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牡丹非特异性脂质转移蛋白基因PsLTP的生物信息学分析
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作者 问荣荣 苏钰 +3 位作者 高泽芳 徐梦宇 何雯雯 王步勇 《安徽农业科学》 CAS 2024年第2期87-92,共6页
[目的]了解牡丹非特异性脂质转移蛋白基因LTP的基因特征及其编码蛋白的生物学特性,探索其生物功能。[方法]运用Blast、ORF-Finder、ProtParam、SignalP 4.1、ProtScale和TMHMM 2.0 Server等生物信息学软件,分析牡丹nsLTP基因序列及其编... [目的]了解牡丹非特异性脂质转移蛋白基因LTP的基因特征及其编码蛋白的生物学特性,探索其生物功能。[方法]运用Blast、ORF-Finder、ProtParam、SignalP 4.1、ProtScale和TMHMM 2.0 Server等生物信息学软件,分析牡丹nsLTP基因序列及其编码蛋白的基本理化性质、信号肽、磷酸化位点、保守结构域等,并运用DANMAN、MEGA软件进行多序列比对和系统发育树构建。[结果]牡丹nsLTP基因(NCBI登录号为:JZ840269.1)序列全长为685 bp,开放阅读框长为354 bp,编码蛋白包含117个氨基酸,理论等电点为8.93,为不稳定性蛋白。牡丹nsLTP蛋白为疏水性蛋白,含有信号肽但不含跨膜结构域,NetPho Server预测其含有8个丝氨酸和3个酪氨酸磷酸化位点及5个苏氨酸磷酸化位点。PsnsLTP蛋白具有植物LTP蛋白典型结构,即4个α-螺旋,4对二硫键,1个可结合和容纳脂质分子的疏水结构。多序列比对及系统发育树分析显示,PsLTP蛋白与绒毛烟草LTP蛋白(XP_009608993.1)的相识度62.7%,且进化树聚为同一小分支,遗传距离较近。[结论]通过对牡丹nsLTP基因特性及蛋白结构研究,系统性研究了牡丹nsLTP基因的生物信息学特性,为牡丹抗病抗逆功能基因的研究提供了依据,也为其他植物nsLTP基因研究提供了参考。 展开更多
关键词 牡丹 非特异性脂质转移蛋白基因LTP 蛋白结构 生物信息学
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烟草非特异性脂质转移蛋白基因的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 金大伟 杨军 +6 位作者 李锋 王燃 罗朝鹏 武明珠 魏攀 侯明生 林福呈 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第1期12-20,共9页
为了阐明非特异性脂质转移蛋白基因Nt LTP1.1在烟草抗病抗逆反应中的功能,用c DNA末端快速扩增技术(Rapid-amplification of c DNA ends,RACE)从普通烟草中克隆了该基因全长,并通过生物信息学方法分析了c DNA序列结构、蛋白理化性质、... 为了阐明非特异性脂质转移蛋白基因Nt LTP1.1在烟草抗病抗逆反应中的功能,用c DNA末端快速扩增技术(Rapid-amplification of c DNA ends,RACE)从普通烟草中克隆了该基因全长,并通过生物信息学方法分析了c DNA序列结构、蛋白理化性质、保守基序、三级结构以及系统进化关系;利用q RT-PCR检测了该基因在不同组织中的表达模式以及胁迫条件下的表达差异。结果表明:Nt LTP1.1基因全长615 bp,编码蛋白含有129个氨基酸,为一种小分子碱性可溶性蛋白。蛋白序列N端含有信号肽,预测其可能定位于分泌途径中。Blast比对结果显示,烟草非特异性脂质转移蛋白与番茄ns LTP1序列相似性最高,含有8CM保守基序(8个半胱氨酸残基组成的保守基序)。蛋白三级结构预测表明,Nt LTP1.1具有ns LTP典型的三级结构,包括4个α-螺旋,4对二硫键,1个可结合和容纳脂质分子的疏水腔。多重比对结果显示,Nt LTP1.1 8CM结构域模式为C1-X9-C2-X13-C3C4-X19-C5XC6-X22-C7-X13-C8。系统进化分析结果表明,ns LTP进化形成5类,Nt LTP1.1属于Type I。表达模式分析显示,Nt LTP1.1基因主要在烟草叶片中表达,具有明显的组织表达特异性。在低温胁迫条件下表达受到抑制,在水杨酸诱导条件下表达上调。因此,推测Nt LTP1.1基因可能在烟草防御反应中发挥作用。 展开更多
关键词 烟草 非特异性脂质转移蛋白基因 克隆 表达分析 生物信息学
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薰衣草非特异性脂质转移蛋白基因nsLTP2-1和nsLTP2-2的克隆与功能分析
