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microRNA靶基因特征提取新方法 被引量:1
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作者 刘元宁 沈廷杰 +3 位作者 张浩 李鑫 魏庆凯 赫羽喆 《吉林大学学报(工学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第2期418-422,共5页
针对microRNA靶基因预测中出现的敏感性与特异性的矛盾、阳性阈值与测试结果优劣的矛盾和预测范围缩小的问题,提出种子区域上的能量标定、元素比例、靶标作用体上的惩罚3种特征提取新方法,以上特征提取方法涵盖了统计信息、结构信息和... 针对microRNA靶基因预测中出现的敏感性与特异性的矛盾、阳性阈值与测试结果优劣的矛盾和预测范围缩小的问题,提出种子区域上的能量标定、元素比例、靶标作用体上的惩罚3种特征提取新方法,以上特征提取方法涵盖了统计信息、结构信息和能量信息。结合传统特征和新特征,本文利用神经网络构建分类模型并测试。结果显示:新特征能使阴性、阳性数据各自的聚集度有效提高,在高阳性阈值下,评估效果良好;并且靶基因预测范围未缩小,预测开销未增加。 展开更多
关键词 计算机应用 生物信息学 靶基因分类 特征提取方法 机器学习 阳性基因阈值
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Expression Level of u-PAR in Different Invasive PC-3M Cell Subclones
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作者 廖国宁 李清芬 +2 位作者 冯友梅 邓耀祖 马丁 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2004年第2期106-110,127,共6页
Objective: To select a target molecule associated with invasive potential in PC-3M cell. Methods: Cell subclones were isolated from PC-3M cell line with the method of limited dilution and their invasive ability charac... Objective: To select a target molecule associated with invasive potential in PC-3M cell. Methods: Cell subclones were isolated from PC-3M cell line with the method of limited dilution and their invasive ability characterized by monolayer invasion assay. The expression of u-PAR in the cell subclones at mRNA and protein levels was assayed respectively by non-competitive quantitative RT-PCR and immunohistochemical assay. Results: The expression level of u-PAR in highly invasive cell subclones was higher than that of lower invasive subclones. Conclusion: The higher expression level of u-PAR is associated with the relative strong invasive ability of PC-3M subclones. It is indicated that the u-PAR might be a promising target molecule for inhibiting invasion of highly invasive PC-3M cell subclones. 展开更多
关键词 tumor invasion U-PAR prostate carcinoma cell subclones
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