标准三联体非父排除率计算公式的推导和验证

目的对标准三联体亲子鉴定的非父排除率(PE)进行公式推导和实验验证。方法基于PE定义自行推导公式:PE=sum(P_i^2(1-P_i)~2)from i=1 to n+sum(P_iP_j(1-P_i)~3)from i<j to n+sum(P_iP_j(1-P_j)~3)from i<j to n+sum(P_iP_j(P_i+P_j)(1-P_i-P_j)~2)from i<j to n。将该公式与前人报道的5个公式(1)^(5)进行对比,计算AGCU EX20系统19个常染色体STR基因座的PE值。根据1 000例单亲样本和1 000个无关个体样本设计真实实验,计算PE真实实验值。以随机模拟法产生1 000万对模拟亲母子和1 000万个随机个体,设计模拟实验计算PE模拟实验值。在19个基因座,统计各基因座的等位基因频率之和(S),将PE的公式值、真实实验值和模拟实验值进行对比。结果当S=1时,公式(1)、(2)、(5)、(6)计算结果完全一致,且符合真实和模拟双重实验验证。当S≠1时,公式(1)、(2)、(5)、(6)计算结果有较小误差。公式(3)、(4)的计算结果有较大误差。结论本研究推导的公式(6)与经典公式(1)、(2)、(5)均可用于标准三联体亲子鉴定。S值对PE公式计算有一定影响。

DNA指纹技术鉴定尼罗罗非鱼各家系父本

为了对8个尼罗罗非鱼家系进行亲子鉴定，利用GM024、GM435、GM459、UNH719、UNH846、GM558六个微卫星标记设计引物并进行PCR扩增，在12％聚丙烯酰胺凝胶上电泳分型，应用cervus3．0软件统计分析。结果表明，各微卫星位点的等位基因数在4—12之间；观测杂合度在0．313—0．988之间，平均观测杂合度为0．696；期望杂合度在0．318～0．794之间，平均期望杂合度为0．638。平均多态信息含量为0．608。已知一亲本时，各个位点的非父排除率在0．301～0．818之间；双亲未知时，各位点的累计排除率在0．113—0．69之间。当已知一亲本时，6个位点的累积排除率达到了0．9962。当双亲都未知时，6个位点的累积排除率也达到了0．9674。所以利用这6个位卫星位点能够有效地确认尼罗罗非鱼各家系父本。

国人六个高变DNA位点的基因频率分布

使用6个单位点探针，用Southern印迹杂交技术研究了国人的D2S44，D17S79，D14S13，D14S1，DXYS14及D18S27等位点的基因频率分布。发现它们的DNA指纹图均具高度多态性，等位基因数27～107个。非父排除率（EPP）分别为0．8407、0．7691、0．9792、0．9040、0．9400及0．8177，累积非父排除率为0．99999；个人识别能力（DP）分别为0.9880、0.9766，0.9996，0.9961，0.9973及0．9338，累积个人识别能力接近1，故可作为亲子鉴定及个人识别非常有力的工具。此外还对单位点探针的优缺点进行了讨论。

复合扩增9个STR位点在亲子鉴定中的应用评估

在法医学亲子鉴定中应用复合扩增及四色荧光自动分析技术检测 Profiler plusTM9个 STR位点，一次性获得的信息量大，累计非父排除率达 0.9999。应用于 268例亲子鉴定的结果表明， 9个具有高度多态性 STR基因座的联合检测，能使三联体亲子鉴定的排除结论明确无误。对不排除案例，其 RCP值均可达国际认定标准。对二联体亲子鉴定一般需增加 CofilerTM试剂盒 4个 STR位点检测。

17个Y-STR基因座在亲子鉴定中的应用研究

本研究探讨AmpFlSTR YfilerTM复合扩增系统中的17个Y-STR基因座在法医学亲子鉴定案检实际工作中的非父排除能力,以及在中国人群中的基因突变情况。采用业已经Reliagene Y-PLEXTM6和本实验室建立的"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"检测的36对非父子和84对真父子,用YfilerTM试剂盒进行PCR复合扩增,PCR产物用ABI3100基因测序仪基因扫描方法检测和分析;统计每一非父子对中排除亲子关系的Y-STR基因座的个数,观察真父子对中Y-STR基因座基因突变情况;并与以往采用Reliagene Y-PLEXTM6系统和"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"的检测结果进行对比。结果表明:YfilerTM系统检测36对非父子,其中1对非父子不能排除,其余35对均有3个以上Y-STR基因座可以排除亲子关系;有3个以上Y-STR排除的非父子对占97.22%(35/36),高于Y-PLEXTM6系统的92.11%(35/38)和"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"的91.67%(33/36);除1例Y-STR不能排除的非父子对外,其余的35对平均每一非父子对有11.3个Y-STR基因座可以排除亲子关系。YfilerTM系统检测84对真父子,观察到DYS437、DYS439、DYS635、DYS389Ⅱ和DYS19等5个基因座各出现1次基因突变事件,均表现为相差1个核心序列,每一基因座每次减数分裂的平均突变率为3.50×10-3;Y-STR基因突变案例占检测案例的5.95%(5/84),高于Y-PLEXTM6系统的2.15%(2/93)和"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"(0/84)。结论:YfilerTM系统检测的Y-STR基因座较多,在亲子鉴定实践中具有较高的非父排除能力,但该系统的基因突变问题不容忽视。