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作者 张夏夏 陈凌娜 +2 位作者 杨扬 赵旌汝 陈永坤 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期834-843,共10页
非特异性脂质转移蛋白(nsLTP,non-specific lipid transfer proteins)在植物脂质转运和分泌中发挥重要作用。本研究从薰衣草(Lavandula angustifolia)中克隆到2个II型nsLTP基因,命名为nsLTP2-1和nsLTP2-2,并对其进行功能分析。生信分析... 非特异性脂质转移蛋白(nsLTP,non-specific lipid transfer proteins)在植物脂质转运和分泌中发挥重要作用。本研究从薰衣草(Lavandula angustifolia)中克隆到2个II型nsLTP基因,命名为nsLTP2-1和nsLTP2-2,并对其进行功能分析。生信分析表明,nsLTP2-1和ns LTP2-2分别编码119个和117个氨基酸,具有脂转移蛋白(LTP,lipid transfer proteins)保守结构域和8个高度保守的半胱氨酸残基;系统进化分析显示它们处于两个分支,与同科的紫苏(Perilla frutescens)相似性最高。基因表达分析显示2个基因均在花蕾中高表达,在叶片、茎和花瓣中几乎不表达,在花萼中的表达存在差异,nsLTP2-1和nsLTP2-2分别在成熟花萼和幼嫩花萼中表达量更高;2个基因在花蕾和叶片中的表达均受到强光诱导,且在花蕾中的表达均受脱落酸诱导,而叶片中nsLTP2-1和nsLTP2-2的表达分别受茉莉酸甲酯和乙烯诱导。亚细胞定位显示2个nsLTPs均定位在细胞膜和细胞壁上,可能与次生代谢物的转运有关。过表达nsLTP2-1和nsLTP2-2烟草叶片经尼罗红染色后,经485~543 nm激发光激发,叶片腺毛头部的荧光显示多于野生型,说明本研究中的nsLTPs可能在脂类的合成和转运中起重要作用。这些结果为明确薰衣草脂转移蛋白在脂类及萜类转运中的功能研究提供了参考。 展开更多
关键词 薰衣草 非特异性转移蛋白 激素处理 非生物胁迫 基因表达 亚细胞定位 尼罗红染色
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马铃薯非特异性脂质转移蛋白基因StLTPa1的克隆和表达 被引量:12
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作者 郜刚 任彩虹 +2 位作者 金黎平 谢开云 屈冬玉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1510-1517,共8页
非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有多种生物学功能,如抗菌防御、信号传导、胞壁松弛、蛋白酶抑制等。通过接种青枯菌(Ralstonia solanacearum),从马铃薯栽培品种中薯3号中获得一个新的非特异性脂... 非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有多种生物学功能,如抗菌防御、信号传导、胞壁松弛、蛋白酶抑制等。通过接种青枯菌(Ralstonia solanacearum),从马铃薯栽培品种中薯3号中获得一个新的非特异性脂质转移蛋白cDNA克隆StLTPa1,序列分析表明该基因含636bp核苷酸,编码91个氨基酸,属于I类非特异性脂质转移蛋白。基于氨基酸序列构建的系统发生树揭示,该基因与其他茄科nsLTP具有高度保守的序列相似性,核酸和氨基酸水平分别具75%~85%和60%~92%的同源性。对该基因在互作早期基因表达时空性分析表明,StLTPa1基因不仅受病菌的诱导,在不同抗、感病的马铃薯基因型中差异表达,而且受一定浓度外源非生物激发子如水杨酸、茉莉酸和脱落酸的诱导并产生一定时间的持续效应,其诱导表达模式也表现出一定的差异。原位杂交结果显示StLTPa1主要在马铃薯茎、叶维管束系统的韧皮部细胞中表达。这些结果说明StLTPa1基因受病菌和非生物激发子诱导,在植物防御反应中发挥作用。 展开更多
关键词 马铃薯 非特异性转移蛋白 StLTPa1 克隆 表达
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西伯利亚蓼非特异性脂质转移蛋白基因PsnsLTP的功能分析 被引量:2
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作者 李蔚 曲春浦 +2 位作者 许志茹 刘春 刘关君 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期547-553,共7页
