高亚硝酸盐胁迫下日本囊对虾肝胰腺的转录组分析

为研究日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)耐高亚硝酸盐的分子调控机制,利用新一代高通量Illumina测序技术,对日本囊对虾在高亚硝酸盐胁迫下的肝胰腺进行转录组测序,通过对高质量序列的拼接组装以及功能基因的注释和分类,发掘与耐高亚硝酸盐相关性状的候选基因。实验结果表明:①10个文库共获得920785608个净读本,数据量为6.48G~7.34G。②Q30>93.07%。利用Trinity软件组装后获得46308条单基因簇,N50为1833 bp。③与对照组相比,高亚硝酸盐组分别识别出593、606、1089、497和988个差异表达基因。④对DEGs进行功能注释,得到与免疫和代谢相关的通路和基因。⑤采用qPCR对随机选择的9个差异基因(DPD、ABCH、ProPOb、ACADL、CYP2J、PAT4、BHMT、CLEC和PEPCK)在高亚硝酸盐胁迫下的表达情况进行检测,其表达量与转录组测序技术(RNA Sequencing,RNA-seq)趋势一致。本研究结果丰富了对虾cDNA数据库的信息,为日本囊对虾在高亚硝酸盐胁迫下的分子机制研究奠定了基础。