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16S rRNA基因序列分析在非典型菌株鉴定中的应用 被引量:11
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作者 张守印 李振军 +5 位作者 张集 朱勇 庞慧 郑宵 贺金荣 海荣 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第4期616-617,726,共3页
目的:建立16S rRNA基因序列分析鉴定细菌的方法,评价其对常规方法不能鉴定菌株的鉴定效果。方法:选择细菌的16S rRNA基因为靶序列,在两端保守区设计引物,对三株生化、形态不典型菌株提取模板进行PCR扩增,PCR产物纯化后进行克隆,测序。结... 目的:建立16S rRNA基因序列分析鉴定细菌的方法,评价其对常规方法不能鉴定菌株的鉴定效果。方法:选择细菌的16S rRNA基因为靶序列,在两端保守区设计引物,对三株生化、形态不典型菌株提取模板进行PCR扩增,PCR产物纯化后进行克隆,测序。结果:三株细菌的16S rRNA基因序列与Genbank比较,YC1序列与大肠杆菌相似性>99%,YC2序列与肺炎克雷伯菌相似性>99%,YC3序列与缓症链球菌相似性>98%。结论:16S rRNA基因序列分析的方法可以较好地鉴定常规方法难以鉴定的不典型菌株。 展开更多
关键词 16S RRNA基因 序列分析 非典型菌株
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布鲁氏菌非典型菌株生长状态的热谱学研究
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作者 郝宗宇 张爱梅 +5 位作者 吕家锐 付玉生 谭宗民 谢昌礼 谢小红 屈松生 《河南预防医学杂志》 1993年第1期30-31,共2页
针对大型水电站经济运行问题,在传统动态规划方法的基础上,提出了一种多重动态规划模型,通过求解模型,获得了在水库入流和水头为定值时的大型水电站各台机组的最佳负荷运行分配方案。实例研究表明,文中提出的模型是可行的,对大型... 针对大型水电站经济运行问题,在传统动态规划方法的基础上,提出了一种多重动态规划模型,通过求解模型,获得了在水库入流和水头为定值时的大型水电站各台机组的最佳负荷运行分配方案。实例研究表明,文中提出的模型是可行的,对大型水电站经济运行具有一定的意义,同时也说明,大型水电站的经济运行比常规运行更能取得效益。 展开更多
关键词 非典型菌株 热谱 布鲁氏杆
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疑似食物中毒患者标本一株侵袭性大肠埃希菌O_(29):K?的分离及实验探讨 被引量:1
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作者 高亚色 梁英 《实用预防医学》 CAS 2007年第1期199-200,共2页
目的对一株分离于疑似食物中毒腹泻患者的EIEC菌株进行生化特征、血清学及致病侵袭力实验探讨。方法参照GB/T4789.6—2003和卫生防疫细菌检验。结果3份标本分离到的同一血清型EIECO_(29)K?菌株,经全面生化反应,血清学及Sereny试验证实... 目的对一株分离于疑似食物中毒腹泻患者的EIEC菌株进行生化特征、血清学及致病侵袭力实验探讨。方法参照GB/T4789.6—2003和卫生防疫细菌检验。结果3份标本分离到的同一血清型EIECO_(29)K?菌株,经全面生化反应,血清学及Sereny试验证实为一株非典型生化特征,丧失侵袭力的EIEC菌株。结论在肠道病原菌的鉴定中,非典型生化特征及丧失侵袭力的EIEC菌株应引起注意。 展开更多
关键词 EIEC 非典型菌株 侵袭力
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天津地区临床分离株结核分枝杆菌分子流行病学研究 被引量:1
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作者 李卫民 柴利泉 +8 位作者 李丽 戴宗甲 白大鹏 张立 邵世峰 吴琦 陆伟 孙照刚 李传友 《结核病与胸部肿瘤》 2007年第1期18-25,共8页