通过在农杆菌介导下,利用西伯利亚蓼非特异性脂质转移蛋白基因(植物表达载体:pROKII-PsnsLTP)对烟草进行遗传转化,经卡那霉素抗性分化筛选及PCR鉴定,获得6个转基因烟草株系。接种烟草炭疽病病菌和猝倒病病菌后观察转基因植株和野生型的... 通过在农杆菌介导下,利用西伯利亚蓼非特异性脂质转移蛋白基因(植物表达载体:pROKII-PsnsLTP)对烟草进行遗传转化,经卡那霉素抗性分化筛选及PCR鉴定,获得6个转基因烟草株系。接种烟草炭疽病病菌和猝倒病病菌后观察转基因植株和野生型的表型差异,在Na Cl、Cd Cl2、7.5%PEG6000的胁迫下进行表型观察和生理指标的测定。结果显示:与野生型烟草相比,T1代转基因植株已具有较强的耐烟草炭疽病和猝倒病的能力;其超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性显著增强,丙二醛(MAD)含量显著降低,且幼苗具有较好的生长性状。由此证明,西伯利亚蓼非特异性脂质转移蛋白PsnsLTP增加了转基因烟草抵御生物胁迫和非生物胁迫的能力,这些工作为深入研究PsnsLTP基因的抗逆机制提供了参考。 展开更多
关键词 西伯利亚蓼 非特异性转移蛋白 基因烟草 生物胁迫 非生物胁迫
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黄瓜非特异性脂质转移蛋白基因的序列分析及细菌性角斑病菌浸染下的表达 被引量:2
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作者 孟令波 刘关君 +2 位作者 李淑敏 徐丹丹 秦智伟 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期55-60,共6页
非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有抗菌防御功能。分析黄瓜非特异性脂质转运蛋白基因nsLTP的序列特征及其在细菌性角斑病菌浸染过程中的表达模式,对其应用于黄瓜等农作物转基因工程,增强作物抗病... 非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有抗菌防御功能。分析黄瓜非特异性脂质转运蛋白基因nsLTP的序列特征及其在细菌性角斑病菌浸染过程中的表达模式,对其应用于黄瓜等农作物转基因工程,增强作物抗病性具有重要意义。在黄瓜叶cDNA文库中,获得非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)cDNA序列,命名为CsnsLTP;该基因全长566 bp,编码121个氨基酸残基;序列分析表明,该基因具有N端信号肽,具有nsLTP家族共有的典型保守区域,属nsLTP家族基因。实时荧光定量PCR分析表明,CsnsLTP在黄瓜叶中有表达。在黄瓜细菌性角斑病菌浸染下,该基因在黄瓜叶中表达增高,并随浸染时间的延长而增强,明显受黄瓜细菌性角斑病菌的诱导,推测该基因在抵御黄瓜细菌性角斑病菌浸染时具有重要作用。 展开更多
关键词 黄瓜 非特异性转移蛋白 细菌性角斑病 序列分析 实时荧光定量PCR
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甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆与表达分析(英文) 被引量:1
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作者 李雪丹 魏昌赫 +3 位作者 邵欢欢 吴燕 张义正 王海燕 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期583-592,共10页
非特异脂质转移蛋白(ns LTP)是植物界普遍存在的一类涉及多种胁迫反应的可溶性蛋白。为了阐明甘薯中非特异性脂质转移蛋白基因IbLTP1和IbLTP2在盐胁迫反应中的功能,本研究运用PCR技术,对IbLTP1和IbLTP2基因进行了克隆,并通过生物信息学... 非特异脂质转移蛋白(ns LTP)是植物界普遍存在的一类涉及多种胁迫反应的可溶性蛋白。为了阐明甘薯中非特异性脂质转移蛋白基因IbLTP1和IbLTP2在盐胁迫反应中的功能,本研究运用PCR技术,对IbLTP1和IbLTP2基因进行了克隆,并通过生物信息学方法分析了序列结构、蛋白质保守结构域和系统进化关系;利用q RT-PCR方法检测了这两个基因在不同组织中的表达模式以及盐胁迫条件下的表达差异;将IbLTP1和IbLTP2基因克隆到大肠杆菌的原核表达载体p ET32a中,对重组菌BL21(p ET32a-LTP)的耐盐性进行分析。序列分析表明:IbLTP1和IbLTP2编码区均不含内含子并都具有等位基因。IbLTP1和IbLTP2基因的蛋白质序列分别包括114和94个氨基酸残基并且不含色氨酸残基,蛋白序列N端含有信号肽序列。保守结构域和系统进化分析结果表明:IbLTP1和IbLTP2均含有ns LTP蛋白的保守结构域,IbLTP1属于TypeⅠ而IbLTP2属于TypeⅡ。实时荧光定量PCR分析表明:IbLTP1在幼叶中表达量最高,根中表达量最低;而IbLTP2在茎中表达量最高,成熟叶中表达量最低。在Na Cl胁迫条件下,IbLTP1和IbLTP2表达量在根中基本无变化而在茎和叶中上调。大肠杆菌BL21(DE3)中异源表达IbLTP1和IbLTP2基因能够提高转基因菌株对Na Cl的耐受性。因此,本研究推测IbLTP1和IbLTP2基因可能在甘薯盐胁迫反应中发挥了作用。 展开更多
