非优异SSR原因分析及解决方案

SSR标记在真实性检测、纯度鉴定、以及指纹库构建中起着至关重要的作用。在其筛选过程中会遇到许多具有N+1峰等异常峰型、非特异性峰、多态性低、不适于软件自动分析等非优异SSR引物。为了解并掌握非优异SSR引物表现以及形成原因,本研究以22份初筛材料、27套三联体材料及95份自交系对新型SSR引物进行评估筛选,从中选取有代表性的11对SSR引物,现在已对10种非优异SSR引物表现进行描述,分析形成原因,通过测序对一对引物进行重新设计,并获得较好效果。