研究。
关键词
差异
显示技术
克隆
MIBP1
胶质瘤
细胞分化
RNA
随机
引物
差异
显示
基因表达
Keywords
MIBP1 Glioma Cell differentiation RAP DD Gene expression
分类号
R739.4 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于普通转录组和孟德尔随机分析探讨肾透明细胞癌中PANoptosis相关基因的诊断价值
王智超
仇梦真
高兴华
高相芹
张龙洋
《临床医学进展》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
基于洪水过程预报误差的水库防洪调度风险的分析
高滢钦
于琦
赵培根
《中文科技期刊数据库(全文版)工程技术》
2021
0
下载PDF
职称材料
3
应用差异显示技术克隆胶质瘤细胞诱导分化相关基因
孙立军
黄强
王爱东
李晓楠
兰青
杜子威
《中华神经外科杂志》
CSCD
北大核心
2003
11
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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