关键词 甘薯 非特异性转移蛋白 氯化钠胁迫 基因克隆 基因表达 实时荧光定量PCR
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辣椒非特异性脂质转移蛋白基因CaLTP1的克隆及表达分析
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作者 冯冬林 赖燕 何水林 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第10期1784-1788,共5页
非特异性脂质转移蛋白(nsLTPs)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有多种生物学功能。从辣椒cDNA文库中筛选得到1个nsLTPs基因,命名为CaLTP1;序列分析结果表明:该基因全长cDNA序列为1 211 bp,推测编码1个包含129个氨基酸残基的前... 非特异性脂质转移蛋白(nsLTPs)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有多种生物学功能。从辣椒cDNA文库中筛选得到1个nsLTPs基因,命名为CaLTP1;序列分析结果表明:该基因全长cDNA序列为1 211 bp,推测编码1个包含129个氨基酸残基的前体蛋白。CaLTP1蛋白含有典型的脂质转移蛋白N-端信号肽,保守的AAI结构域和半胱氨酸位点。预测CaLTP1蛋白含有多种功能位点,包括3个CK2磷酸化位点,3个N-豆蔻酰化位点和1个PKC磷酸化位点。实时荧光定量分析组织特异性表达模式表明,CaLTP1在辣椒茎、叶、花中表达量升高。 展开更多
关键词 辣椒 转移蛋白(nsLTPs) 表达
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脂质转移蛋白SiLTP1基因参与谷子耐盐响应初探
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作者 孟凡花 刘敏 +1 位作者 沈傲 刘炜 《作物学报》 CAS 北大核心 2025年第1期58-67,共10页
土壤盐渍化严重制约农业生产发展,通过提高植物耐盐性进行盐碱地综合利用,对于保障粮食安全,提升农业生产效率具有重要意义。脂质转移蛋白是一类在高等植物中广泛存在的小分子蛋白质,能够参与植株生长、信号转导以及多种生物和非生物胁... 土壤盐渍化严重制约农业生产发展,通过提高植物耐盐性进行盐碱地综合利用,对于保障粮食安全,提升农业生产效率具有重要意义。脂质转移蛋白是一类在高等植物中广泛存在的小分子蛋白质,能够参与植株生长、信号转导以及多种生物和非生物胁迫过程。前期本课题组克隆到一个谷子中编码脂质转移蛋白的基因SiLTP1,本研究通过构建其原核表达载体和植物双元过表达载体,获得了该基因的原核表达蛋白及同源转化过表达阳性植株,经进一步筛选获得4个纯合株系。体外耐盐性试验显示, SiLTP1的原核表达蛋白具有一定耐盐性;转基因植株苗期耐盐生理指标测定显示,SiLTP1过表达植株在遭受盐胁迫时,植株体内MDA积累减少,抗氧化酶含量升高,可积累更少的过氧化氢,从而降低胁迫对植株的氧化损伤,显示基因过表达植株具有更好的耐盐性。本研究结果初步揭示, SiLTP1可正向调控谷子的耐盐性,其在谷子耐盐抗逆方面具有潜在功能,为耐盐谷子品种改良及新品种培育提供了理论基础和候选基因资源。 展开更多
关键词 转移蛋白 SiLTP1 盐胁迫 谷子 耐盐响应
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丹参非特异性脂质转移蛋白基因(SmLTP1)的克隆及其表达分析 被引量:7
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作者 刘梅 生华 +2 位作者 化文平 储君 王喆之 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期63-68,共6页
