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獐茅HAK基因表达调控区的分离及其在水稻中的功能分析
被引量:
3
1
作者
张高华
王鹤
+3 位作者
王旭达
丰明
李怀梅
李树英
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期742-748,共7页
獐茅高亲和性K+转运蛋白基因(AlHAK1)是从单子叶禾本科盐生植物獐茅(Aeluropus littoralis(Gouan)Parl)中克隆,对于细胞营养和离子渗透调节起关键作用。为了进一步了解AlHAK1基因的表达调控机制,文章采用基因组步移法分离了AlHAK1基因...
獐茅高亲和性K+转运蛋白基因(AlHAK1)是从单子叶禾本科盐生植物獐茅(Aeluropus littoralis(Gouan)Parl)中克隆,对于细胞营养和离子渗透调节起关键作用。为了进一步了解AlHAK1基因的表达调控机制,文章采用基因组步移法分离了AlHAK1基因转录起始位点上游长度约1.3 kb的启动子区域。启动子顺式元件分析显示该序列具有典型的TATA和CAAT盒,以及一些与植物生长发育和环境响应相关的顺式元件。为了明确AlHAK1启动子的功能,将其与GUS基因融合构建到植物表达载体pCAMBIA1301上,通过农杆菌介导转化法导入水稻中。对转基因植株进行GUS组织化学染色,结果显示在转化AlHAK1启动子水稻的根、茎、叶、花药和内外稃部位均检测到GUS活性。GUS荧光定量分析显示AlHAK1启动子调节GUS表达活性低于组成型启动子CaMV35S和Ubiquitin,但其根部和茎部的GUS活性相对较高。对转化植株进行不同胁迫处理后检测GUS活性,结果表明受到ABA、干旱、高温的诱导后其茎部和根部GUS活性有所提高,推测位于该启动子-682 bp的HSE元件和-1 268 bp的MybBS元件可能在高温、ABA和干旱诱导的表达调控中起作用。
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关键词
獐茅
高
亲和
性
k
+
转运
蛋白
基因
(
hak
1)
启动子克隆
顺式元件分析
GUS组织化学染色
下载PDF
职称材料
甜菜BvHAK基因家族全基因组鉴定及其在盐处理下的表达分析
被引量:
4
2
作者
杨小涵
伍国强
+1 位作者
魏明
王北辰
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期3773-3789,共17页
高亲和性K^(+)转运蛋白(high-affinity K^(+)transporter,HAK)是植物中最重要的K^(+)转运蛋白家族之一,在植物K~+吸收和转运过程中发挥重要功能。为探究甜菜BvHAK基因家族成员生物学功能及基因表达模式,采用生物信息学手段,预测了蛋白...
高亲和性K^(+)转运蛋白(high-affinity K^(+)transporter,HAK)是植物中最重要的K^(+)转运蛋白家族之一,在植物K~+吸收和转运过程中发挥重要功能。为探究甜菜BvHAK基因家族成员生物学功能及基因表达模式,采用生物信息学手段,预测了蛋白质的理化性质、基因结构、染色体定位、系统进化、保守基序、三维结构、互作网络、启动子顺式作用元件,并通过qRT-PCR分析了盐胁迫下BvHAKs基因在甜菜不同组织中的表达水平。共鉴定出10个甜菜BvHAK基因家族成员,含有8-10个外显子、7-9个内含子;平均氨基酸个数为778.30,平均分子量为88.31kDa,等电点为5.38-9.41,跨膜区为11-14个。BvHAK4、-5、-7和-13定位在质膜,而其余定位在液泡膜。系统进化分析发现,高等植物HAK可分为5个簇,分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ簇,其中Ⅱ簇成员可进一步分为Ⅱa、Ⅱb和Ⅱc等3个亚簇;BvHAK家族成员则分布在前4簇,分别含有1、6、1和2个成员。甜菜BvHAK基因家族主要含有胁迫响应元件、激素响应元件和生长发育响应元件。进一步对BvHAK基因在盐处理下甜菜不同组织中的表达模式分析发现,50和100 mmol/L NaCl不同程度地诱导甜菜地上部和根部BvHAK基因家族成员的表达;高盐(150 mmol/L)则下调了其在地上部的表达水平。这些结果表明,BvHAK基因家族在响应盐胁迫过程中起重要作用。
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关键词
甜菜
高
亲和
性
k
~+
转运
蛋白
hak
基因
家族
顺式作用元件
耐盐
性
原文传递
题名
獐茅HAK基因表达调控区的分离及其在水稻中的功能分析
被引量:
3
1
作者
张高华
王鹤
王旭达
丰明
李怀梅
李树英
机构
辽宁省农业科学院大连生物技术研究所
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期742-748,共7页
基金
辽宁省博士科研启动基金(编号:20101054)资助
