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白花丹参顺式还原酮加双氧酶基因的克隆、分子特征和表达调控分析
被引量:
4
1
作者
郝岗平
王健美
+1 位作者
史仁玖
张显忠
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期346-350,共5页
目的:获得白花丹参参与乙烯和多胺合成的顺式还原酮加双氧酶(acireductone dioxygenase,ARD)基因(命名为SmARD)序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:利用全长cDNA文库技术,从两年生白花丹参根中获得目的基因SmARD序列...
目的:获得白花丹参参与乙烯和多胺合成的顺式还原酮加双氧酶(acireductone dioxygenase,ARD)基因(命名为SmARD)序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:利用全长cDNA文库技术,从两年生白花丹参根中获得目的基因SmARD序列。利用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找该基因的开放读码框,prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在白花丹参幼苗根、茎、叶和成花中的表达情况。结果:得到688 bp的SmARD基因全长序列。具有一个591 bp的开放读码框,编码196个氨基酸,预测蛋白质相对分子质量23.27 kDa。使用预测的SmARD蛋白序列在NCBI中进行蛋白保守域分析,发现SmARD与ARD/ARD′家族具有很高的同源性。半定量RT-PCR表明,SmARD在白花丹参幼苗根、茎、叶和成花等组织中均有转录水平的表达,但是在根部表达最强。水分亏缺处理3 d,150 mmol.L-1NaCl处理1 d,4℃低温处理1 d和100μmol.L-1ABA处理1 d均抑制SmARD的表达,100μmol.L-1茉莉酸甲脂(MJ)和10μmol.L-1乙烯利(ETH)处理1 d诱导SmARD的表达。结论:首次得到白花丹参的顺式还原酮加双氧酶(ARD)基因序列,为其参与白花丹参响应逆境和次生代谢产物合成的信号调节功能研究奠定了基础。
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关键词
白花丹参
顺式
还原
酮
加
双氧
酶
(
ard
)
基因
序列分析
表达分析
原文传递
题名
白花丹参顺式还原酮加双氧酶基因的克隆、分子特征和表达调控分析
被引量:
4
1
作者
郝岗平
王健美
史仁玖
张显忠
机构
泰山医学院生物科学系
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期346-350,共5页
基金
山东省科攻关项目(2007GG2NS02051)
山东省自然科学基金项目(ZR2010CM063)
山东省中医药科技发展计划项目(2007-165)
文摘
目的:获得白花丹参参与乙烯和多胺合成的顺式还原酮加双氧酶(acireductone dioxygenase,ARD)基因(命名为SmARD)序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:利用全长cDNA文库技术,从两年生白花丹参根中获得目的基因SmARD序列。利用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找该基因的开放读码框,prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在白花丹参幼苗根、茎、叶和成花中的表达情况。结果:得到688 bp的SmARD基因全长序列。具有一个591 bp的开放读码框,编码196个氨基酸,预测蛋白质相对分子质量23.27 kDa。使用预测的SmARD蛋白序列在NCBI中进行蛋白保守域分析,发现SmARD与ARD/ARD′家族具有很高的同源性。半定量RT-PCR表明,SmARD在白花丹参幼苗根、茎、叶和成花等组织中均有转录水平的表达,但是在根部表达最强。水分亏缺处理3 d,150 mmol.L-1NaCl处理1 d,4℃低温处理1 d和100μmol.L-1ABA处理1 d均抑制SmARD的表达,100μmol.L-1茉莉酸甲脂(MJ)和10μmol.L-1乙烯利(ETH)处理1 d诱导SmARD的表达。结论:首次得到白花丹参的顺式还原酮加双氧酶(ARD)基因序列,为其参与白花丹参响应逆境和次生代谢产物合成的信号调节功能研究奠定了基础。
关键词
白花丹参
顺式
还原
酮
加
双氧
酶
(
ard
)
基因
序列分析
表达分析
Keywords
Salvia miltiorrhiza
acireductone dioxygenase (
ard
) gene
sequence analysis
expression analysis
分类号
S567.53 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
白花丹参顺式还原酮加双氧酶基因的克隆、分子特征和表达调控分析
郝岗平
王健美
史仁玖
张显忠
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
原文传递
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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