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小麦SKC1-like基因的克隆及多样性研究 被引量:3
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作者 李孟军 高欣娜 +1 位作者 史占良 郭进考 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期597-602,共6页
为了给小麦耐盐分子机制的研究提供参考,以水稻(Oryza sativa L.)耐盐相关数量性状基因SKC1(Shoot K+Content)的cDNA序列(GenBank登录号:DQ148410)为基础,通过搜索GenBank数据库找到2条与OsSKC1同源的普通小麦(Triticum aestivum L.)EST... 为了给小麦耐盐分子机制的研究提供参考,以水稻(Oryza sativa L.)耐盐相关数量性状基因SKC1(Shoot K+Content)的cDNA序列(GenBank登录号:DQ148410)为基础,通过搜索GenBank数据库找到2条与OsSKC1同源的普通小麦(Triticum aestivum L.)EST(GenBank登录号:DR734861,CK193616)。根据EST-DR734861设计引物筛选粗山羊草AL8/78(Aegilops squarrosa)BAC文库,通过BAC延伸测序克隆了粗山羊草AL8/78的SKC1-like基因(AeSKC1),进一步根据AeSKC1序列设计特异引物克隆了普通小麦SKC1-like基因(TaSKC1)。对人工合成双二倍体、地方品种和育成品种中TaSKC1的基因多样性分析表明,在驯化过程中TaSKC1瓶颈效应明显,属于驯化基因。 展开更多
关键词 小麦 SKC1 驯化基因
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小麦高亲和性钾转运蛋白基因(HKT1)多样性分析与染色体定位 被引量:4
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作者 李孟军 李亚青 张磊 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2015年第5期1-6,共6页
为了研究HKT1在普通小麦及其野生近缘种中的自然多样性,揭示HKT1结构与功能的关系,采用克隆测序的方法对38份普通小麦和13份小麦野生近缘种HKT1基因组序列进行了分析。在38份普通小麦材料中共发现5种HKT1序列,分别命名为HKT1-1-HKT1-5,... 为了研究HKT1在普通小麦及其野生近缘种中的自然多样性,揭示HKT1结构与功能的关系,采用克隆测序的方法对38份普通小麦和13份小麦野生近缘种HKT1基因组序列进行了分析。在38份普通小麦材料中共发现5种HKT1序列,分别命名为HKT1-1-HKT1-5,其中29份材料仅含有1种类型HKT1。而在13份小麦野生近缘种中发现19种HKT1,其中根据HKT1基因组序列预测13种有完整读码框。普通六倍体小麦的核苷酸多样性仅相当于其野生近缘种的23.8%。这些结果表明,HKT1在小麦基因组中属于多拷贝基因,HKT1在栽培驯化过程中受到了选择,属于驯化基因。利用中国春小麦缺四体和W7984×Opata85作图群体,将HKT1基因定位于7B染色体长臂。 展开更多
关键词 小麦 HKT1 基因多样性 基因驯化
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转录因子ZnF-706在鳞翅目昆虫中的进化格局及在家蚕中的功能 被引量:3
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作者 崔勇 朱亚楠 +4 位作者 黄悦莹 谭丽庄 冯启理 王文 相辉 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期9-20,共12页
【目的】探讨家蚕Bombyx mori的潜在驯化基因——转录因子ZnF-706在鳞翅目(Lepidoptera)昆虫进化过程及家蚕驯化过程中的分子进化格局;并基于CRISPR/Cas9家蚕基因组编辑平台,探讨ZnF-706基因在家蚕中的功能。【方法】首先分析了家蚕ZnF-... 【目的】探讨家蚕Bombyx mori的潜在驯化基因——转录因子ZnF-706在鳞翅目(Lepidoptera)昆虫进化过程及家蚕驯化过程中的分子进化格局;并基于CRISPR/Cas9家蚕基因组编辑平台,探讨ZnF-706基因在家蚕中的功能。【方法】首先分析了家蚕ZnF-706序列特征,并利用已发表芯片数据调研该基因在家蚕幼虫组织中的表达格局;利用Phylogenetic Analysis byMaximum Likelihood (PAML)分支检验方法,分析该基因在鳞翅目不同类群中的分子进化格局。基于已发表的家蚕-野桑蚕Bombyx mandarina群体基因组多态性数据,对ZnF-706进行基因区域人工选择信号分析;对ZnF-706基因上游2 kb的调控区域进行单核苷酸多态性位点频率检测,发掘在家蚕群体中固定下来的突变位点;针对突变位点所在区域进行转录因子结合活性预测。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除ZnF-706基因,获得纯和突变体;以野生型家蚕为对照,检测突变体的茧重及蛹重变化。【结果】家蚕ZnF-706的编码蛋白具有典型的锌指蛋白结构域。