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基于多靶点分子对接筛选金银花治疗非酒精性脂肪肝成分研究
被引量:
4
1
作者
陈成龙
郑明明
+4 位作者
王玲娜
刘兰玲
张永清
李佳
赵东升
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1341-1348,共8页
整合多靶点分子对接和反向靶点预测技术探究金银花治疗非酒精性脂肪肝(NAFLD)物质基础及潜在机制。借助TCMSP、ETCM数据库并挖掘文献收集金银花成分,以PPARα、PPARδ及FXR受体为靶标,运用分子对接筛选金银花中活性化合物,反向靶点预测...
整合多靶点分子对接和反向靶点预测技术探究金银花治疗非酒精性脂肪肝(NAFLD)物质基础及潜在机制。借助TCMSP、ETCM数据库并挖掘文献收集金银花成分,以PPARα、PPARδ及FXR受体为靶标,运用分子对接筛选金银花中活性化合物,反向靶点预测活性化合物潜在靶点,构建蛋白互作网络并进行生物功能和通路富集。11种金银花活性成分对3个靶标的亲和力高于阳性对照,野漆树苷与PPARα的结合能力最强,3,5-二-O-咖啡酰奎宁酸甲酯与PPARδ和FXR结合能力最强。初步获得金银花治疗NAFLD主要成分为黄酮类和酚酸类,其中野漆树苷、3,4-二-O-咖啡酰奎宁酸甲酯、3,5-二-O-咖啡酰奎宁酸甲酯、异绿原酸B发挥主要作用。筛选出的成分主要通过PI3K-Akt、MAPK和胰岛素信号通路特异地作用于肝、脂肪细胞和肝癌细胞发挥治疗NAFLD的作用。本研究基于多靶点分子对接技术筛选金银花治疗NAFLD活性成分,提示金银花酚酸类成分具有进一步开发成药物的潜力,为后续进一步研究开发治疗NAFLD的创新药物提供一定的理论基础。
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关键词
多
靶
点
药物设计
反向
靶
点
预测
分子对接
金银花
非酒精性脂肪肝
下载PDF
职称材料
基于计算机辅助药物设计探究扶正避瘟方预防新型冠状病毒感染的物质基础及分子机制
被引量:
6
2
作者
靳晓杰
王菲
+8 位作者
毛建军
王燕如
关瑞宁
刘东玲
魏本君
李亚玲
张利英
张志明
刘永琦
《中国中医药信息杂志》
CAS
CSCD
2021年第3期19-26,共8页
目的从抑制病毒感染不同靶点的选择性、调控机体免疫因子的角度出发,系统研究扶正避瘟方预防新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的物质基础及分子机制。方法采用计算机辅助药物设计中的同源模建、分子对接等方法,对扶正避瘟方中各药味的化合...
目的从抑制病毒感染不同靶点的选择性、调控机体免疫因子的角度出发,系统研究扶正避瘟方预防新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的物质基础及分子机制。方法采用计算机辅助药物设计中的同源模建、分子对接等方法,对扶正避瘟方中各药味的化合物进行基于分子对接的虚拟筛选。运用靶点反向预测及其KEGG通路,分析方中健脾药白术对机体抵御病毒的潜在靶点和分子机制,并进行分子对接验证。结果扶正避瘟方中阻断SARS-CoV-2入侵的活性成分有84个,连翘、生姜、荷叶、黄芪对SARS-CoV-2感染具有针对性阻断作用。对不同冠状病毒阻断机制的差异性分析显示,荷叶对SARS-CoV的选择性高于SARS-CoV-2,生姜则对SARS-CoV-2更具针对性。白术缺乏直接阻断成分,但白术内酯Ⅲ、苍术酮和茅苍术醇等与免疫靶点大麻素受体2(CB2)有较强的潜在结合能力。结论扶正避瘟方中连翘、荷叶的单体成分连翘脂苷A、(-)-儿茶素、熊竹素等可作为潜在抗病毒成分进一步开发,白术中的白术内酯Ⅲ等可能通过结合免疫靶点CB2发挥免疫调控作用。
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关键词
扶正避瘟方
计算机辅助药物设计
新型冠状病毒
同源模建
靶点反向预测
大麻素受体2
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职称材料
题名
基于多靶点分子对接筛选金银花治疗非酒精性脂肪肝成分研究
被引量:
4
1
作者
陈成龙
郑明明
王玲娜
刘兰玲
张永清
李佳
赵东升
机构
山东中医药大学药学院
中国药科大学药学院
出处
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1341-1348,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFC1701503)资助
国家自然科学基金项目(81903750)资助
+2 种基金
山东省重大科技创新工程项目(2018CXGC0309)资助
山东省中医药科技发展计划项目(2019-0030)资助
山东中医药大学中药资源保护与质量评价青创团队支持项目资助。
文摘