对丹参EST序列进行Blast分析,获得一个新的非特异性脂质转移蛋白基因,命名为SmLTP1(GenBank注册号为EF187461)。该基因cDNA全长593bp,包含一个长为357bp的开放读码框,编码118个氨基酸。生物信息学结构分析表明,该蛋白具有植物nsLTP的典... 对丹参EST序列进行Blast分析,获得一个新的非特异性脂质转移蛋白基因,命名为SmLTP1(GenBank注册号为EF187461)。该基因cDNA全长593bp,包含一个长为357bp的开放读码框,编码118个氨基酸。生物信息学结构分析表明,该蛋白具有植物nsLTP的典型结构,即4对二硫键,4个α-螺旋,1个可结合和容纳脂肪酸分子的类似口袋状的疏水结构。实时荧光定量PCR分析结果表明,SmLTP1基因在丹参不同组织器官中差异表达,其表达受病原菌和茉莉酸甲酯的诱导,显示SmLTP1基因在植物防御反应中发挥作用。 展开更多
关键词 丹参 非特异性转移蛋白 基因克隆 生物信息学分析 实时荧光定量PCR
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非特异性脂质转移蛋白突变体的构建及在两种硫氧还蛋白表达载体中的表达比较 被引量:5
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作者 葛晓春 陈继超 +2 位作者 王文漪 曹凯鸣 孙崇荣 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期167-171,共5页
对水稻非特异性脂质转移蛋白 (Nospecificlipidtransferprotein ,nsLTP)LTP110中结构重要的 5个氨基酸位点进行了定点突变 ,测序结果证实了突变体构建成功。在尝试了多种大肠杆菌表达系统进行表达之后 ,发现硫氧还蛋白融合表达载体适合... 对水稻非特异性脂质转移蛋白 (Nospecificlipidtransferprotein ,nsLTP)LTP110中结构重要的 5个氨基酸位点进行了定点突变 ,测序结果证实了突变体构建成功。在尝试了多种大肠杆菌表达系统进行表达之后 ,发现硫氧还蛋白融合表达载体适合于LTP110野生型及突变体的表达。将编码野生型LTP110及突变体Y17A ,P72L ,R46A ,D45A ,C5 0A蛋白的cDNA顺序克隆进两种硫氧还蛋白表达载体并对其表达情况进行了比较 :pTrxFus载体可以在宿主菌GI72 4中以较低水平表达野生型LTP110及突变体Y17A ,P72L ,R46A融合蛋白 ,但不能表达D45A和C5 0A融合蛋白 ;pET32a(+)载体可以在宿主菌BL2 1(DE3)trxB- 中以可溶蛋白的形式表达野生型及所有突变型融合蛋白 ,且表达量比在pTrxFus载体 GI72 4突主菌中表达量高。对pET32a(+)载体中表达的LTP110融合蛋白进行了纯化 ,并利用带有荧光标记的脂肪酸分子对其测活 。 展开更多
关键词 NSLTP 定点突变 硫氧还蛋白 融合表达载体 荧光标记 非特异性转移蛋白 突变体 植物
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西伯利亚蓼非特异性脂质转移蛋白编码序列的克隆及其盐胁迫下的表达 被引量:3
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作者 刘关君 田旭 +3 位作者 刘昌财 曲春浦 刘桂丰 杨传平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1140-1145,共6页
根据西伯利亚蓼地下茎抑制消减文库(SSH)中获得的非特异性脂质转移蛋白(non-specific lipid transfer protein,nsLTP)EST序列,应用RACE技术克隆了具有PolyA的全长cDNA序列.该序列全长604bp,其5′非翻译区65bp,3′非翻译区227bp,开放阅... 根据西伯利亚蓼地下茎抑制消减文库(SSH)中获得的非特异性脂质转移蛋白(non-specific lipid transfer protein,nsLTP)EST序列,应用RACE技术克隆了具有PolyA的全长cDNA序列.该序列全长604bp,其5′非翻译区65bp,3′非翻译区227bp,开放阅读框编码103个氨基酸残基;序列分析表明,该基因具有N端信号肽,具有nsLTP家族共有的典型保守区域,属nsLTP家族基因,命名为PsnsLTPs;荧光定量PCR分析表明,PsnsLTPs在西伯利亚蓼叶、茎、地下茎中均有表达.在3%NaHCO3诱导表达下,该基因在地下茎中表达明显受盐胁迫的诱导,推测该基因在抵御盐胁迫时具有重要作用. 展开更多
关键词 西伯利亚蓼 非特异性转移蛋白 盐胁迫 基因克隆 实时定量PCR
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钙调素对钙调素结合蛋白-10和玉米非特异性脂转移蛋白与脂质结合活性的影响 被引量:6
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作者 谢万钦 赵立青 +3 位作者 白文艳 李振鹏 赵玉龙 李翠凤 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期679-684,共6页
