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高亚硝酸盐胁迫下日本囊对虾肝胰腺的转录组分析 被引量:1
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作者 陈亭君 栗志民 +2 位作者 袁乐 刘建勇 梁彩凤 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期287-306,共20页
为研究日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)耐高亚硝酸盐的分子调控机制,利用新一代高通量Illumina测序技术,对日本囊对虾在高亚硝酸盐胁迫下的肝胰腺进行转录组测序,通过对高质量序列的拼接组装以及功能基因的注释和分类,发掘与耐高亚... 为研究日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)耐高亚硝酸盐的分子调控机制,利用新一代高通量Illumina测序技术,对日本囊对虾在高亚硝酸盐胁迫下的肝胰腺进行转录组测序,通过对高质量序列的拼接组装以及功能基因的注释和分类,发掘与耐高亚硝酸盐相关性状的候选基因。实验结果表明:①10个文库共获得920785608个净读本,数据量为6.48G~7.34G。②Q30>93.07%。利用Trinity软件组装后获得46308条单基因簇,N50为1833 bp。③与对照组相比,高亚硝酸盐组分别识别出593、606、1089、497和988个差异表达基因。④对DEGs进行功能注释,得到与免疫和代谢相关的通路和基因。⑤采用qPCR对随机选择的9个差异基因(DPD、ABCH、ProPOb、ACADL、CYP2J、PAT4、BHMT、CLEC和PEPCK)在高亚硝酸盐胁迫下的表达情况进行检测,其表达量与转录组测序技术(RNA Sequencing,RNA-seq)趋势一致。本研究结果丰富了对虾cDNA数据库的信息,为日本囊对虾在高亚硝酸盐胁迫下的分子机制研究奠定了基础。 展开更多
关键词 日本囊对虾 转录组 高亚硝酸盐胁迫 荧光定量PCR(qRT-PCR) 差异基因表达
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高亚硝酸盐环境下不同生长速率凡纳滨对虾肠道微生物多样性研究
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作者 梁庆建 吴旭建 +3 位作者 林星浩 刘郑欣宇 刘媛 王维娜 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期2763-2775,共13页
【目的】高亚硝酸盐环境中饲养的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei),在养殖结束时其生长速率和体重往往差异较大。本研究旨在探讨在高亚硝酸盐环境下饲养的对虾生长速率与肠道菌群结构和功能的相关性。【方法】本研究通过收集高亚硝酸... 【目的】高亚硝酸盐环境中饲养的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei),在养殖结束时其生长速率和体重往往差异较大。本研究旨在探讨在高亚硝酸盐环境下饲养的对虾生长速率与肠道菌群结构和功能的相关性。【方法】本研究通过收集高亚硝酸盐条件下快速生长对虾(rapidly growing,RG)、正常生长对虾(normally growing,NG)和缓慢生长对虾(slowly growing,SG)的肠道和海水样品,通过16S rRNA基因测序、线性判别分析[line discriminant analysis(LDA)effect size,LEfSe]等进行分析。【结果】发现SG的细菌群落多样性与RG和NG不同。主坐标分析(principal coordinate analysis,PCoA)分析表明,NG的群落组成与RG比SG更相似。通过LEfSe差异分析发现,RG中火色杆菌科(Flammeovirgaceae)、黄杆菌科(Flavobacteraceae)和浮酶菌科(Planctomycetaceae)的丰度较高,而SG中脱硫弧菌科(Desulfovibrionaceae)、希瓦氏菌科(Shewanellaceae)和弧菌科(Vibrionaceae)的丰度显著增加。【结论】本研究发现,在高亚硝酸盐环境下,肠道微生物群落的氮代谢能力是造成对虾不同生长速度的原因。该研究将为虾的工业化养殖提供指导。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 高亚硝酸盐 16S rRNA 肠道微生物
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小清河口春季亚硝酸盐偏高问题探讨 被引量:4
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作者 张龙军 孙庆振 罗先香 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期111-116,共6页
2008年春季对莱州湾小清河口的走航调查发现,调查区域大部分水体的DOC,CODMn,NH4^+ -N,POi4^3- -P高于4类海水的限定值,处于严重污染状态。水体CHla的浓度范围在1.02-37.92μg/L之间,但DO饱和度却在23%~96%之间,盐度小于1... 2008年春季对莱州湾小清河口的走航调查发现,调查区域大部分水体的DOC,CODMn,NH4^+ -N,POi4^3- -P高于4类海水的限定值,处于严重污染状态。水体CHla的浓度范围在1.02-37.92μg/L之间,但DO饱和度却在23%~96%之间,盐度小于15水体的DO饱和度低于50%,水体缺氧严重。河口存在NO2^- -N含量偏高现象。由河口向外,NO2^- -N浓度逐渐增加,至盐度24.4的水体达到0.27mg/L的高值,NO2^- -N增加主要是NH4^+ -N的硝化反应产生的。NH4^+-N生成NO2^-N主要受DO和NH4^+-N比例与浓度的影响,DO饱和度在30%~70%,NH4^+ -N大于3.33mg/L的水体中NO2^--N生成速率最快。 展开更多
