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基于单细胞RNA测序分析高内皮细胞小静脉对慢性阻塞性肺疾病患者肺免疫细胞招募作用
被引量:
1
1
作者
彭玲
张华
+2 位作者
童霞
张鑫
张兰兰
《中国呼吸与危重监护杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期170-177,共8页
目的在单细胞水平探索高内皮细胞小静脉(high endothelial venule,HEV)在慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)中的作用。方法利用GEO公共数据库(GSE136831)中18例慢阻肺患者及28例健康对照组共219257个肺组织单细胞RNA测序结果,分析HEV内皮细...
目的在单细胞水平探索高内皮细胞小静脉(high endothelial venule,HEV)在慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)中的作用。方法利用GEO公共数据库(GSE136831)中18例慢阻肺患者及28例健康对照组共219257个肺组织单细胞RNA测序结果,分析HEV内皮细胞与T淋巴细胞、B淋巴细胞以及树突状细胞的关系。结果利用生物信息学方法,从这些肺组织单细胞中提取内皮细胞,分选出静脉内皮细胞后,以CCL14、IGFBP7、POSTN作为HEV内皮细胞的标记基因,鉴定出HEV内皮细胞在慢阻肺中的表达上调。通过分析HEV内皮细胞的差异基因的功能,提示存在免疫调节的作用。通过细胞轨迹发育,发现HEV内皮细胞在发育后期富集了细胞外基质的重构。通过受体-配体配对,发现HEV内皮细胞通过一系列配体对T淋巴细胞、B淋巴细胞以及树突状细胞进行招募。结论HEV内皮细胞在慢阻肺中升高,并具有免疫调节的作用。通过分泌一系列的配体后,HEV内皮细胞可招募T淋巴细胞、B淋巴细胞以及树突状细胞进行免疫作用。HEV可能成为慢阻肺治疗的潜在靶标。
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关键词
计算生物学
生物信息学
高内皮细胞小静脉
慢性阻塞性肺疾病
单
细胞
测序技术
免疫调节
原文传递
题名
基于单细胞RNA测序分析高内皮细胞小静脉对慢性阻塞性肺疾病患者肺免疫细胞招募作用
被引量:
1
1
作者
彭玲
张华
童霞
张鑫
张兰兰
机构
四川大学华西医院呼吸与危重症医学科
四川大学华西空港医院(成都市双流区第一人民医院)
四川大学华西第二医院
四川大学华西医院消化内科
出处
《中国呼吸与危重监护杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期170-177,共8页
基金
国家自然科学基金青年基金(81900065)。
文摘
目的在单细胞水平探索高内皮细胞小静脉(high endothelial venule,HEV)在慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)中的作用。方法利用GEO公共数据库(GSE136831)中18例慢阻肺患者及28例健康对照组共219257个肺组织单细胞RNA测序结果,分析HEV内皮细胞与T淋巴细胞、B淋巴细胞以及树突状细胞的关系。结果利用生物信息学方法,从这些肺组织单细胞中提取内皮细胞,分选出静脉内皮细胞后,以CCL14、IGFBP7、POSTN作为HEV内皮细胞的标记基因,鉴定出HEV内皮细胞在慢阻肺中的表达上调。通过分析HEV内皮细胞的差异基因的功能,提示存在免疫调节的作用。通过细胞轨迹发育,发现HEV内皮细胞在发育后期富集了细胞外基质的重构。通过受体-配体配对,发现HEV内皮细胞通过一系列配体对T淋巴细胞、B淋巴细胞以及树突状细胞进行招募。结论HEV内皮细胞在慢阻肺中升高,并具有免疫调节的作用。通过分泌一系列的配体后,HEV内皮细胞可招募T淋巴细胞、B淋巴细胞以及树突状细胞进行免疫作用。HEV可能成为慢阻肺治疗的潜在靶标。
关键词
计算生物学
生物信息学
高内皮细胞小静脉
慢性阻塞性肺疾病
单
细胞
测序技术
免疫调节
Keywords
Computational biology
bioinformatics
high endothelial venule
chronic obstructive pulmonary disease
single cell sequencing technology
immune regulation
分类号
R563.9 [医药卫生—呼吸系统]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于单细胞RNA测序分析高内皮细胞小静脉对慢性阻塞性肺疾病患者肺免疫细胞招募作用
彭玲
张华
童霞
张鑫
张兰兰
《中国呼吸与危重监护杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
原文传递
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