中药方剂血府逐瘀汤中分子在靶标-配体空间的分布

研究了中药方剂血府逐瘀汤(XFZYD)中501个分子在心血管疾病重要的靶酶肾素(renin),血管紧张素转化酶I(angiotensin-converting enzyme I,ACE I),3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMG-CoAR)和P-糖蛋白的靶标-配体空间分布.

生物信息学及分子模拟在蛋白质降解靶向嵌合体(PROTAC)中的研究

蛋白质降解靶向嵌合体(proteolysis targeting chimera,PROTAC)是一种利用泛素−蛋白酶体系统(ubiquitin proteasome system,UPS)对靶标蛋白进行降解的药物开发技术。与传统小分子药物通过“占位驱动”作用模式调控蛋白质活性的方式不同,PROTAC通过形成稳定的靶蛋白-PROTAC-E3泛素连接酶三元复合物,并利用泛素−蛋白酶体系统降解靶标蛋白而发挥作用。然而,目前只有少数E3泛素连接酶被用到PROTAC分子设计中,PROTAC可靶向的靶标蛋白空间也有待进一步拓展;另一方面,靶蛋白-PROTAC-E3泛素连接酶的三元复合物晶体结构解析难度较大,计算模拟方法为构建三元复合物模型提供了有效的工具。基于此,本文介绍了生物信息学在拓展E3泛素连接酶及扩大靶标蛋白空间方面的研究进展,总结了计算模拟在PROTAC三元复合物结构模拟中的方法研究,并探讨了PROTAC技术的发展趋势。