文摘
獐茅高亲和性K+转运蛋白基因(AlHAK1)是从单子叶禾本科盐生植物獐茅(Aeluropus littoralis(Gouan)Parl)中克隆,对于细胞营养和离子渗透调节起关键作用。为了进一步了解AlHAK1基因的表达调控机制,文章采用基因组步移法分离了AlHAK1基因转录起始位点上游长度约1.3 kb的启动子区域。启动子顺式元件分析显示该序列具有典型的TATA和CAAT盒,以及一些与植物生长发育和环境响应相关的顺式元件。为了明确AlHAK1启动子的功能,将其与GUS基因融合构建到植物表达载体pCAMBIA1301上,通过农杆菌介导转化法导入水稻中。对转基因植株进行GUS组织化学染色,结果显示在转化AlHAK1启动子水稻的根、茎、叶、花药和内外稃部位均检测到GUS活性。GUS荧光定量分析显示AlHAK1启动子调节GUS表达活性低于组成型启动子CaMV35S和Ubiquitin,但其根部和茎部的GUS活性相对较高。对转化植株进行不同胁迫处理后检测GUS活性,结果表明受到ABA、干旱、高温的诱导后其茎部和根部GUS活性有所提高,推测位于该启动子-682 bp的HSE元件和-1 268 bp的MybBS元件可能在高温、ABA和干旱诱导的表达调控中起作用。
关键词
獐茅
高
亲和
性
k
+
转运
蛋白
基因
(
hak
1)
启动子克隆
顺式元件分析
GUS组织化学染色
Keywords
Aeluropus littoralis
high-affinity
k
+ transporter gene (
hak
1)
promoter isolation
Cis-regulatory elements analysis
GUS assays
分类号
S511 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
甜菜BvHAK基因家族全基因组鉴定及其在盐处理下的表达分析
被引量:
4
2
作者
杨小涵
伍国强
魏明
王北辰
机构
兰州理工大学生命科学与工程学院
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期3773-3789,共17页
基金
国家自然科学基金(31860404,32160466)
甘肃省科技重大专项计划子课题(21ZD3NA001-3)
兰州市科技计划项目(2021-1-1765)。
文摘
高亲和性K^(+)转运蛋白(high-affinity K^(+)transporter,HAK)是植物中最重要的K^(+)转运蛋白家族之一,在植物K~+吸收和转运过程中发挥重要功能。为探究甜菜BvHAK基因家族成员生物学功能及基因表达模式,采用生物信息学手段,预测了蛋白质的理化性质、基因结构、染色体定位、系统进化、保守基序、三维结构、互作网络、启动子顺式作用元件,并通过qRT-PCR分析了盐胁迫下BvHAKs基因在甜菜不同组织中的表达水平。共鉴定出10个甜菜BvHAK基因家族成员,含有8-10个外显子、7-9个内含子;平均氨基酸个数为778.30,平均分子量为88.31kDa,等电点为5.38-9.41,跨膜区为11-14个。BvHAK4、-5、-7和-13定位在质膜,而其余定位在液泡膜。系统进化分析发现,高等植物HAK可分为5个簇,分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ簇,其中Ⅱ簇成员可进一步分为Ⅱa、Ⅱb和Ⅱc等3个亚簇;BvHAK家族成员则分布在前4簇,分别含有1、6、1和2个成员。甜菜BvHAK基因家族主要含有胁迫响应元件、激素响应元件和生长发育响应元件。进一步对BvHAK基因在盐处理下甜菜不同组织中的表达模式分析发现,50和100 mmol/L NaCl不同程度地诱导甜菜地上部和根部BvHAK基因家族成员的表达;高盐(150 mmol/L)则下调了其在地上部的表达水平。这些结果表明,BvHAK基因家族在响应盐胁迫过程中起重要作用。
关键词
甜菜
高
亲和
性
k
~+
转运
蛋白
hak
基因
家族
顺式作用元件
耐盐
性
Keywords
sugar beet(Beta vulgaris)
high-affinity
k
+transporter
hak
gene family
cis-acting element
salt tolerance
分类号
S566.3 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
獐茅HAK基因表达调控区的分离及其在水稻中的功能分析
张高华
王鹤
王旭达
丰明
李怀梅
李树英
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
下载PDF
职称材料
2
甜菜BvHAK基因家族全基因组鉴定及其在盐处理下的表达分析
杨小涵
伍国强
魏明
王北辰
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
原文传递
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