整合多靶点分子对接和反向靶点预测技术探究金银花治疗非酒精性脂肪肝(NAFLD)物质基础及潜在机制。借助TCMSP、ETCM数据库并挖掘文献收集金银花成分,以PPARα、PPARδ及FXR受体为靶标,运用分子对接筛选金银花中活性化合物,反向靶点预测活性化合物潜在靶点,构建蛋白互作网络并进行生物功能和通路富集。11种金银花活性成分对3个靶标的亲和力高于阳性对照,野漆树苷与PPARα的结合能力最强,3,5-二-O-咖啡酰奎宁酸甲酯与PPARδ和FXR结合能力最强。初步获得金银花治疗NAFLD主要成分为黄酮类和酚酸类,其中野漆树苷、3,4-二-O-咖啡酰奎宁酸甲酯、3,5-二-O-咖啡酰奎宁酸甲酯、异绿原酸B发挥主要作用。筛选出的成分主要通过PI3K-Akt、MAPK和胰岛素信号通路特异地作用于肝、脂肪细胞和肝癌细胞发挥治疗NAFLD的作用。本研究基于多靶点分子对接技术筛选金银花治疗NAFLD活性成分,提示金银花酚酸类成分具有进一步开发成药物的潜力,为后续进一步研究开发治疗NAFLD的创新药物提供一定的理论基础。
关键词
多
靶
点
药物设计
反向
靶
点
预测
分子对接
金银花
非酒精性脂肪肝
Keywords
multi-target drug design
reverse target prediction
molecular docking
honeysuckle
nonalcoholic fatty liver disease
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
基于计算机辅助药物设计探究扶正避瘟方预防新型冠状病毒感染的物质基础及分子机制
被引量:
6
2
作者
靳晓杰
王菲
毛建军
王燕如
关瑞宁
刘东玲
魏本君
李亚玲
张利英
张志明
刘永琦
机构
甘肃中医药大学药学院
甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室
甘肃中医药大学附属医院
甘肃中医药大学敦煌医学与转化教育部重点实验室
出处
《中国中医药信息杂志》
CAS
CSCD
2021年第3期19-26,共8页
基金
甘肃省科技计划(20YF2FA017)
甘肃中医药大学新型冠状病毒感染的肺炎应急防治专项(2020XGZX-02)
+1 种基金
甘肃省重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室新型冠状病毒防治研究专项开放基金(FZYX20-1、FZYX20-2、FZYX20-3)
敦煌医学与转化教育部重点实验室开放基金(DHYX18-09)。
文摘
目的从抑制病毒感染不同靶点的选择性、调控机体免疫因子的角度出发,系统研究扶正避瘟方预防新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的物质基础及分子机制。方法采用计算机辅助药物设计中的同源模建、分子对接等方法,对扶正避瘟方中各药味的化合物进行基于分子对接的虚拟筛选。运用靶点反向预测及其KEGG通路,分析方中健脾药白术对机体抵御病毒的潜在靶点和分子机制,并进行分子对接验证。结果扶正避瘟方中阻断SARS-CoV-2入侵的活性成分有84个,连翘、生姜、荷叶、黄芪对SARS-CoV-2感染具有针对性阻断作用。对不同冠状病毒阻断机制的差异性分析显示,荷叶对SARS-CoV的选择性高于SARS-CoV-2,生姜则对SARS-CoV-2更具针对性。白术缺乏直接阻断成分,但白术内酯Ⅲ、苍术酮和茅苍术醇等与免疫靶点大麻素受体2(CB2)有较强的潜在结合能力。结论扶正避瘟方中连翘、荷叶的单体成分连翘脂苷A、(-)-儿茶素、熊竹素等可作为潜在抗病毒成分进一步开发,白术中的白术内酯Ⅲ等可能通过结合免疫靶点CB2发挥免疫调控作用。
关键词
扶正避瘟方
计算机辅助药物设计
新型冠状病毒
同源模建
靶点反向预测
大麻素受体2
Keywords
Fuzheng Biwen Prescription
computer aided drug design
SARS-CoV-2
homologous modeling
reverse target prediction
cannabinoid receptor 2
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于多靶点分子对接筛选金银花治疗非酒精性脂肪肝成分研究
陈成龙
郑明明
王玲娜
刘兰玲
张永清
李佳
赵东升
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
下载PDF
职称材料
2
基于计算机辅助药物设计探究扶正避瘟方预防新型冠状病毒感染的物质基础及分子机制
靳晓杰
王菲
毛建军
王燕如
关瑞宁
刘东玲
魏本君
李亚玲
张利英
张志明
刘永琦
《中国中医药信息杂志》
CAS
CSCD
2021
6
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职称材料
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