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间充质干细胞恶性转化相关关键基因的生物信息学分析
被引量:
5
1
作者
骆亚莉
刘永琦
+5 位作者
安方玉
任春贞
李玲
李程豪
赵娜
赵枫
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2017年第4期329-336,369,共9页
筛选间充质干细胞发生恶性转化相关的关键基因,可为进一步的相关性研究提供参考和依据。研究首先基于文献挖掘的方法,从已公开发表的研究中统计出间充质干细胞发生恶性转化的相关基因,随后运用生物信息学方法对上述基因进行分析,同时用...
筛选间充质干细胞发生恶性转化相关的关键基因,可为进一步的相关性研究提供参考和依据。研究首先基于文献挖掘的方法,从已公开发表的研究中统计出间充质干细胞发生恶性转化的相关基因,随后运用生物信息学方法对上述基因进行分析,同时用在线软件构建基因所表达蛋白质的相互作用网络,并将相应网络进一步可视化处理,计算网络及各个节点的拓扑特性。结果显示,近年内的文献共涉及187个基因或其表达产物,有1 253种GO分类,KEGG通路分析显示,主要参与信号转导通路、细胞粘附、周期调节等;此外,共筛选出关键节点21个。生物信息学筛选的关键基因可用于提示间充质干细胞可能发生恶性转化的趋向,也有助于分析间充质干细胞恶性转化的可能机制。
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关键词
间充质干细胞(MSCs)
恶性转化
风险关键基因
生物信息学
文献数据挖掘
下载PDF
职称材料
题名
间充质干细胞恶性转化相关关键基因的生物信息学分析
被引量:
5
1
作者
骆亚莉
刘永琦
安方玉
任春贞
李玲
李程豪
赵娜
赵枫
机构
甘肃中医药大学基础医学院病理教研室
甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室
甘肃中医药大学公共卫生学院
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2017年第4期329-336,369,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(81360588
81760804)
文摘
筛选间充质干细胞发生恶性转化相关的关键基因,可为进一步的相关性研究提供参考和依据。研究首先基于文献挖掘的方法,从已公开发表的研究中统计出间充质干细胞发生恶性转化的相关基因,随后运用生物信息学方法对上述基因进行分析,同时用在线软件构建基因所表达蛋白质的相互作用网络,并将相应网络进一步可视化处理,计算网络及各个节点的拓扑特性。结果显示,近年内的文献共涉及187个基因或其表达产物,有1 253种GO分类,KEGG通路分析显示,主要参与信号转导通路、细胞粘附、周期调节等;此外,共筛选出关键节点21个。生物信息学筛选的关键基因可用于提示间充质干细胞可能发生恶性转化的趋向,也有助于分析间充质干细胞恶性转化的可能机制。
关键词
间充质干细胞(MSCs)
恶性转化
风险关键基因
生物信息学
文献数据挖掘
Keywords
mesenchymal stem cells (MSCs)
malignant transformation
risk-related key genes
bioinformatics
literature data mining
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
R34 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
间充质干细胞恶性转化相关关键基因的生物信息学分析
骆亚莉
刘永琦
安方玉
任春贞
李玲
李程豪
赵娜
赵枫
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2017
5
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职称材料
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参考文献
引证文献
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