荧光标记的脂质结合实验表明,钙调素结合蛋白-10(CaMBP-10)具有典型的植物非特异性脂质转移蛋白与脂质结合的特性。进一步实验研究了钙调素(calmodulin,CaM)对CaMBP-10和玉米nsLTP与脂质结合的活性的影响,结果显示无论在有钙和无钙条件... 荧光标记的脂质结合实验表明,钙调素结合蛋白-10(CaMBP-10)具有典型的植物非特异性脂质转移蛋白与脂质结合的特性。进一步实验研究了钙调素(calmodulin,CaM)对CaMBP-10和玉米nsLTP与脂质结合的活性的影响,结果显示无论在有钙和无钙条件下,CaM对两者的影响均有不同之处,W-7和TFP能消除CaM的影响。提示CaM不仅与CaMBP-10和玉米nsLTP特异性相互作用,而且对2种脂转移蛋白可能具有不同的调节机制。 展开更多
关键词 钙调素 转移蛋白 钙调素结合蛋白-10 结合活性
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水稻黄化苗中2种脂质转移蛋白基因表达的比较研究 被引量:2
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作者 葛晓春 刘晓斐 +3 位作者 詹树萱 张江立 孙崇荣 曹凯鸣 《自然科学进展(国家重点实验室通讯)》 1999年第5期413-418,共6页
从水稻(Oryza satiua)“广陆矮4号”黄化苗cDNA文库中筛选到2种可能编码脂质转移蛋白(LTP)的cDNA克隆,将它们对应的基因命名为LTP110和LTP114.在完成2种cDNA全顺序测定的基础上,对它们的核苷酸顺序及推断的蛋白质一级结构进行了比较分析... 从水稻(Oryza satiua)“广陆矮4号”黄化苗cDNA文库中筛选到2种可能编码脂质转移蛋白(LTP)的cDNA克隆,将它们对应的基因命名为LTP110和LTP114.在完成2种cDNA全顺序测定的基础上,对它们的核苷酸顺序及推断的蛋白质一级结构进行了比较分析,结果显示两者均具有典型的LTP结构特征.Northern杂交结果表明,LTP110在幼叶和胚芽鞘中表达较强,在根中表达较弱;而LTP144只在幼叶中表达,在胚芽鞘和根中没有检测到信号.在黄化苗幼叶的生长过程中,LTP110的表达呈下降的趋势;而LTP144的表达则呈先升后降的趋势.显然两者具有不同的器官表达特异性和时间表达特异性,功能上可能有所不同.Southern杂交结果则显示,LTP110和LTP144均属于一个小的基因家族. 展开更多
关键词 转移蛋白 水稻 黄化苗 基因表达 基因
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载脂蛋白E基因多态性及脂质代谢水平与胆囊结石形成的关系研究
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作者 任爱群 胡裕雯 +3 位作者 叶红于 徐蓓蓓 戴显宁 叶毅 《浙江医学》 CAS 2024年第14期1513-1517,共5页
目的探讨载脂蛋白(Apo)E基因多态性及脂质代谢水平与胆囊结石形成的关系。方法回顾性选取2022年6月至2023年6月在温州市人民医院诊断为胆囊结石的100例患者作为胆囊结石组,另选取同期在本院体检的100名健康者作为对照组。使用基因检测... 目的探讨载脂蛋白(Apo)E基因多态性及脂质代谢水平与胆囊结石形成的关系。方法回顾性选取2022年6月至2023年6月在温州市人民医院诊断为胆囊结石的100例患者作为胆囊结石组,另选取同期在本院体检的100名健康者作为对照组。使用基因检测试剂盒进行多通道荧光定量分析Apo E基因多态性。比较两组Apo E基因型分布、等位基因频率分布以及血清TG、TC、HDL-C、LDL-C、非高密度脂蛋白胆固醇及脂蛋白水平差异。采用logistic回归分析胆囊结石形成的独立危险因素,采用ROC曲线评估危险因素对胆囊结石的预测效能。结果胆囊结石组患者TC、HDL-C、LDL-C水平均高于对照组(均P<0.05)。Apo E基因多态性分析显示,胆囊结石组ε2、ε4等位基因频率均高于对照组(均P<0.01)。胆囊结石组E2/3、E2/4、E3/4、E4/4及E2/4+E3/4+E4/4基因型频率均高于对照组(均P<0.01)。logistic回归分析显示,E2/3、E2/4及E3/4基因型、性别、HDL-C水平及吸烟史均是胆囊结石形成的独立危险因素(均P<0.05)。而E2/4、E3/4、TG、HDL-C可作为胆囊结石的预测指标,其联合预测的灵敏度为0.710,特异度为0.910,约登指数为0.620,截断值为0.600,AUC为0.880。结论胆囊结石患者存在Apo E基因多态性,且Apo E基因多态性、性别、HDL-C水平及吸烟史与胆囊结石的形成密切相关,E2/4、E3/4、TG、HDL-C可作为预测胆囊结石形成的潜在指标。 展开更多
