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基因芯片筛选尿道下裂雌激素敏感基因的研究
被引量:
2
1
作者
马利民
周娟
+4 位作者
王忠
姜华
刘本春
达骏
Laurence S.Baskin
《中华泌尿外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期63-66,共4页
目的寻找与尿道下裂发病密切相关的基因,探讨尿道下裂形成机制。方法①实验组为12例尿道下裂患儿,年龄6~12个月,平均8个月。尿道下裂中度5例,重度7例。组织标本取自尿道成形手术时切取的尿道板组织。②对照组为6例年龄匹配的男性...
目的寻找与尿道下裂发病密切相关的基因,探讨尿道下裂形成机制。方法①实验组为12例尿道下裂患儿,年龄6~12个月,平均8个月。尿道下裂中度5例,重度7例。组织标本取自尿道成形手术时切取的尿道板组织。②对照组为6例年龄匹配的男性患儿,留取包皮环切时的正常表皮组织。用Tri—Reagent分别提取总RNA,与含22000个人类基因的寡核苷酸基因芯片杂交、洗脱、染色、扫描,基因强度变化行方差分析(ANOVA,P〈0.01)和Tukey分析,基因表达强度变化〉2倍作为有意义的基因,比较尿道下裂和正常组织之间基因表达差异。从上调表达的基因中选择雌激素敏感基因行RT-PCR,标本除上述患儿RNA外,再增加年龄配对的3例中度、1例重度尿道下裂和2例年龄配对的RNA作为对照,即对照、中度和重度尿道下裂患者RNA标本各8例,验证芯片结果。结果尿道下裂组织与正常组织之间存在明显的基因表达差异,共筛选出表达强度变化〉2倍的基因94个,其中中度尿道下裂与正常比较,47个基因上调表达(P〈0.01);重度尿道下裂与正常比较,68个基因上调表达(P〈0.001);重度与中度比较,17个基因上调表达(P〉0.05)。上调表达的基因中发现了4个雌激素敏感基因CYR61、结缔组织生长因子、ATF3和GADD45β,基因芯片和RT—PCR均证实其在尿道下裂组织中的表达明显高于正常对照。结论异常表达的基因与尿道下裂的发生有关,尿道下裂组织中雌激素敏感基因上调表达参与了尿道下裂的发病机制。
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关键词
寡核苷酸序列分析
尿道下裂
雌激素敏感基因
原文传递
题名
基因芯片筛选尿道下裂雌激素敏感基因的研究
被引量:
2
1
作者
马利民
周娟
王忠
姜华
刘本春
达骏
Laurence S.Baskin
机构
上海交通大学医学院附属第九人民医院泌尿外科
美国加州大学旧金山分校泌尿外科
出处
《中华泌尿外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期63-66,共4页
基金
国家自然科学基金(30672110)
上海市科委基础重点项目资助项目(08JC1414000)
文摘
目的寻找与尿道下裂发病密切相关的基因,探讨尿道下裂形成机制。方法①实验组为12例尿道下裂患儿,年龄6~12个月,平均8个月。尿道下裂中度5例,重度7例。组织标本取自尿道成形手术时切取的尿道板组织。②对照组为6例年龄匹配的男性患儿,留取包皮环切时的正常表皮组织。用Tri—Reagent分别提取总RNA,与含22000个人类基因的寡核苷酸基因芯片杂交、洗脱、染色、扫描,基因强度变化行方差分析(ANOVA,P〈0.01)和Tukey分析,基因表达强度变化〉2倍作为有意义的基因,比较尿道下裂和正常组织之间基因表达差异。从上调表达的基因中选择雌激素敏感基因行RT-PCR,标本除上述患儿RNA外,再增加年龄配对的3例中度、1例重度尿道下裂和2例年龄配对的RNA作为对照,即对照、中度和重度尿道下裂患者RNA标本各8例,验证芯片结果。结果尿道下裂组织与正常组织之间存在明显的基因表达差异,共筛选出表达强度变化〉2倍的基因94个,其中中度尿道下裂与正常比较,47个基因上调表达(P〈0.01);重度尿道下裂与正常比较,68个基因上调表达(P〈0.001);重度与中度比较,17个基因上调表达(P〉0.05)。上调表达的基因中发现了4个雌激素敏感基因CYR61、结缔组织生长因子、ATF3和GADD45β,基因芯片和RT—PCR均证实其在尿道下裂组织中的表达明显高于正常对照。结论异常表达的基因与尿道下裂的发生有关,尿道下裂组织中雌激素敏感基因上调表达参与了尿道下裂的发病机制。
关键词
寡核苷酸序列分析
尿道下裂
雌激素敏感基因
Keywords
Oligonueleotide array sequence analysis
Hypospadias
Estrogen responsive gene
分类号
R726.9 [医药卫生—儿科]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基因芯片筛选尿道下裂雌激素敏感基因的研究
马利民
周娟
王忠
姜华
刘本春
达骏
Laurence S.Baskin
《中华泌尿外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
原文传递
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参考文献
引证文献
统计分析
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