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题名图形聚类算法的代谢网络模块化分析
被引量:7
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作者
侯静
宋安平
王卓
张武
李园园
李亦学
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机构
上海大学计算机工程与科学学院
上海交通大学生物医学仪器研究所
上海生物信息技术研究中心
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出处
《应用科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期588-592,共5页
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基金
国家"973"重点基础研究发展计划(2002CB713807
2004CB518606
+1 种基金
2003CB715900)
上海市科委重大基础(04DZ14003)资助项目
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文摘
代谢网络的研究是当今生物学研究中的新热点,使用图形聚类算法对代谢网络进行分析研究是一个有力的手段.文中提出了用图形聚类方法挖掘复杂代谢网络中蕴含的功能信息并进行模块相似性分析的方法,从系统生物学角度揭示光合作用的进化.介绍了马尔可夫聚类算法和模拟退火聚类算法两种图形聚类方法;给出了两种方法对叶绿体和蓝细菌的代谢网络进行聚类的结果;定义了模块相似度评价指标,挖掘叶绿体和蓝细菌间保守的功能模块,并对其网络结构进行了比较分析.
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关键词
代谢网络
马尔可夫聚类算法
模拟退火聚类算法
模块相似度
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Keywords
metabolic network
Markov clustering
simulated annealing clustering
module similarity
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分类号
TP301.6
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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题名基于多域的互联网物理对象关联分析方法研究
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作者
张毅
杜秀春
刘欣
刘华富
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机构
国防科学技术大学计算机学院
长沙学院数学与计算机科学系
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出处
《计算机技术与发展》
2018年第4期25-30,共6页
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基金
国家自然科学基金(61572514
61379117)
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文摘
随着物联网技术的发展应用,越来越多的物理对象能被远程主机感知发现,相关物理对象的属性信息能被搜集和表示,但目前对于物理对象属性信息的分析和研究还不够系统全面。为深入研究物理对象,把物理对象的属性信息分为社会域、信息域和物理域三个多域层次,通过融合分析物理对象的多域属性信息,发掘物理对象之间的关联特性,能找出网络空间中物理对象之间隐含的关联情况。综合物理对象不同域中的属性信息,建立不同的关联计算方法得出物理对象多域关联关系矩阵,最后结合改进的马尔可夫聚类算法综合分析物理对象之间的关联关系。实验结果表明,该方法在物理对象融合关联分析方面有较好的聚类效果。
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关键词
物理对象
多域信息
网络图
马尔可夫聚类算法
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Keywords
physical object
multi-domain information
network diagram
Markov clustering algorithm
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分类号
TP301
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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题名基于情境感知的广播电视群组发现策略
被引量:4
- 3
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作者
陈建
王子磊
奚宏生
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机构
中国科学技术大学自动化系
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出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期140-145,共6页
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基金
国家自然科学基金(61233003
61673362)
+1 种基金
中央高校基本科研业务费
中国科学院青年创新促进会联合基金
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文摘
为解决广播用户收视兴趣复合性问题,提出一种基于时间情境感知的电视用户群组发现策略。采用张量分解获取节目和收视时间的隐性特征矩阵,利用马尔可夫聚类算法实现对记录的分类,并根据记录分类结果发现用户群组,用户组群以家庭用户为单位,识别出特定时段具有相似观看兴趣的所有家庭用户,并针对家庭用户群组实现节目推荐功能。实验结果表明,该策略可减小组内用户与群组整体在观看兴趣方面的平均绝对误差,并提高组内成员的观看兴趣相似度。
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关键词
推荐系统
协同过滤
情境感知
张量分解
马尔可夫聚类算法
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Keywords
recommender system
collaborative filtering
context awareness
tensor decomposition
Markov clustering algorithm
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分类号
TP18
[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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