31个SNP位点多重PCR扩增和芯片分型技术的建立及其法医学应用

目的对SNP基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据SNP不同等位基因的序列设计探针,制成分型芯片。采用4个复合PCR体系,用末端标记了Cy5的引物进行复合PCR扩增,产物与寡核苷酸探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在各SNP位点的基因型。将这一方法应用于109份样本的分型,根据基因型分布统计分析31个SNP位点的法医学应用价值。同时,进行家系调查和方法灵敏度分析。结果方法的灵敏度为1ng;所检测的31个SNP位点的累积个体识别率为0.9999999999979(偶合率为2.13×10-12),二联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9609,三联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9970。家系调查的结果表明,这些位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律。结论上述31个SNP位点为中高信息量位点,适用于法医学个体识别,可作为当前STR系统的补充。

单亲亲子鉴定的分析研究

目的从理论和实际应用方面客观评价13～15个STR位点应用于单亲亲子鉴定的准确性。方法依据中国人群基因频率资料,计算单亲亲子鉴定的非父排除率及单亲亲子鉴定的亲子关系概率,并选择有明确排除结论的104例排除案例,分析统计其中父-子二联体出现的排除指标数。结果对于单亲亲子鉴定,选用13～15个STR位点,联合非父排除率为0.9805～0.9906;亲子关系概率均大于99.73%。104例二联体排除案例中,有3例的排除指标数小于2,未发现排除指标为零的现象。结论若应用ProfilerPlus和CofilerPlus试剂盒的13个STR位点进行日常单亲亲子鉴定工作,存在微弱漏判非父的风险,必要时增加检测指标数。不排除案例的单亲亲子鉴定,其亲子概率均可达国际认定标准。

人血清类粘蛋白的研究进展

随着法医血清学和人类遗传学研究的不断深入,一些新的人类血液遗传标记已被国外学者报道。人类血清类粘蛋白(Orosomucoid,简称ORM)就是其中之一。由于ORM表型频率在大多数人群中分布较好,具有较高的个人识别机率和非父排除率,因此,ORM是法医血清学一个很有应用前途的遗传标记。

广东汉族人群D7S1517等12个STR基因座的遗传多态性

目的调查广东汉族人群12个短串联重复序列(STR)基因座(D7S1517、D3S1744、D12S391、D2S1360、D6S474、D4S2366、D8S1132、D5S2500、D18S51、D21S2055、D10S2325、SE33)的遗传多态性。方法采用德国Qiagen公司的HD-plex试剂盒复合扩增181个广东汉族个体的12个STR基因座。扩增产物经美国ABI公司的3100型遗传分析仪电泳分析其基因型,在各基因座均符合Hardy-Weinberg平衡的基础上计算其遗传学参数:基因频率、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、个体识别能力(DP)和非父排除率(PE)。

广东汉族人群D22S1045、D1S1656、D2S441和D10S1248基因座的遗传多态性分析

目的调查广东汉族人群D22S1045、D1S1656、D2S441和D10S1248等4个短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性。方法采用德国Qiagen公司的Hexaplex ESS试剂盒复合扩增169个广东汉族个体的4个STR基因座。扩增产物经美国ABI公司的3100遗传分析仪电泳分析其基因型,在各基因座均符合Hardy-Weinberg平衡的基础上计算其遗传学参数:基因频率、杂合度(H)、多态信息含量(P1C)、个体识别能力(PD)和非父排除率(PE)。结果169名无关个体4个STR基因座中共检出40个等位基因,4个基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P】0.05),

太原地区汉族人群Tf亚型分布调查

本文采用超薄层等电聚焦电泳方法对太原地区汉族人群进行Tf亚型分型,结果表明:该地人群基因频率为:TfC^1=0.7561,TfC^2=0.2244,TfD=0.0171。非父排除率与个体识别率分别为0.1650和0.5579,属高鉴别类多态系统。本文与其他作者的调查结果进行比较,发现本地区人群Tf亚型分布与高加索人及黑人有显著性差异。

