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基于基因组编辑技术的水稻靶向突变特征及遗传分析 被引量:8
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作者 唐丽 李曜魁 +7 位作者 张丹 毛毕刚 吕启明 胡远艺 韶也 彭彦 赵炳然 夏石头 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期746-755,共10页
TALEN(Transcription activator-like effector nucleases)系统和CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)系统是当前广泛应用的两大基因组编辑技术。本文比较分析了水稻(... TALEN(Transcription activator-like effector nucleases)系统和CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)系统是当前广泛应用的两大基因组编辑技术。本文比较分析了水稻(Oryza sativa L.)中这两大系统诱导突变的突变率、突变类型、突变位置、突变时间和遗传模式,发现TALEN系统和CRISPR/Cas9系统均可在T_0代水稻中有效诱发位点特异性突变,且CRISPR/Cas9的突变率更高。两大系统都以诱发10 bp以内的In Del突变为主,TALEN系统易诱导10 bp以内的缺失突变,而CRISPR/Cas9系统易诱导1 bp的插入突变,且CRISPR/Cas9系统诱发的DNA双链断裂(Double-strand breaks,DSBs)位置更加精确。此外,DSBs在修复过程中能以低频同源重组(Homologous recombination,HR)途径修复,产生DNA片段重复突变。对于相邻双靶点CRISPR/Cas9系统而言,双靶点间的DNA片段可发生缺失或倒位,这种双靶点间DNA片段突变的发生频率与双靶点各自的突变率无正相关性。两大系统诱导的突变最早发生在已转化的愈伤组织中,少量发生在水稻的体细胞中,导致了纯合突变、杂合突变、双等位突变和嵌合突变4种遗传模式,其中双等位突变比例最高,嵌合突变比例最低。除嵌合突变外,纯合突变、杂合突变、双等位突变的突变序列均可稳定遗传给下一代。 展开更多
关键词 TALEN CRISPR/Cas9 水稻 靶向突变 遗传特性
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植物CRISPR/Cas9基因组编辑系统与突变分析 被引量:19
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作者 马兴亮 刘耀光 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期118-125,共8页
基因组定点编辑技术通过可编码核酸酶切割基因组特定位点,进而诱导基因组定点突变。CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)基因组编辑系统由Cas9核酸酶以及sg RNA(Singl... 基因组定点编辑技术通过可编码核酸酶切割基因组特定位点,进而诱导基因组定点突变。CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)基因组编辑系统由Cas9核酸酶以及sg RNA(Single guide RNA)组成,与其他可编码核酸酶系统如锌指核酸酶(Zinc finger nucleases,ZFNs)和类转录激活因子效应物核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases,TALENs)相比具有更简便的操作性和更高的基因组定点编辑效率。目前在植物中已有多例应用CRISPR/Cas9系统进行基因组编辑的报道。本文从Cas9基因与sg RNA表达载体的构建策略,获得基因组定点编辑突变体的转化方法、突变的效率和特征、突变的检测方法等方面进行了总结,最后对植物中利用CRISPR/Cas9系统进行基因组编辑存在的问题以及发展前景进行了讨论。 展开更多
关键词 植物 CRISPR/Cas9 靶向突变 基因型鉴定
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Systemic treatment in EGFR-ALK NSCLC patients:second line therapy and beyond
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作者 Niki Karachaliou Rafael Rosell 《Cancer Biology & Medicine》 SCIE CAS CSCD 2014年第3期173-181,共9页
Lung cancer is the most frequently diagnosed cancer and a leading cause of cancer mortality worldwide, with adenocarcinoma being the most common histological subtype. Deeper understanding of the pathobiology of non-sm... Lung cancer is the most frequently diagnosed cancer and a leading cause of cancer mortality worldwide, with adenocarcinoma being the most common histological subtype. Deeper understanding of the pathobiology of non-small cell lung cancer(NSCLC) has led to the development of small molecules that target genetic mutations known to play critical roles in progression to metastatic disease and to influence response to targeted therapies. The principle goal of precision medicine is to define those patient populations most likely to respond to targeted therapies. However, the cancer genome landscape is composed of relatively few "mountains" [representing the most commonly mutated genes like KRAS, epidermal growth factor(EGFR), and anaplastic lymphoma kinase(ALK)] and a vast number of "hills"(representing low frequency but potentially actionable mutations). Low-frequency lesions that affect a druggable gene product allow a relatively small population of cancer patients for targeted therapy to be selected. 展开更多
关键词 Lung cancer epidermal growth factor(EGFR) anaplastic lymphoma kinase fusions(ALK fusions) tyrosine kinase inhibitors(TKIs) TKI resistance
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TAL效应子介导基因组DNA的靶向修饰
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作者 庄军 吴祖建 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期74-80,共7页
植物黄单胞菌病原细菌分泌的TAL效应子(Transcription activator-like effector)可结合特异的双链DNA。TAL是由序列几乎相同的多个DNA结合域的重复串联而构成的,每个DNA结合模块的重复可变双残基特异识别一个DNA碱基。TAL和核酸修饰相... 植物黄单胞菌病原细菌分泌的TAL效应子(Transcription activator-like effector)可结合特异的双链DNA。TAL是由序列几乎相同的多个DNA结合域的重复串联而构成的,每个DNA结合模块的重复可变双残基特异识别一个DNA碱基。TAL和核酸修饰相关功能域融合而成的定制TAL效应子(dTALE)能特定靶向修饰基因组DNA,在新近遗传工程中扮演重要角色。目前,TAL效应子与核酸酶FokI融合成的TALEN核酸酶(TALEN)能够靶向识别基因组位点并由核酸酶切割双链DNA造成双链断裂,通过同源重组(HR)或非同源末端连接(NHEJ)进行双链修复从而引发特定位点的基因突变。TALENs在多个模式生物中都具有较高的靶向有效性,而且TAL效应子DNA结合域可进行模块化设计,能够发展成高通量的基因靶向修饰和调控的平台,具有广阔的实际应用前景。对TAL效应子特异识别DNA的结构分析、TALENs的设计策略以及TAL效应子在基因组靶向修饰中的应用与展望等方面进行了概述。 展开更多
关键词 TAL效应子 TAL效应子核酸酶 重复可变双残基 靶向突变
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