关键词 蛋白E 基因多态性 胆囊结石 代谢
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水稻脂质转移蛋白基因的分离和分析 被引量:6
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作者 刘晓斐 徐久振 +3 位作者 侯宇清 詹树萱 葛晓春 曹凯鸣 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第7期730-740,共11页
用水稻脂质转移蛋白(lipidtransferprotein,LTP)的cDNA(pFDRSC110)为探针,从水稻(OryzasativaL.sp.indica)“广陆矮4号”基因文库中筛选出LTP基因,完成了1.... 用水稻脂质转移蛋白(lipidtransferprotein,LTP)的cDNA(pFDRSC110)为探针,从水稻(OryzasativaL.sp.indica)“广陆矮4号”基因文库中筛选出LTP基因,完成了1.8kb长片段的序列测定。该基因编码一个121个氨基酸组成的肽,编码区中间有一个90bp的内含子,基因的调控区除有2个TATAbox和polyA加工信号外,还存在多个回文序列和逆向重复序列。该基因编码的蛋白质N端是由28个氨基酸组成的信号肽,同源性比较表明它具有典型的植物LTP特征。 展开更多
关键词 水稻 调控元件 蛋白同源性 转移蛋白 基因
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谷子脂质转移蛋白基因SiLTP1的克隆及表达分析 被引量:3
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作者 孟凡花 李臻 +1 位作者 王庆国 刘炜 《山东农业科学》 北大核心 2021年第10期1-7,共7页
植物脂质转移蛋白(LTP)是一类含量丰富并且由多基因家族编码的小分子碱性蛋白。本研究利用PCR技术从谷子中克隆得到一个LTP基因,命名为SiLTP1。该基因的开放阅读框全长为354 bp,编码117个氨基酸。对其核苷酸及蛋白序列进行生物信息学分... 植物脂质转移蛋白(LTP)是一类含量丰富并且由多基因家族编码的小分子碱性蛋白。本研究利用PCR技术从谷子中克隆得到一个LTP基因,命名为SiLTP1。该基因的开放阅读框全长为354 bp,编码117个氨基酸。对其核苷酸及蛋白序列进行生物信息学分析,并通过qRT-PCR方法分析了SiLTP1在各胁迫下的表达模式。结果表明,SiLTP1具有脂质转移蛋白家族共有特性,即N端的信号肽结构、跨膜螺旋区、8个高度保守的半胱氨酸基序;三级结构预测表明,该蛋白主要是由4个α-螺旋和无规则卷曲组成;qRT-PCR结果显示,盐、干旱、ABA及MeJA均可诱导SiLTP1表达,其中盐胁迫诱导最为明显,显示SiLTP1可能参与谷子逆境胁迫响应过程,尤其在耐盐品质形成中发挥作用。本研究为深入解析谷子中SiLTP1的生物学功能及作用机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 谷子 转移蛋白 基因克隆 胁迫响应 表达模式分析
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电子转移黄素蛋白脱氢酶基因突变所致的核黄素反应性脂质沉积性肌病的临床、病理和基因特征分析
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作者 袁姣 廖巧 +3 位作者 卢可 曾倩倩 周瑾瑕 毕方方 《国际神经病学神经外科学杂志》 2020年第3期310-314,共5页
目的分析电子转移黄素蛋白脱氢酶(ETFDH)突变所致的核黄素反应性脂质沉积性肌病(RR-MADD)的临床特点、肌肉病理以及血、尿质谱筛查结果和基因突变特点,旨在为早期诊断和治疗提供帮助。方法回顾性分析该院2009年至2019年确诊的15例ETFDH... 目的分析电子转移黄素蛋白脱氢酶(ETFDH)突变所致的核黄素反应性脂质沉积性肌病(RR-MADD)的临床特点、肌肉病理以及血、尿质谱筛查结果和基因突变特点,旨在为早期诊断和治疗提供帮助。方法回顾性分析该院2009年至2019年确诊的15例ETFDH突变所致的脂质沉积性肌病患者的各项资料。结果15例患者平均发病年龄为(32.1±13.6)岁,均以肢体无力为首发症状,其中四肢起病者占53.3%,双下肢起病者占46.7%。所有患者的肌酶水平均升高;肌电图结果提示80%呈肌源性损害,13.3%为肌源性合并神经源性损害,6.7%结果正常。血、尿质谱的阳性检出率分别为66.7%和22.2%;基因检测提示所有患者存在ETFDH基因不同位点突变,其中单一杂合突变和复合杂合突变各占40%,纯合突变占20%。结论该病以波动性肌无力伴肌酶升高为主要表现,患者应尽快行肌肉病理检查,同时联合血、尿代谢筛查和基因检测有助于RR-MADD患者早期诊断和及时治疗。 展开更多
