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上海动物园非洲企鹅种群线粒体DNA序列分析及遗传管理建议
被引量:
7
1
作者
耿广耀
袁耀华
+5 位作者
刘群秀
李波
王爱善
毕延台
徐艳春
杨淑慧
《野生动物学报》
北大核心
2015年第2期206-210,共5页
非洲企鹅(Spheniscus demersus)是一种濒危海鸟,也是动物园展出的重要物种。上海动物园从日本和荷兰引进非洲企鹅,种群不断扩大,并成为国内种群发展的基础。但对其遗传多样性和结构了解很少,无法开展有效的遗传管理。本研究分析了上...
非洲企鹅(Spheniscus demersus)是一种濒危海鸟,也是动物园展出的重要物种。上海动物园从日本和荷兰引进非洲企鹅,种群不断扩大,并成为国内种群发展的基础。但对其遗传多样性和结构了解很少,无法开展有效的遗传管理。本研究分析了上海动物园39只非洲企鹅的mtDNA D-loop区430 bp序列,并与已发表的日本种群的数据进行比较。结果表明,该片段存在15个变异位点,占分析位点的3.5%;共定义了10个单倍型,其遗传距离为0.002~0.019。日本种群包含A、B两个mtDNA D-loop单倍型世系,上海种群的10个单倍型均属于A世系,且与日本种群有5个共享单倍型,其遗传多样性水平略低于日本种群。上海种群可以进一步分为3个小的世系,但置信度偏低(54%~87%)。上述结果提示,上海种群相对于日本种群的A世系而言有较好涵盖度,但仍有必要进一步引进建群个体,尤其是含有B世系单倍型的个体。
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关键词
非洲企鹅
线粒体DNA
遗传多样性
世系
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职称材料
非洲企鹅微卫星DNA的筛选及其遗传多样性分析
被引量:
4
2
作者
袁耀华
耿广耀
+2 位作者
杨淑慧
马跃
徐艳春
《野生动物学报》
北大核心
2019年第3期664-669,共6页
利用阿德利企鹅、洪堡企鹅等28个微卫星引物扩增非洲企鹅DNA,其中17个引物无扩充产物,8个引物扩增产物表现为多态,3个表现为单态。8个多态引物在供试的46只非洲企鹅中共检测到34个等位基因,7个位点为高度多态基因座,1个位点为中度多态...
利用阿德利企鹅、洪堡企鹅等28个微卫星引物扩增非洲企鹅DNA,其中17个引物无扩充产物,8个引物扩增产物表现为多态,3个表现为单态。8个多态引物在供试的46只非洲企鹅中共检测到34个等位基因,7个位点为高度多态基因座,1个位点为中度多态基因座,2个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡。8个微卫星位点非亲累计排除率为0.998,累计个体识别力>99.99%。该研究显示该圈养种群有较高的遗传多样性,部分个体携带稀有基因,在以后种群管理中适当增加其繁殖机会,以期稀有基因得以保留。
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关键词
非洲企鹅
微卫星筛选
DNA遗传标记
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职称材料
题名
上海动物园非洲企鹅种群线粒体DNA序列分析及遗传管理建议
被引量:
7
1
作者
耿广耀
袁耀华
刘群秀
李波
王爱善
毕延台
徐艳春
杨淑慧
机构
东北林业大学
上海动物园
国家林业局野生动植物检测中心
大连森林动物园
出处
《野生动物学报》
北大核心
2015年第2期206-210,共5页
基金
上海市绿化和市容管理项目(No.F120407)
中央高校基本科研业务费项目(2013)资助
文摘
非洲企鹅(Spheniscus demersus)是一种濒危海鸟,也是动物园展出的重要物种。上海动物园从日本和荷兰引进非洲企鹅,种群不断扩大,并成为国内种群发展的基础。但对其遗传多样性和结构了解很少,无法开展有效的遗传管理。本研究分析了上海动物园39只非洲企鹅的mtDNA D-loop区430 bp序列,并与已发表的日本种群的数据进行比较。结果表明,该片段存在15个变异位点,占分析位点的3.5%;共定义了10个单倍型,其遗传距离为0.002~0.019。日本种群包含A、B两个mtDNA D-loop单倍型世系,上海种群的10个单倍型均属于A世系,且与日本种群有5个共享单倍型,其遗传多样性水平略低于日本种群。上海种群可以进一步分为3个小的世系,但置信度偏低(54%~87%)。上述结果提示,上海种群相对于日本种群的A世系而言有较好涵盖度,但仍有必要进一步引进建群个体,尤其是含有B世系单倍型的个体。
关键词
非洲企鹅
线粒体DNA
遗传多样性
世系
Keywords
African penguin
Spheniscus demersus
Mitochondrial DNA
Genetic diversity
Lineage
分类号
S858.9 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
非洲企鹅微卫星DNA的筛选及其遗传多样性分析
被引量:
4
2
作者
袁耀华
耿广耀
杨淑慧
马跃
徐艳春
机构
上海动物园
东北林业大学野生动物资源学院
出处
《野生动物学报》
北大核心
2019年第3期664-669,共6页
基金
圈养斑嘴环企鹅的保护遗传学及种群管理策略研究(F120407)
文摘
利用阿德利企鹅、洪堡企鹅等28个微卫星引物扩增非洲企鹅DNA,其中17个引物无扩充产物,8个引物扩增产物表现为多态,3个表现为单态。8个多态引物在供试的46只非洲企鹅中共检测到34个等位基因,7个位点为高度多态基因座,1个位点为中度多态基因座,2个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡。8个微卫星位点非亲累计排除率为0.998,累计个体识别力>99.99%。该研究显示该圈养种群有较高的遗传多样性,部分个体携带稀有基因,在以后种群管理中适当增加其繁殖机会,以期稀有基因得以保留。
关键词
非洲企鹅
微卫星筛选
DNA遗传标记
Keywords
Spheniscus demersus
Microsatellite screening
DNA genetic markers
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
上海动物园非洲企鹅种群线粒体DNA序列分析及遗传管理建议
耿广耀
袁耀华
刘群秀
李波
王爱善
毕延台
徐艳春
杨淑慧
《野生动物学报》
北大核心
2015
7
下载PDF
职称材料
2
非洲企鹅微卫星DNA的筛选及其遗传多样性分析
袁耀华
耿广耀
杨淑慧
马跃
徐艳春
《野生动物学报》
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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