ZnF-706在家蚕5龄第3天幼虫各组织中广泛表达,尤其表皮、脂肪体和生殖腺中有很高的表达量;该基因在鳞翅目、蚕蛾总科(Bombycoidea)及天蚕Antherea yamamai 3个分支中均呈现快速进化信号,在家蚕中有强烈的人工选择信号。该基因所在基因组区域的家蚕-野桑蚕种群分歧度参数Fst明显升高,家蚕群体中的群体多样性π明显降低,表明它位于一个选择扫荡区域内;该基因在家蚕-野桑蚕中的9个SNP位点存在于上游调控区,并位于转录因子结合活性区域内。该基因的纯合家蚕突变体ΔZn F-706生存力减弱,并且茧重以及蛹重与野生型家蚕相比都显著降低。但与黑腹果蝇Drosophila melanogaster中不同的是,家蚕中该基因的突变并不致死。【结论】ZnF-706可能在鳞翅目尤其是泌丝昆虫中进化,并在家蚕驯化过程中受到选择压力,提示其对于特征性状茧丝的变异可能发挥作用。该基因可能通过对丝蛋白基因的直接调控,或通过影响家蚕的生长发育而间接地影响茧丝性状。本研究不仅为探究家养动物人工选择机制提供了来自昆虫类材料的独有证据,也为后续深入开展家蚕重要经济性状的转录调控研究提供线索。 展开更多
关键词 鳞翅目 家蚕 泌丝昆虫 驯化基因 转录因子 CRISPR/Cas9
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Acclimation-dependent expression of heat shock protein 70 in Pacific abalone (Haliotis discus hannai Ino) and its acute response to thermal exposure 被引量:5
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作者 LI Jiaqi HE Qingguo +1 位作者 SUN Hui LIU Xiao 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2012年第1期146-151,共6页
Heat shock protein 70 (Hsp70) is one important member of heat shock protein (Hsp) family that is responsible for various stresses, especially thermal stress. Here we examined the response of Hsp70 gene to both chr... Heat shock protein 70 (Hsp70) is one important member of heat shock protein (Hsp) family that is responsible for various stresses, especially thermal stress. Here we examined the response of Hsp70 gene to both chronic and acute thermal exposure in Pacific abalone (Haliotis discus hannai Ino). For the chronic exposure, abalones were maintained at 8, 12, 20, and 30∩ for four months and their mRNA levels were measured. The highest mRNA level of Hsp70 gene relative to actin gene was detected in the 30~C-acclimated group, followed by the 8~C-acclimated group and then the 12~C- and 20~C-acclimated groups. After the long-term acclimation, gills from each of the above acclimation groups were dissected and exposed to different temperatures between 8~C and 38~C for 30 min. Hsp70 expression in gills acclimated to different temperatures responded differentially to the same temperature exposure. The incubation temperature that induced maximum Hsp70 mRNA expression was higher in the higher temperature acclimation groups than lower temperature groups. Pacific abalones could alter the expression pattern of Hsp70 gene according to environmental thermal conditions, through which they deal with the stress of thermal variations. 展开更多
关键词 Haliotis discus hannai Ino heat shock cold stress HSP70 BIOMARKER
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