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颜氏大疣蛛毒腺转录组学研究
1
作者
顾小亮
殷文豪
+6 位作者
酉勇明
吴亚应
丁丽君
王颖
巫秀美
张成桂
杨自忠
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023年第3期719-730,共12页
颜氏大疣蛛Macrothele yani个体大、毒性强、易取毒,是农林生态系统中害虫的重要天敌,也是天然药物研究工作者进行新药挖掘和毒液开发利用的重要选择对象。本研究利用高通量测序平台Illumina Hiseq 2000对颜氏大疣蛛雌雄成体的毒腺进行...
颜氏大疣蛛Macrothele yani个体大、毒性强、易取毒,是农林生态系统中害虫的重要天敌,也是天然药物研究工作者进行新药挖掘和毒液开发利用的重要选择对象。本研究利用高通量测序平台Illumina Hiseq 2000对颜氏大疣蛛雌雄成体的毒腺进行转录组测序和生物信息学分析,共获得转录组样本数据37.8 G,总计301 024条unigenes,总长度170 512 372 bp,最短201 bp,最长36 105 bp,平均长度566 bp,GC含量平均值为38.17%,N50长度为705 bp。将unigenes序列与NR(非冗余蛋白序列数据库)、String(蛋白质相互作用数据库)、Swiss-prot(蛋白质序列数据库)、Pfam(蛋白质家族数据库)、GO(基因本体论)、KOG(真核生物蛋白质直系同源数据库)、KEGG(京都基因与基因组百科全书)数据库进行比对(e≤10^(-10)),分别获得31 409、6 549、11 817、8 216、11 480、7 804条unigenes注释。通过生物信息学对雌雄颜氏大疣蛛unigenes进行表达量分析,筛选高表达量且高可信度的差异表达基因,并进行对这些差异基因进行GO和KEGG功能富集分析;与雄蛛相比,雌成体有205条unigenes表达量上调,113条unigenes表达量下调。最后在所有的转录本数据中共比对到68条毒素相关序列。本研究获得的颜氏大疣蛛转录组信息,为颜氏大疣蛛的功能基因挖掘提供了重要的信息资源。
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关键词
颜氏大疣蛛
高通量测序
转录组
差异表达基因
生物信息学
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职称材料
颜氏大疣蛛蛛毒中多肽和蛋白质的多样性分析
被引量:
3
2
作者
王梦如
张秀清
+4 位作者
王颖
周思彤
杨自忠
李龙星
杨志斌
《四川动物》
北大核心
2019年第4期408-414,共7页
对颜氏大疣蛛Macrothele yani蛛毒所富含的多肽与蛋白质多样性进行探索,采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳和超高效液相色谱-电喷雾-四极杆-飞行时间质谱技术分离和鉴定颜氏大疣蛛蛛毒中的蛋白质和多肽,并对其相对分子质量分布多...
对颜氏大疣蛛Macrothele yani蛛毒所富含的多肽与蛋白质多样性进行探索,采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳和超高效液相色谱-电喷雾-四极杆-飞行时间质谱技术分离和鉴定颜氏大疣蛛蛛毒中的蛋白质和多肽,并对其相对分子质量分布多样性进行分析。结果显示:粗毒中所含蛋白质的相对分子质量主要分布在35kDa以上。在17~135kDa分离度较佳的共有11条电泳条带,主要集中于40~120kDa附近;在75kDa附近弥散着高丰度的蛋白条带,75kDa以上的蛋白质最丰富。粗毒经色谱分离后得到超过50个色谱峰,经质谱鉴定得到121个物质成分,其中,多肽类物质的相对分子质量呈双峰式分布,21%分布在500~2000 Da,76%分布在3000~5000Da,为粗毒中多肽含量最丰富的部分,且集中于35~60min的保留时间内被洗脱。研究结果表明,颜氏大疣蛛蛛毒中含有较为丰富的多肽和蛋白类物质,这些物质的相对分子质量分布特征与已报道的其他蜘蛛既有相似性又存在具体差异。本文展示了颜氏大疣蛛蛛毒的分子多样性,为后续该毒素的物质基础研究及药用价值开发提供参考。
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关键词
颜氏大疣蛛
蛛
毒
多肽
蛋白质
多样性
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职称材料
颜氏大疣蛛中挥发油、氨基酸及微量元素分析
3
作者
代欣桃
李文锐
+2 位作者
闻焜
杨志斌
杨自忠
《中国现代应用药学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期608-613,共6页
目的分析鉴定颜氏大疣蛛中的化学成分并测定含量。方法采用水蒸气蒸馏法和索氏提取法提取挥发油,并用GC-MS进行分析鉴定;全自动氨基酸分析仪测定水解后氨基酸的含量;ICP-MS测定微量元素的含量。结果水蒸气蒸馏法提取的挥发油共鉴定出22...
