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题名基于临床与基因图谱的结肠癌基因标签提取
被引量:2
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作者
孟秋池
邵伟
葛成伟
程浩
丁建东
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机构
南京工业大学电子与信息工程学院
南京工业大学理学院
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出处
《数学的实践与认识》
CSCD
北大核心
2011年第14期59-66,共8页
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文摘
由于基因间的调控和相互作用表现为功能基因组合的形式,在对样本的分类能力是以特征集合的形式整体体现出来的.由此,考察由多个基因构成的基因簇作为区分常人和癌症患者的分类因素,利用独立成分分析(ICA)技术最大程度地降低基因之间的相互影响,从而获得基因簇信息.随后采用了支持向量机,依据提取出的基因簇进行分类,筛选出致病的癌症基因.为了能够得到最好的分类因素,将问题转化为稀疏表示的优化问题.此外,还利用含噪声的ICA和带松弛因子的非光滑优化模型来研究含噪声的基因图谱.最后,借助于条件概率模型,将临床结论与基因图谱相结合,对病人数据进行了筛选.
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关键词
基因簇
分类因素
独立成分分析
支持向量机
松弛因子
非光滑优化模型
含噪声
临床结论
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Keywords
noise
gene cluster
ICA
SVM
non-smooth optimization
gene signature
clinical research
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分类号
R735.35
[医药卫生—肿瘤]
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