为了探讨5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,m5C)相关基因在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)患者治疗及预后中的潜在价值,构建了基于m5C相关基因的预后预测模型,用于评估TNBC患者的预后和生存状况。从基因表达总库(gene ...为了探讨5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,m5C)相关基因在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)患者治疗及预后中的潜在价值,构建了基于m5C相关基因的预后预测模型,用于评估TNBC患者的预后和生存状况。从基因表达总库(gene expression omnibus,GEO)数据库和癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载TNBC基因表达谱和相应的临床数据。通过Pearson分析确定了99个m5C相关基因,进一步采用单因素Cox分析鉴定出5个与预后有关的m5C相关基因(SLC6A14、BCL11A、UGT8、LMO4、PSAT1)并构建了风险评分(risk score)预测模型,根据风险评分中位值将患者划分为高风险组和低风险组。使用Kaplan-Meier(K-M)生存分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、多变量Cox回归分析、构建列线图和校准曲线评估了模型的预测效能。训练集和验证集的K-M生存曲线、受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)分析均验证了模型具有良好的预测能力。多变量Cox回归分析显示,风险评分可作为独立的预后生物标志物。使用ssGSEA、免疫评分分析和化疗药物对高低风险组患者的半最大抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)值差异分析显示,免疫细胞和免疫检查点基因以及大多数化疗药物的IC50值在不同风险组之间的表达存在显著差异。研究结果构建了基于5个m5C相关基因的风险评分预后预测模型,这将有助于阐明TNBC中m5C相关基因的作用机制,进而提供更有价值的预后及诊断的生物标志物和潜在的治疗靶点,为TNBC患者临床个性化治疗提供理论指导。展开更多
文摘为了探讨5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,m5C)相关基因在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)患者治疗及预后中的潜在价值,构建了基于m5C相关基因的预后预测模型,用于评估TNBC患者的预后和生存状况。从基因表达总库(gene expression omnibus,GEO)数据库和癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载TNBC基因表达谱和相应的临床数据。通过Pearson分析确定了99个m5C相关基因,进一步采用单因素Cox分析鉴定出5个与预后有关的m5C相关基因(SLC6A14、BCL11A、UGT8、LMO4、PSAT1)并构建了风险评分(risk score)预测模型,根据风险评分中位值将患者划分为高风险组和低风险组。使用Kaplan-Meier(K-M)生存分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、多变量Cox回归分析、构建列线图和校准曲线评估了模型的预测效能。训练集和验证集的K-M生存曲线、受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)分析均验证了模型具有良好的预测能力。多变量Cox回归分析显示,风险评分可作为独立的预后生物标志物。使用ssGSEA、免疫评分分析和化疗药物对高低风险组患者的半最大抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)值差异分析显示,免疫细胞和免疫检查点基因以及大多数化疗药物的IC50值在不同风险组之间的表达存在显著差异。研究结果构建了基于5个m5C相关基因的风险评分预后预测模型,这将有助于阐明TNBC中m5C相关基因的作用机制,进而提供更有价值的预后及诊断的生物标志物和潜在的治疗靶点,为TNBC患者临床个性化治疗提供理论指导。
文摘目的:探讨血清血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)对前列腺癌患者术后预后不良的预测价值。方法:前列腺癌患者80例,依据随访1年期间是否出现复发、新转移及死亡,分为预后良好组52例和预后不良组28例。比较两组患者临床特征,将有统计学意义的变量纳入二项Logistic回归方程,分析预后不良的相关危险因素及独立高危因素。采用Pearson相关系数分析术前血清VEGF水平与年龄、术前转移及血清前列腺特异性抗原(prostate specific antigen,PSA)水平的相关性。应用ROC曲线分析血清VEGF、PSA以及VEGF+PSA联合预测模型对预后不良的预测价值。结果:预后不良组年龄、术前转移率、血清VEGF及PSA水平分别为75.43±6.40岁、46.43%、28.72±8.47 ng/mL和16.47±3.84 ng/mL,高于预后良好组的74.5±65.82岁、23.81%、23.02±8.74 ng/mL和12.70±3.96 ng/mL,差异均具有统计学意义(P<0.05)。高龄、术前转移、术前血清PSA高、术前血清VEGF高是前列腺癌术后预后不良的相关危险因素(P<0.05),术前转移、血清PSA水平高是前列腺癌术后预后不良的独立危险因素(P<0.05)。术前血清VEGF与PSA水平成正相关(r=094,P<0.05)。ROC曲线分析显示,VEGF+PSA联合预测模型的曲线下面积(area under the curve,AUC)、特异度、准确率、阳性预测值明显高于血清VEGF及PSA,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:血清VEGF升高是前列腺癌术后预后不良的相关危险因素,血清VEGF、PSA水平对前列腺癌术后预后不良均有一定的预测价值,两者联合能明显提高预测效能。