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16S rRNA基因测序技术分析肝阳上亢型脑出血患者的肠道菌群结构
被引量:
14
1
作者
李裕思
许华冲
+6 位作者
王俊月
郑凡超
邓力
黎敬波
陈龙娇
袁淮涛
陈孝银
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期83-88,共6页
目的:探讨肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人群的肠道菌群差异。方法:选取2018年于广州中医药大学第一附属医院颅脑科病房收治的9例肝阳上亢型急性脑出血患者的粪便样本为观察组,同时,选取体检的6例健康人粪便样本为对照组,提取两组样...
目的:探讨肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人群的肠道菌群差异。方法:选取2018年于广州中医药大学第一附属医院颅脑科病房收治的9例肝阳上亢型急性脑出血患者的粪便样本为观察组,同时,选取体检的6例健康人粪便样本为对照组,提取两组样本中细菌总DNA,根据16S rRNA V4区设计引物进行扩增,通过Illumina MiSeq平台进行双端测序(paired-end),通过生物信息分析软件对测序结果进行分析,比较两组样本菌群组成和结构。结果:操作分类单元(OTU)的韦恩图分析(Venn分析)显示观察组与对照组之间OTU数目存在明显差异。偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)显示肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人在肠道菌群组成上具有明显差异。物种及其丰度分析上,门分类水平上观察组厚壁菌门与拟杆菌门的相对丰度比值(F/B)较正常组明显增加,其中疣微菌门的相对丰度明显低于对照组(P <0. 05)。属分类水平上,两组的普雷沃氏菌属、拟杆菌属、阿克曼氏菌属、布劳特氏菌属、氨基酸球菌属相对丰度差异有统计学意义(P <0. 05,P <0. 01),其中观察组拟杆菌属和普雷沃氏菌属的相对丰度比值(B/P)显著高于对照组。种分类水平上两组在普氏菌、阿克曼粘细菌、卵形拟杆菌、脆弱拟杆菌、伶俐瘤胃球菌上具有明显差异(P <0. 05,P <0. 01)。主坐标分析显示两组样本被显著分开,说明两组样本菌群结构存在显著差异。结论:肝阳上亢型急性脑出血与肠道菌群结构紊乱有关,其中普氏菌和阿克曼粘细菌的相对丰度下降是其发生的主要原因。
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关键词
16S
rRNA基因测序技术
肝阳上亢
急性脑出血
菌群结构
肠道菌群
韦恩分析
物种水平
原文传递
题名
16S rRNA基因测序技术分析肝阳上亢型脑出血患者的肠道菌群结构
被引量:
14
1
作者
李裕思
许华冲
王俊月
郑凡超
邓力
黎敬波
陈龙娇
袁淮涛
陈孝银
机构
广州中医药大学基础医学院
暨南大学中医学院
广州中医药大学第二临床医学院
广州中医药大学第一附属医院
出处
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期83-88,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81830114
81774164
+1 种基金
81473557)
广东省自然科学基金项目(2017A030313737)
文摘
目的:探讨肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人群的肠道菌群差异。方法:选取2018年于广州中医药大学第一附属医院颅脑科病房收治的9例肝阳上亢型急性脑出血患者的粪便样本为观察组,同时,选取体检的6例健康人粪便样本为对照组,提取两组样本中细菌总DNA,根据16S rRNA V4区设计引物进行扩增,通过Illumina MiSeq平台进行双端测序(paired-end),通过生物信息分析软件对测序结果进行分析,比较两组样本菌群组成和结构。结果:操作分类单元(OTU)的韦恩图分析(Venn分析)显示观察组与对照组之间OTU数目存在明显差异。偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)显示肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人在肠道菌群组成上具有明显差异。物种及其丰度分析上,门分类水平上观察组厚壁菌门与拟杆菌门的相对丰度比值(F/B)较正常组明显增加,其中疣微菌门的相对丰度明显低于对照组(P <0. 05)。属分类水平上,两组的普雷沃氏菌属、拟杆菌属、阿克曼氏菌属、布劳特氏菌属、氨基酸球菌属相对丰度差异有统计学意义(P <0. 05,P <0. 01),其中观察组拟杆菌属和普雷沃氏菌属的相对丰度比值(B/P)显著高于对照组。种分类水平上两组在普氏菌、阿克曼粘细菌、卵形拟杆菌、脆弱拟杆菌、伶俐瘤胃球菌上具有明显差异(P <0. 05,P <0. 01)。主坐标分析显示两组样本被显著分开,说明两组样本菌群结构存在显著差异。结论:肝阳上亢型急性脑出血与肠道菌群结构紊乱有关,其中普氏菌和阿克曼粘细菌的相对丰度下降是其发生的主要原因。
关键词
16S
rRNA基因测序技术
肝阳上亢
急性脑出血
菌群结构
肠道菌群
韦恩分析
物种水平
Keywords
16S rRNA gene sequencing technology
hyperactivity of liver-Yang
acute cerebral hemorrhage
flora structure
intestinal flora
Venn analysis
species level
分类号
R743.34 [医药卫生—神经病学与精神病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
16S rRNA基因测序技术分析肝阳上亢型脑出血患者的肠道菌群结构
李裕思
许华冲
王俊月
郑凡超
邓力
黎敬波
陈龙娇
袁淮涛
陈孝银
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
14
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