种间基因渐渗检测方法及其应用研究进展

伴随着谱系分选进程,从共同祖先群体分裂后形成的子代群体间的基因流逐渐衰减,并可能延续至新物种形成.种间基因组序列差异或种间群体基因频率的变异部分地记录了这些种群历史和当代动态过程,可以根据种间基因组序列变异或基因频率变异推测这些发生过的事件.本文系统探讨了检测种间基因渐渗的方法,包括基于种间群体基因频率变异分析(Fst,LD, STRUCTURE, AFS, TreeMix)和基于种间DNA序列差异分析(ABBA-BABA,IM, IIM, ABC)方法,分析了这些方法的原理和应用局限性,拓展这些方法中的一些重要假设将是今后研究任务之一,包括基因重组效应、区分配子与合子迁移的贡献、交配系统与基因流互作以及适应性基因迁移的阻碍作用.澄清这些影响有助于深入理解物种形成过程.