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基于网络间随机游走算法的lncRNA与疾病关系预测
1
作者
尚敏
贺平安
《浙江理工大学学报(自然科学版)》
2020年第5期693-700,共8页
通过构造疾病之间、lncRNA之间、基因之间的相似性网络模型,根据已有三者之间的相互关联数据,引入网络间随机游走算法预测潜在与疾病相关的lncRNA。将该算法应用到已有数据库中的lncRNA与疾病关联信息数据上,通过10倍交叉验证和AUC评估...
通过构造疾病之间、lncRNA之间、基因之间的相似性网络模型,根据已有三者之间的相互关联数据,引入网络间随机游走算法预测潜在与疾病相关的lncRNA。将该算法应用到已有数据库中的lncRNA与疾病关联信息数据上,通过10倍交叉验证和AUC评估该算法。结果表明:与其他算法相比,该算法在10倍交叉验证下有更优的AUC值,显示该算法具有良好的预测性能。进一步应用该算法预测了与胃癌和结直肠癌相关的lncRNA,结果与已知的医学数据一致,表明该算法对于新疾病相关lnRNA的预测结果是有效的。
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关键词
疾病
基因
长链非编码RNA
网络
模型
网络
间
随机
游
走
相似性
预测
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职称材料
个体具有异质易感性的动态网络SIS传染病模型
被引量:
2
2
作者
张泽琼
彭小龙
《云南师范大学学报(自然科学版)》
2017年第6期26-31,共6页
基于随机游走建立了动态网络上个体易感率及易感半径均具有异质性的SIS传染病模型,采用下一代矩阵方法得到了该模型的基本再生数R0.证明了当R0<1时无病平衡点的全局渐近稳定性和当R_0>1时正平衡点的全局渐近稳定性,并通过数值计...
基于随机游走建立了动态网络上个体易感率及易感半径均具有异质性的SIS传染病模型,采用下一代矩阵方法得到了该模型的基本再生数R0.证明了当R0<1时无病平衡点的全局渐近稳定性和当R_0>1时正平衡点的全局渐近稳定性,并通过数值计算和随机模拟验证了理论结果.
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关键词
随机游走网络
易感性异质性
基本再生数
平衡点稳定性
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职称材料
题名
基于网络间随机游走算法的lncRNA与疾病关系预测
1
作者
尚敏
贺平安
机构
浙江理工大学理学院
出处
《浙江理工大学学报(自然科学版)》
2020年第5期693-700,共8页
基金
国家自然科学基金项目(61772027)。
文摘
通过构造疾病之间、lncRNA之间、基因之间的相似性网络模型,根据已有三者之间的相互关联数据,引入网络间随机游走算法预测潜在与疾病相关的lncRNA。将该算法应用到已有数据库中的lncRNA与疾病关联信息数据上,通过10倍交叉验证和AUC评估该算法。结果表明:与其他算法相比,该算法在10倍交叉验证下有更优的AUC值,显示该算法具有良好的预测性能。进一步应用该算法预测了与胃癌和结直肠癌相关的lncRNA,结果与已知的医学数据一致,表明该算法对于新疾病相关lnRNA的预测结果是有效的。
关键词
疾病
基因
长链非编码RNA
网络
模型
网络
间
随机
游
走
相似性
预测
Keywords
disease
gene
long non-coding RNA
network model
internetwork random walk
similarity
prediction
分类号
O29 [理学—应用数学]
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职称材料
题名
个体具有异质易感性的动态网络SIS传染病模型
被引量:
2
2
作者
张泽琼
彭小龙
机构
山西大学复杂系统研究所
山西大学数学科学学院
出处
《云南师范大学学报(自然科学版)》
2017年第6期26-31,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(11601294)
山西省回国留学人员科研基金资助项目(2016-011)
山西省青年基金资助项目(201601D021012)
文摘
基于随机游走建立了动态网络上个体易感率及易感半径均具有异质性的SIS传染病模型,采用下一代矩阵方法得到了该模型的基本再生数R0.证明了当R0<1时无病平衡点的全局渐近稳定性和当R_0>1时正平衡点的全局渐近稳定性,并通过数值计算和随机模拟验证了理论结果.
关键词
随机游走网络
易感性异质性
基本再生数
平衡点稳定性
Keywords
Random walk network
Heterogeneous susceptibility
Basic reproduction number
Equilibrium stability
分类号
O175 [理学—基础数学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络间随机游走算法的lncRNA与疾病关系预测
尚敏
贺平安
《浙江理工大学学报(自然科学版)》
2020
0
下载PDF
职称材料
2
个体具有异质易感性的动态网络SIS传染病模型
张泽琼
彭小龙
《云南师范大学学报(自然科学版)》
2017
2
下载PDF
职称材料
已选择
0
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导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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