目的分析鉴定颜氏大疣蛛中的化学成分并测定含量。方法采用水蒸气蒸馏法和索氏提取法提取挥发油,并用GC-MS进行分析鉴定;全自动氨基酸分析仪测定水解后氨基酸的含量;ICP-MS测定微量元素的含量。结果水蒸气蒸馏法提取的挥发油共鉴定出22个化合物,索氏提取法18个化合物,共有化合物7个,其中油酸乙酯、亚油酸乙酯、十八酸乙酯含量较高;颜氏大疣蛛中含有16种氨基酸,包括7种人体必需氨基酸,氨基酸总量为10.53%,谷氨酸和精氨酸含量较高;富含11种人体必需微量元素,其中Zn、Fe、Mn含量较高,重金属元素As和Pb的含量符合限度要求,Cd和Cu的含量超出限度要求。结论经鉴定2种方法提取的挥发油含量和成分具有一定的差异,其中一些成分具有一定的药用功效,此外,颜氏大疣蛛中还含有多种人体必需的氨基酸和微量元素。
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关键词
颜氏大疣蛛
挥发油
氨基酸
微量元素
气质联用
电感耦合电离子体质谱
原文传递
题名
颜氏大疣蛛毒腺转录组学研究
1
作者
顾小亮
殷文豪
酉勇明
吴亚应
丁丽君
王颖
巫秀美
张成桂
杨自忠
机构
大理大学昆虫生物医药研究院昆虫生物医药研发重点实验室
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023年第3期719-730,共12页
基金
云南省重大科技专项(202002AA100007)。
文摘
颜氏大疣蛛Macrothele yani个体大、毒性强、易取毒,是农林生态系统中害虫的重要天敌,也是天然药物研究工作者进行新药挖掘和毒液开发利用的重要选择对象。本研究利用高通量测序平台Illumina Hiseq 2000对颜氏大疣蛛雌雄成体的毒腺进行转录组测序和生物信息学分析,共获得转录组样本数据37.8 G,总计301 024条unigenes,总长度170 512 372 bp,最短201 bp,最长36 105 bp,平均长度566 bp,GC含量平均值为38.17%,N50长度为705 bp。将unigenes序列与NR(非冗余蛋白序列数据库)、String(蛋白质相互作用数据库)、Swiss-prot(蛋白质序列数据库)、Pfam(蛋白质家族数据库)、GO(基因本体论)、KOG(真核生物蛋白质直系同源数据库)、KEGG(京都基因与基因组百科全书)数据库进行比对(e≤10^(-10)),分别获得31 409、6 549、11 817、8 216、11 480、7 804条unigenes注释。通过生物信息学对雌雄颜氏大疣蛛unigenes进行表达量分析,筛选高表达量且高可信度的差异表达基因,并进行对这些差异基因进行GO和KEGG功能富集分析;与雄蛛相比,雌成体有205条unigenes表达量上调,113条unigenes表达量下调。最后在所有的转录本数据中共比对到68条毒素相关序列。本研究获得的颜氏大疣蛛转录组信息,为颜氏大疣蛛的功能基因挖掘提供了重要的信息资源。
关键词
颜氏大疣蛛
高通量测序
转录组
差异表达基因
生物信息学
Keywords
Macrothele yani
high-throughput sequencing
transcriptome
differential expressed genes
bioinformatics
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
S476 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
颜氏大疣蛛蛛毒中多肽和蛋白质的多样性分析
被引量:
3
2
作者
王梦如
张秀清
王颖
周思彤
杨自忠
李龙星
杨志斌
机构
云南省昆虫生物医药研发重点实验室
药用特种昆虫开发国家地方联合工程研究中心
中国西南药用昆虫及蛛形类资源开发利用协同创新中心
大理大学分析测试中心
出处
《四川动物》
北大核心
2019年第4期408-414,共7页
基金
国家地方联合工程研究中心创新能力建设项目(云发改高技[2015]395)
云南省科技创新平台建设项目(2015DG030)
+1 种基金
云南省应用基础研究重点项目(2016FA012)
云南省应用基础研究青年项目(2016FD074)
文摘
