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基于网络药理学探讨枳术丸治疗功能性便秘的作用机制
1
作者
吴文静
王芳
《中医临床研究》
2023年第18期1-7,共7页
目的:基于网络药理学方法探讨枳术丸治疗功能性便秘(Functional Constipation,FC)的潜在分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索枳实、白术的主要化学成分及其靶点,并根据药物代谢动力学参数筛选枳实...
目的:基于网络药理学方法探讨枳术丸治疗功能性便秘(Functional Constipation,FC)的潜在分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索枳实、白术的主要化学成分及其靶点,并根据药物代谢动力学参数筛选枳实、白术的活性组分;通过GeneCards数据库获取FC主要靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建枳术丸活性成分-疾病共同作用靶点的可视化网络;基于STRING数据库,构建枳术丸治疗FC的共同作用靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,根据拓扑学参数分析筛选出核心靶点;对共同作用靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:筛选出枳术丸主要的活性成分共28个,获得枳术丸与FC的共同作用靶点98个,核心靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、细胞肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、半胱氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、Jun原癌基因(Jun Proto-Oncogee,JUN)等。GO富集分析得到生物学过程相关条目1965条、分子功能相关条目137条及细胞组分相关条目98条(P<0.05);KEGG通路富集分析得到160条信号通路(P<0.05),枳术丸治疗FC的靶点基因主要富集在PI3K-Akt信号通路、脂质与动脉粥样硬化、化学致癌-受体激活等相关通路上。结论:枳术丸治疗FC具有多成分、多靶点、多通路的特点,其作用机制可能主要与磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路相关。
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关键词
枳术丸
功能性便秘
网络药理学
机制研究
靶点与通路
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职称材料
基于网络药理学与分子对接探讨桑杞清眩颗粒治疗高脂血症的机制
被引量:
3
2
作者
吴佳芸
李玲玲
+1 位作者
李瑞菡
黄力
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期969-978,共10页
目的基于网络药理学和分子对接技术研究桑杞清眩颗粒干预高脂血症的作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选桑杞清眩颗粒主要活性成分和靶点信息,采用GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库确定高脂血症相关的靶点,取活性成分作用靶点和疾...
目的基于网络药理学和分子对接技术研究桑杞清眩颗粒干预高脂血症的作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选桑杞清眩颗粒主要活性成分和靶点信息,采用GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库确定高脂血症相关的靶点,取活性成分作用靶点和疾病靶点交集,通过STRING构建PPI网络,并基于Cytoscape MCODE插件提取核心Module进行分析。利用Metascape对药物-成分-靶点网络及相关生物学过程、分子功能、信号通路进行分析,通过Cytoscape 3.8.0构建"成分-靶点-信号通路"网络,最后通过Autodock完成分子对接验证。结果共筛选出桑杞清眩颗粒的主要活性成分有132种,共同成分7种,包括豆甾醇、β-谷甾醇、胆甾醇、槲皮素、谷甾醇、木犀草素、3-羟基亚甲基丹参醌,其作用于高脂血症的主要靶点有STAT3、AKT1、TNF、IL-6、VEGFA等,主要集中于AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路等参与调节血脂异常。分子对接结果显示,桑杞清眩颗粒关键活性成分与核心靶点的结合潜能和活性较好。结论本研究初步探讨了桑杞清眩颗粒对高脂血症的多维网络调控机制,揭示了其主要潜在的效应靶点和途径。
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关键词
桑杞清眩颗粒
高脂血症
网络药理学
分子对接
靶点与通路
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职称材料
题名
基于网络药理学探讨枳术丸治疗功能性便秘的作用机制
1
作者
吴文静
王芳
机构
太原市人民医院
出处
《中医临床研究》
2023年第18期1-7,共7页
文摘
目的:基于网络药理学方法探讨枳术丸治疗功能性便秘(Functional Constipation,FC)的潜在分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索枳实、白术的主要化学成分及其靶点,并根据药物代谢动力学参数筛选枳实、白术的活性组分;通过GeneCards数据库获取FC主要靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建枳术丸活性成分-疾病共同作用靶点的可视化网络;基于STRING数据库,构建枳术丸治疗FC的共同作用靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,根据拓扑学参数分析筛选出核心靶点;对共同作用靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:筛选出枳术丸主要的活性成分共28个,获得枳术丸与FC的共同作用靶点98个,核心靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、细胞肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、半胱氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、Jun原癌基因(Jun Proto-Oncogee,JUN)等。GO富集分析得到生物学过程相关条目1965条、分子功能相关条目137条及细胞组分相关条目98条(P<0.05);KEGG通路富集分析得到160条信号通路(P<0.05),枳术丸治疗FC的靶点基因主要富集在PI3K-Akt信号通路、脂质与动脉粥样硬化、化学致癌-受体激活等相关通路上。结论:枳术丸治疗FC具有多成分、多靶点、多通路的特点,其作用机制可能主要与磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路相关。
关键词
枳术丸
功能性便秘
网络药理学
机制研究
靶点与通路
Keywords
Zhizhu Wan
Functional constipation
Network pharmacology
Mechanism of action
Targets and pathways
分类号
R256.35 [医药卫生—中医内科学]
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接探讨桑杞清眩颗粒治疗高脂血症的机制
被引量:
3
2
作者
吴佳芸
李玲玲
李瑞菡
黄力
机构
北京中医药大学研究生院
中日友好医院
出处
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期969-978,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(81774105)。
文摘
目的基于网络药理学和分子对接技术研究桑杞清眩颗粒干预高脂血症的作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选桑杞清眩颗粒主要活性成分和靶点信息,采用GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库确定高脂血症相关的靶点,取活性成分作用靶点和疾病靶点交集,通过STRING构建PPI网络,并基于Cytoscape MCODE插件提取核心Module进行分析。利用Metascape对药物-成分-靶点网络及相关生物学过程、分子功能、信号通路进行分析,通过Cytoscape 3.8.0构建"成分-靶点-信号通路"网络,最后通过Autodock完成分子对接验证。结果共筛选出桑杞清眩颗粒的主要活性成分有132种,共同成分7种,包括豆甾醇、β-谷甾醇、胆甾醇、槲皮素、谷甾醇、木犀草素、3-羟基亚甲基丹参醌,其作用于高脂血症的主要靶点有STAT3、AKT1、TNF、IL-6、VEGFA等,主要集中于AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路等参与调节血脂异常。分子对接结果显示,桑杞清眩颗粒关键活性成分与核心靶点的结合潜能和活性较好。结论本研究初步探讨了桑杞清眩颗粒对高脂血症的多维网络调控机制,揭示了其主要潜在的效应靶点和途径。
关键词
桑杞清眩颗粒
高脂血症
网络药理学
分子对接
靶点与通路
Keywords
Sangqi Qingxuan(SQQX)granules
hyperlipidemia
network pharmacology
molecular docking
targets and pathways
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学探讨枳术丸治疗功能性便秘的作用机制
吴文静
王芳
《中医临床研究》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
基于网络药理学与分子对接探讨桑杞清眩颗粒治疗高脂血症的机制
吴佳芸
李玲玲
李瑞菡
黄力
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
下载PDF
职称材料
已选择
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