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模式生物的外显子、内含子和基因间序列的识别(英文)
1
作者
陈翠霞
李前忠
林昊
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期166-172,共7页
基于核酸序列在剪切位点上保守性、组分的不同和编码序列阅读框架的3周期性,模式生物全基因组序列分为外显子、内含子和基因间序列三类.三个标准离散源分别由64个三联体在整条序列上的概率和4个碱基序列首尾(剪切位点附近)共30个位点上...
基于核酸序列在剪切位点上保守性、组分的不同和编码序列阅读框架的3周期性,模式生物全基因组序列分为外显子、内含子和基因间序列三类.三个标准离散源分别由64个三联体在整条序列上的概率和4个碱基序列首尾(剪切位点附近)共30个位点上的概率共同构成.某条序列的类型就由该序列的离散量同相应区间上三个标准离散量的离散增量确定.结果表明:具有184个信号参数的离散量预测比只有64个三联体参数的结果要高出5%,总体预测成功率:线虫为87.37%,拟南芥为91.08%,果蝇为92.28%,原核生物大肠杆菌的二种序列预测率为92.88%,酵母菌为94.88%.
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关键词
外显子
内含子
基因间序列
剪切位点
面散增量
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职称材料
题名
模式生物的外显子、内含子和基因间序列的识别(英文)
1
作者
陈翠霞
李前忠
林昊
机构
内蒙古大学理工学院物理系
出处
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期166-172,共7页
基金
国家自然科学基金项目 (3 0 1 6 0 0 2 5)~~
文摘
基于核酸序列在剪切位点上保守性、组分的不同和编码序列阅读框架的3周期性,模式生物全基因组序列分为外显子、内含子和基因间序列三类.三个标准离散源分别由64个三联体在整条序列上的概率和4个碱基序列首尾(剪切位点附近)共30个位点上的概率共同构成.某条序列的类型就由该序列的离散量同相应区间上三个标准离散量的离散增量确定.结果表明:具有184个信号参数的离散量预测比只有64个三联体参数的结果要高出5%,总体预测成功率:线虫为87.37%,拟南芥为91.08%,果蝇为92.28%,原核生物大肠杆菌的二种序列预测率为92.88%,酵母菌为94.88%.
关键词
外显子
内含子
基因间序列
剪切位点
面散增量
Keywords
exon
intron
intergenic DNA
splice site
the increment of diversity
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
模式生物的外显子、内含子和基因间序列的识别(英文)
陈翠霞
李前忠
林昊
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005
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职称材料
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