目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日~11月25日就诊病人痰培养阳性的结核分枝杆菌100株,采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列(VNTR)两... 目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日~11月25日就诊病人痰培养阳性的结核分枝杆菌100株,采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列(VNTR)两种方法进行基因分型,并运用软件对二者的结果进行分析。依据北京分化支的定义。运用多重和实时定量PCR方法将其区分为W菌/典型北京家族菌株和非典型北京菌株,x^2检验分析两种亚群与患者年龄和耐药性之间的联系。结果排除污染菌株,共对96株结核分枝杆菌临床分离株进行两种方法的基因分型,Spoligotyping结果为91.7%为北京基因型(含3株类北京基因型)结核分枝杆菌(88/96)。VNTR分型可将北京基因型分为60种基因型。在北京分化支结核分枝杆菌中,W菌/典型北京家族菌株占93.2%(82/88)。两种北京分化支亚群与患者年龄和耐药性没有显著性统计学差异(P〉0.05)。结论天津地区结核病患者临床分离的结核分枝杆菌中,北京基因型呈现较为明显的优势。VNTR的分辨率明显高于Spoligotyping。北京分化支的两种亚群在天津地区临床结核病患者中均存在流行,但以W菌/典型北京家族菌株为主。 展开更多
关键词 分枝杆 结核 北京基因型 数目可变串联重复序列 北京分化支 典型北京家族 典型北京
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李斯特菌毒力因子及其进化 被引量:24
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作者 陈健舜 江玲丽 方维焕 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期738-742,共5页
李斯特菌属包含6个种,毒力各有差异。在细菌耐受外界环境、黏附侵袭及细胞内感染过程中,毒力因子各司其职又相互协作。毒力基因常聚集为毒力岛,其中PrfA依赖型毒力基因簇(LIPI-1)与内化素岛(LIPI-2)是致病种最重要的两个毒力岛。李斯特... 李斯特菌属包含6个种,毒力各有差异。在细菌耐受外界环境、黏附侵袭及细胞内感染过程中,毒力因子各司其职又相互协作。毒力基因常聚集为毒力岛,其中PrfA依赖型毒力基因簇(LIPI-1)与内化素岛(LIPI-2)是致病种最重要的两个毒力岛。李斯特菌各个种可能来源于同一个携带有完整毒力岛的祖先,在长期进化过程中,通过基因水平转移或重组、整合等事件,演化为目前流行的6个种。噬菌体、转座子、质粒等可能扮演着毒力进化执行者的角色。一些天然非典型菌株是目前研究的热点,如含有LIPI-1的无害李斯特菌和缺失LIPI-1的塞氏李斯特菌,其演化进程可能尚未达到或已超越目前流行的状态,为李斯特菌毒力进化的研究提供了重要线索。 展开更多
关键词 李斯特 毒力因子 毒力进化 非典型菌株
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天津地区临床分离结核分枝杆菌分型的初步研究 被引量:11
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作者 柴利泉 李卫民 +8 位作者 李丽 戴宗甲 白大鹏 张立 邵世峰 吴琦 陆伟 孙照刚 李传友 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期785-788,共4页
目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日-11月25日就诊患者痰培养阳性的结核分枝杆菌100株,采用间隔区寡核苷酸分型(sp01igotyping)和多位点可变串联重复序列(VNTR)两种方... 目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日-11月25日就诊患者痰培养阳性的结核分枝杆菌100株,采用间隔区寡核苷酸分型(sp01igotyping)和多位点可变串联重复序列(VNTR)两种方法进行基因分型,并运用软件对二者的结果进行分析。依据北京分化支的定义,运用多重和实时定量PCR方法将其区分为W菌/典型北京家族菌株和非典型北京菌株,X^2检验分析两种亚群与患者年龄和耐药性之间的联系。结果排除污染菌株,共对96株结核分枝杆菌临床分离株进行两种方法的基因分型,spoligotyping结果91.7%为北京基因型(含3株类北京基因型)结核分枝杆菌(88/96)。VNTR分型可将北京基因型分为60种基因型。在北京分化支结核分枝杆菌中,W菌/典型北京家族菌株占93.2%(82/88)。两种北京分化支亚群与患者年龄及耐药性之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论天津地区结核病患者临床分离的结核分枝杆菌中,北京基因型呈现较为明显的优势。VNTR的分辨率明显高于spoligotyping。北京分化支的两种亚群在天津地区临床结核病患者中均有流行,但以W菌/典型北京家族菌株为主。 展开更多
关键词 结核分枝杆 北京基因型 北京分化支 W/典型北京家族 典型北京
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