对颜氏大疣蛛Macrothele yani蛛毒所富含的多肽与蛋白质多样性进行探索,采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳和超高效液相色谱-电喷雾-四极杆-飞行时间质谱技术分离和鉴定颜氏大疣蛛蛛毒中的蛋白质和多肽,并对其相对分子质量分布多样性进行分析。结果显示:粗毒中所含蛋白质的相对分子质量主要分布在35kDa以上。在17~135kDa分离度较佳的共有11条电泳条带,主要集中于40~120kDa附近;在75kDa附近弥散着高丰度的蛋白条带,75kDa以上的蛋白质最丰富。粗毒经色谱分离后得到超过50个色谱峰,经质谱鉴定得到121个物质成分,其中,多肽类物质的相对分子质量呈双峰式分布,21%分布在500~2000 Da,76%分布在3000~5000Da,为粗毒中多肽含量最丰富的部分,且集中于35~60min的保留时间内被洗脱。研究结果表明,颜氏大疣蛛蛛毒中含有较为丰富的多肽和蛋白类物质,这些物质的相对分子质量分布特征与已报道的其他蜘蛛既有相似性又存在具体差异。本文展示了颜氏大疣蛛蛛毒的分子多样性,为后续该毒素的物质基础研究及药用价值开发提供参考。
关键词
颜氏大疣蛛
蛛
毒
多肽
蛋白质
多样性
Keywords
Macrothele yani
spider venom
peptides
proteins
diversity
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
Q95 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
颜氏大疣蛛中挥发油、氨基酸及微量元素分析
3
作者
代欣桃
李文锐
闻焜
杨志斌
杨自忠
机构
大理大学云南省昆虫生物医药研发重点实验室
大理大学中国西南药用昆虫及蛛形类资源开发利用
大理大学药用特种昆虫开发国家地方联合工程研究中心
大理州食品药品检验所
出处
《中国现代应用药学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期608-613,共6页
基金
云南省科技计划项目(2016FA012)
云南省中药饮片产业发展专项(2019-YG-067)
+1 种基金
云南省重大科技专项(生物医药)(202002AA100007)
大理州重点科技支撑专项计划(D2019NA01)。
文摘
目的分析鉴定颜氏大疣蛛中的化学成分并测定含量。方法采用水蒸气蒸馏法和索氏提取法提取挥发油,并用GC-MS进行分析鉴定;全自动氨基酸分析仪测定水解后氨基酸的含量;ICP-MS测定微量元素的含量。结果水蒸气蒸馏法提取的挥发油共鉴定出22个化合物,索氏提取法18个化合物,共有化合物7个,其中油酸乙酯、亚油酸乙酯、十八酸乙酯含量较高;颜氏大疣蛛中含有16种氨基酸,包括7种人体必需氨基酸,氨基酸总量为10.53%,谷氨酸和精氨酸含量较高;富含11种人体必需微量元素,其中Zn、Fe、Mn含量较高,重金属元素As和Pb的含量符合限度要求,Cd和Cu的含量超出限度要求。结论经鉴定2种方法提取的挥发油含量和成分具有一定的差异,其中一些成分具有一定的药用功效,此外,颜氏大疣蛛中还含有多种人体必需的氨基酸和微量元素。
关键词
颜氏大疣蛛
挥发油
氨基酸
微量元素
气质联用
电感耦合电离子体质谱
Keywords
Macrothele yani
volatile oils
amino acids
trace elements
GC-MS
ICP-MS
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
颜氏大疣蛛毒腺转录组学研究
顾小亮
殷文豪
酉勇明
吴亚应
丁丽君
王颖
巫秀美
张成桂
杨自忠
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
颜氏大疣蛛蛛毒中多肽和蛋白质的多样性分析
王梦如
张秀清
王颖
周思彤
杨自忠
李龙星
杨志斌
《四川动物》
北大核心
2019
3
下载PDF
职称材料
3
颜氏大疣蛛中挥发油、氨基酸及微量元素分析
代欣桃
李文锐
闻焜
杨志斌
杨自忠
《中国现代应用药学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
原文传递
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