双色荧光技术检测精子表面HLA-AB单倍型

HLA(人类淋巴细胞抗原)广泛地分布于人体内众多种类有核细胞表面及分泌液中.该系统的遗传多态性日益受到医学,遗传学,特别是法医学的重视。在法医学亲子鉴定中,由于 HLA 系统有极高的非父排除率(其值几接近于其它已知的24个血型系统的累积排除率)。

超薄层等电聚焦电泳检测红细胞PGM_1亚型

我们采用超薄层聚丙烯酰胺凝胶等电聚焦（UTL PAGIEF）电泳技术检测了红细胞PGM1亚型,并对郑州地区356例汉族无关健康个体进行了PGM1亚型分析。现将结果报告如下: 表1为郑州地区356例无关健康个体的PGM1亚型分布。按Hardy-Weinberg平衡定律进行吻合度检验,x2=4.3154;df=6;0.50【p【0.75。

朱琳:亲子鉴定乱象必须遏制

＂很多当事人不愿意露面,直接把样本寄过去。有的是孕妇拿着男子血液标本或者偷偷拔掉男方几根带毛囊的头发独自送去。男女双方一起来的不多,如果双方都在场,常常有一方情绪不稳定。还有一部分未婚准妈妈也来做鉴定,想追查胎儿父亲是谁的人更多。＂从医数十年的省政协委员朱琳对当前亲子鉴定乱象娓娓道来。

成都汉族群体15个短串联重复序列基因座遗传多态性

目的 获得15个短串联重复(short tandem repeat,STR)基因座在成都汉族群体的群体遗传学数据。方法 2 10份EDTA抗凝血样采自成都地区无血缘关系的汉族个体。Chelex法提取DNA,PCR复合扩增,自动基因分析仪电泳收集电泳结果数据,基因扫描分析软件计算扩增产物片段相对大小,基因分型软件进行样本基因型分型。结果 全部样本的每个STR基因座都获得了清晰的基因型分型结果。15个STR基因座的杂合度介于0 .5 2 9～0 .881之间。累计非父排除率和累计个人识别机率为0 .999998和7.3×10 - 1 7。结论 经一次扩增电泳可获得15个STR基因座的基因型分型结果并明确样本性别。累计非父排除率和累计个人识别机率较高,适用于法医学亲权鉴定和个人识别。

STR-typer 10G/F试剂在单亲鉴定中的应用

目的观察和分析STR-typer 10G/F试剂盒在单亲鉴定中的作用。方法随机抽样湖北地区汉族个体206人静脉血样,Chelex-100法提取基因组DNA。采用STR-typer 10G/F试剂盒进行复合扩增,分型并计数基因型并计算基因频率、基因座杂合度(H)、标准三联体非父排除率(PE3)和二联体非父排除率(PE2)。结果 9个STR基因座等位基因数9～14个,基因型分布观察值与Hardy-Weinberg平衡理论值的差异均无显著性(P>0.05),杂合度在0.75以上,平均非父排除率0.57～0.75;STR-typer 10G/F试剂盒累积非父排除率(PE3)0.999 973,合并使用Identifiler Plus系统,累积非父排除率可达0.999 999 967 6。结论 STR-typer 10G/F系统多态性程度基本接近Identifiler Plus系统,在单亲鉴定时,可作为Identifiler试剂盒的有效补充。

中国蒙古族群体六个短串联重复序列位点的遗传多态性

目的 研究6个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)位点(VWA、FGA、PENTAE、D6 S10 4 3、D2 S1772、D7S30 4 8)在内蒙古农区蒙古族人群中的基因型及等位片段频率分布,获得相应位点的群体遗传学数据。方法 采用PCR扩增技术及聚丙烯酰胺凝胶电泳方法,对2 93名蒙族个体的6个STR位点的等位基因频率进行了分析。结果 共检出80种等位基因,335种基因型,基因频率分布在0 .0 0 17～0 .2 82 8之间。6个STR位点基因型分布均符合Hardy- Weinberg平衡(P>0 .0 5 ) ,杂合度大于0 .794 5 ,个人识别能力大于0 .916 0 ,非父排除率大于0 .5 919,多态信息含量大于0 .76 17。结论 研究结果对人类群体遗传学及法医学研究具有重要价值,对建立蒙古族民族基因库和进一步研究群体的遗传变异具有重要意义。

中国法医生物学的现状及进展

中国法医生物学的现状及进展吴梅筠随着免疫学、免疫血液学、遗传学、生物化学及分子生物学等边缘学科的进展以及新技术与新方法的建立，１９８０年后中国法医生物学迅猛发展，已由血型血清学检验到细胞杂交、ＤＮＡ分子杂交，分子克隆；由常量检测到极微量检测；由否定到...