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利用基因组比对方法寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列
被引量:
2
1
作者
虞剑
黄勇
+2 位作者
周长林
童贻刚
方宏清
《生物技术通讯》
CAS
2014年第5期640-643,共4页
目的:寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列。方法:采用基因组比对的方法,通过软件MAUVE分别对大肠杆菌DH1与miniMG1655、miniW3110进行基因组比对,筛选得到大肠杆菌DH1基因组中的候选非必需序列,进而以基因必需性评分的方法确定非必需...
目的:寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列。方法:采用基因组比对的方法,通过软件MAUVE分别对大肠杆菌DH1与miniMG1655、miniW3110进行基因组比对,筛选得到大肠杆菌DH1基因组中的候选非必需序列,进而以基因必需性评分的方法确定非必需序列。结果与结论:通过基因组比对及基因必需性评分的方法,确定了大肠杆菌DH1基因组中64个非必需序列区域,占全基因组的26.3%。非必需序列区域的确定,为后续构建基因组减小的大肠杆菌miniDH1提供了基础。
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关键词
基因组比对
非必需序列
大肠杆菌DH1
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职称材料
题名
利用基因组比对方法寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列
被引量:
2
1
作者
虞剑
黄勇
周长林
童贻刚
方宏清
机构
中国药科大学生命科学与技术学院
军事医学科学院生物工程研究所
军事医学科学院微生物流行病研究所
出处
《生物技术通讯》
CAS
2014年第5期640-643,共4页
基金
国家重点基础研究发展计划(2011CBA00800)
文摘
目的:寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列。方法:采用基因组比对的方法,通过软件MAUVE分别对大肠杆菌DH1与miniMG1655、miniW3110进行基因组比对,筛选得到大肠杆菌DH1基因组中的候选非必需序列,进而以基因必需性评分的方法确定非必需序列。结果与结论:通过基因组比对及基因必需性评分的方法,确定了大肠杆菌DH1基因组中64个非必需序列区域,占全基因组的26.3%。非必需序列区域的确定,为后续构建基因组减小的大肠杆菌miniDH1提供了基础。
关键词
基因组比对
非必需序列
大肠杆菌DH1
Keywords
genomic comparison
nonessential sequences
Escherichia coli DH1
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用基因组比对方法寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列
虞剑
黄勇
周长林
童贻刚
方宏清
《生物技术通讯》
CAS
2014
2
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