关键词 沉积性肌病 核黄素反应性沉积性肌病 电子转移黄素蛋白脱氢酶 基因检测 血、尿筛查
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肿瘤转移抑制基因KiSS-1和基质金属蛋白酶-9在肝细胞癌门静脉癌栓中的表达 被引量:20
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作者 侯元凯 王义 +1 位作者 丛文铭 吴孟超 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第6期591-595,共5页
背景与目的:肿瘤转移抑制基因KiSS-1与恶性肿瘤的转移具有一定关系,但它与肝细胞癌的转移特别是与门静脉癌栓形成的关系罕有报道。本实验探讨KiSS-1基因在门静脉癌栓形成中的作用及机制。方法:应用RT-PCR法和免疫组化方法检测50例肝细... 背景与目的:肿瘤转移抑制基因KiSS-1与恶性肿瘤的转移具有一定关系,但它与肝细胞癌的转移特别是与门静脉癌栓形成的关系罕有报道。本实验探讨KiSS-1基因在门静脉癌栓形成中的作用及机制。方法:应用RT-PCR法和免疫组化方法检测50例肝细胞癌组织及11例门静脉癌栓组织中KiSS-1基因和基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)的表达。结果:门静脉癌栓组、伴癌栓肝细胞癌组、不伴癌栓肝细胞癌组中KiSS-1基因的mRNA阳性率分别为18.2%(2/11)、16.1%(5/31)、63.2%(12/19),蛋白阳性率分别为0%(0/11)、12.9%(4/31)、47.4%(9/19),癌栓组和伴癌栓肝细胞癌组的KiSSmRNA和蛋白阳性率均明显低于不伴癌栓肝细胞癌组(P<0.05),而癌栓组与伴癌栓肝细胞癌组之间的差异无统计学意义(P>0.05)。各组中MMP-9mRNA的阳性率分别为72.7%(8/11)、77.4%(24/31)、31.6%(6/19),MMP-9蛋白的阳性率分别为81.8%(9/11)、83.9%(26/31)、42.1%(8/19),癌栓组与伴癌栓肝细胞癌组的MMP-9mRNA和蛋白阳性率之间差异均无统计学意义(P>0.05),但均明显高于不伴癌栓的肝细胞癌组(P<0.05)。KiSS-1基因与MMP-9的mRNA和蛋白阳性率均呈负相关(r值分别为-0.362、-0.473,P值均<0.05)。结论:KiSS-1基因、MMP-9与门静脉癌栓的形成密切相关,KiSS-1基因可能通过抑制MMP-9表达而抑制门静脉癌栓的形成。 展开更多
关键词 肝肿瘤 转移抑制基因 KISS-1基因 金属蛋白酶-9 门静脉癌栓
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小麦脂质转运蛋白基因TaLTP克隆及功能分析 被引量:7
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作者 李倩 王景一 +4 位作者 毛新国 李昂 高丽锋 刘惠民 景蕊莲 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期673-682,共10页
脂质转运蛋白(lipid transfer protein,LTP)是广泛存在于植物中的一类小分子蛋白,因其能在植物细胞膜间运输脂类物质而得名,在植物角质层合成和适应多种环境胁迫中起重要作用。本研究利用同源克隆方法得到Ta LTP-s的c DNA全长序列510 bp... 脂质转运蛋白(lipid transfer protein,LTP)是广泛存在于植物中的一类小分子蛋白,因其能在植物细胞膜间运输脂类物质而得名,在植物角质层合成和适应多种环境胁迫中起重要作用。本研究利用同源克隆方法得到Ta LTP-s的c DNA全长序列510 bp,开放阅读框为339 bp,编码112个氨基酸。利用RIL群体将Ta LTP-s定位在染色体1A上,距离两侧标记WMC449和WMC93的遗传距离分别为2.1 c M和5.9 c M。通过原生质体亚细胞定位显示Ta LTP-s定位于细胞膜和细胞质中。小麦开花期Ta LTP-s在小花中表达量较高,尤其是在花药中的表达量远高于在根和叶中。在ABA、PEG、Na Cl及4℃低温胁迫诱导下,小麦Ta LTP-s均上调表达,可能与抗逆性调节相关。在高盐胁迫处理下,转基因拟南芥幼苗的细胞膜稳定性和存活率显著高于野生型。研究结果为利用小麦脂质转运蛋白基因改良作物抗逆性奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 转运蛋白 基因克隆 非生物胁迫 耐盐性
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