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人类管家基因和非管家基因microRNA绑定密度的比较及与3′UTR进化保守性关系的分析
1
作者
刘哲言
卢一鸣
+1 位作者
屈武斌
张成岗
《军事医学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期808-813,共6页
目的该研究从整体水平比较microRNA(miRNA)对管家基因和非管家基因的调控差异并研究3'UTR的进化保守性与miRNA对两类基因调控差异之间的相关性。方法通过对3个基于序列的miRNA靶基因预测软件整合分析,并结合基于miRNA-靶基因的表达...
目的该研究从整体水平比较microRNA(miRNA)对管家基因和非管家基因的调控差异并研究3'UTR的进化保守性与miRNA对两类基因调控差异之间的相关性。方法通过对3个基于序列的miRNA靶基因预测软件整合分析,并结合基于miRNA-靶基因的表达谱数据相关性分析,以获得miRNA对两类基因的调控情况,同时利用phastCons保守性分值对两类基因的3'UTR区域进行多物种进化分析。结果研究发现miRNA在管家基因的3'UTR上有显著地高密度绑定,管家基因的3'UTR区域具有相对较高的序列保守性。结论该研究结果突出了miRNA对管家基因表达调控的重要作用,对于重新理解miRNA对真核生物基因表达调控作用具有一定的参考价值。
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关键词
管家基因
非管家基因
MICRORNA
基于序列的预测
表达谱数据
进化分析
原文传递
题名
人类管家基因和非管家基因microRNA绑定密度的比较及与3′UTR进化保守性关系的分析
1
作者
刘哲言
卢一鸣
屈武斌
张成岗
机构
安徽医科大学
军事医学科学院放射与辐射医学研究所
军事医学科学院放射与辐射医学研究
出处
《军事医学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期808-813,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30900830,81172770)
国家重点基础研究发展计划资助项目(2012CB518200)
蛋白质组学国家重点实验室自主研究课题资助项目(SKLP-K201004)
文摘
目的该研究从整体水平比较microRNA(miRNA)对管家基因和非管家基因的调控差异并研究3'UTR的进化保守性与miRNA对两类基因调控差异之间的相关性。方法通过对3个基于序列的miRNA靶基因预测软件整合分析,并结合基于miRNA-靶基因的表达谱数据相关性分析,以获得miRNA对两类基因的调控情况,同时利用phastCons保守性分值对两类基因的3'UTR区域进行多物种进化分析。结果研究发现miRNA在管家基因的3'UTR上有显著地高密度绑定,管家基因的3'UTR区域具有相对较高的序列保守性。结论该研究结果突出了miRNA对管家基因表达调控的重要作用,对于重新理解miRNA对真核生物基因表达调控作用具有一定的参考价值。
关键词
管家基因
非管家基因
MICRORNA
基于序列的预测
表达谱数据
进化分析
Keywords
housekeeping genes
non-housekeeping genes
microRNA
sequence-based prediction
expression profiles data
evolution analysis
分类号
Q987 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类管家基因和非管家基因microRNA绑定密度的比较及与3′UTR进化保守性关系的分析
刘哲言
卢一鸣
屈武斌
张成岗
《军事医学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
原文传递
已选择
0
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参考文献
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