基于差异表达基因探讨绝经后骨质疏松症潜在靶点与机制

目的 基于基因表达综合数据库(GEO)芯片数据获得绝经后骨质疏松症的差异表达基因,探讨其潜在作用靶点与机制。方法 从GEO数据库筛选绝经后骨质疏松症的芯片数据经GEO2R软件处理获取差异基因,利用Uni Prot数据库进行规范、验证,借助STRING数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,借助Cytoscape3.9.1构建PPI网络并进行拓扑分析,筛选核心基因。采用cluster Profiler、pathview等R包分析差异基因参与的基因本体(GO)功能及京都基因和基因组数据库(KEGG)信号通路,使用微生信平台进行结果可视化。结果 获得差异基因656个,其中下调基因421个,上调基因235个。得到10个核心基因,即VEGFA、KRAS、EP300、IL-2、IL-4、KIT、FOS、CCND1、HGF、CYCS。GO中分子功能、生物过程、细胞成分富集结果各771、4 648、499个,分子功能主要富集在脂肽结合、磷脂结合等,生物过程主要富集在肽酶活性调节、蛋白水解作用负性调节等,细胞成分主要富集在内质囊泡、等离子膜外侧等;KEGG通路富集结果 299条,主要涉及PI3K-Akt信号通路、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体相互作用、B细胞受体信号通路、造血细胞谱系、Ras信号通路等。结论 筛选所得差异基因和相关信号通路有助于进一步了解绝经后骨质疏松症的靶点与机制,为新药研发提供了新思路。

新的杂合肽抗肿瘤血管生成的作用机制

目的探讨具有生物活性的小分子杂合肽对肿瘤血管生成的抑制作用机制。方法利用多肽仪合成新的杂合肽并对其合成产物进行体内外实验活性分析。结果在体外新的杂合肽在浓度为1.8μmol/L并在48 h对Lewis肿瘤细胞增殖及迁移具有明显抑制作用;在体内新的杂合肽在浓度为120μmol/L、并连续治疗21 d时能明显抑制碱烧伤后兔角膜新生血管及C57BL/6N肿瘤小鼠皮下移植瘤新生血管,使肿瘤体积明显减小,抑制程度具有一定的时-量依赖关系。并在细胞水平与整体水平上具有一定相关性。结论新的杂合肽能够明显抑制荷瘤鼠肿瘤的生长,其作用机制可能与抑制血管内皮细胞生成有关。