关键词 小清河口 硝化反应 亚硝酸盐
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鱼体细菌性出血病的诊治及水体亚硝酸盐过高的处理 被引量:1
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作者 胡玉松 冯本伟 袁泉 《现代农业科技》 2013年第14期260-260,263,共2页
介绍水产养殖过程中鱼体细菌性出血病的诊治及水体亚硝酸盐过高的处理方法,以供养殖户参考。
关键词 鱼类养殖 细菌性出血病 亚硝酸盐
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Soil Organic Carbon,Carbon Fractions and Nutrients as Affected by Land Use in Semi-Arid Region of Loess Plateau of China 被引量:21
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作者 LIU Xun,LI Feng-Min,LIU Da-Qian and SUN Guo-Jun Key Laboratory of Arid and Grassland Ecology of the Ministry of Education,School of Life Sciences,Lanzhou University,Lanzhou 730000 (China) 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期146-152,共7页
Cropland (CP),native grassland (NG) and two shrub land treatments which were converted from cropland in 1985:seabuckthorn (Hippophae rhamnoides L.) (ST),and branchytamarisk (Tamarix ramosissima) (BT) were investigated... Cropland (CP),native grassland (NG) and two shrub land treatments which were converted from cropland in 1985:seabuckthorn (Hippophae rhamnoides L.) (ST),and branchytamarisk (Tamarix ramosissima) (BT) were investigated to evaluate effects of land use conversion on soil organic carbon (SOC) and soil nutrients in the semi-arid region of the Loess Plateau of China.Total organic carbon (TOC),light fraction organic carbon (LFOC),heavy fraction organic carbon (HFOC),total N (TN),nitrate nitrogen (NO 3-N) and nitrite nitrogen (NO 2-N),ammonium nitrogen (NH + 4-N),total P,and available P (AP) were measured.The results showed that SOC in NG,ST and BT were 12.7%,27.7% and 34.8% higher than that of the cropland,respectively.LFOC,light fraction (LF) dry matter,ratio of TOC to TN (C/N) and the ratio of TOC to AP (C/P) were higher in the shrub land or native grassland than in the cropland.Cropland had the highest TN,the sum of NO 3-N and NO 2-N,TP and AP due to the use of chemical fertilizers.TOC significantly correlated with LFOC,HFOC and C/N.LFOC significantly correlated with dry matter of the LF and C/N.TN,the sum of NO 3-N and NO 2-N and AP were significantly negatively correlated with TOC and LFOC.Therefore,land use conversion from cropland to shrub land,or maybe grassland,contributed to SOC sequestration and improved soil nutrients stabilization. 展开更多
关键词 CROPLAND heavy fraction organic carbon light fraction organic carbon native grassland shrub land
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