目的通过小样本外显子测序与公用数据库比对进行生物信息挖掘,探寻汉族人群高原红细胞增多症(high altitude polycythemia,HAPC)变异与发病的相关性。方法纳入汉族高原红细胞增多症男性患者4例和高原健康男性5例,采集静脉血并提取DNA进...目的通过小样本外显子测序与公用数据库比对进行生物信息挖掘,探寻汉族人群高原红细胞增多症(high altitude polycythemia,HAPC)变异与发病的相关性。方法纳入汉族高原红细胞增多症男性患者4例和高原健康男性5例,采集静脉血并提取DNA进行全外显子组测序;将测序数据进行功能学富集分析(gene ontology,GO&kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)构建突变基因蛋白质互作网络(protein protein interaction,PPI),选择显著性最高的基因,筛选潜在关键HAPC相关变异位点,初步探究相关变异与HAPC发病可能的机制。结果通过全外显子测序,发现HAPC相关的突变基因216个,其中表皮生长因子(epidemal growth farctor,EGF)基因在功能学富集分析(GO&KEGG),蛋白质互作网络(PPI)中具有高度显著性,初步筛选出5个潜在关键HAPC相关变异位点,通过生物信息学预测及分析,最终筛选出EGF基因上3个可能的变异c.2124G>A(p.Met708Ile)、c.2351A>T(p.Asp784Val)以及c.2759A>T(p.Glu920Val),可能是HAPC的突变位点,与HAPC发病相关。结论本研究表明汉族EGF基因的变异与HAPC发病存在相关性。EGF基因的变异可能通过干扰RNA剪接,改变RNA二级结构,影响蛋白质结构,进而影响EGF的生成及HAPC的发生发展。展开更多
高原红细胞增多症(HAPC, high altitude polycythemia)是由高原低氧引起的以红细胞过度生成为主要表现的病症,该病发病机制复杂,现代医学、藏医学及中医学对HAPC有大量的研究,主要围绕流行病学,细胞生物学及分子生物学方面,但研究方向...高原红细胞增多症(HAPC, high altitude polycythemia)是由高原低氧引起的以红细胞过度生成为主要表现的病症,该病发病机制复杂,现代医学、藏医学及中医学对HAPC有大量的研究,主要围绕流行病学,细胞生物学及分子生物学方面,但研究方向比较分散,且药物方面的研究明显不足,所以目前对该病的治疗仍然没有系统的认识,因此本文对HAPC的现代研究进行系统的归纳总结,主要包括影响红细胞生成过程中的影响因子,信号通路及低氧条件下红细胞的损伤,为HAPC的机制研究提供方向,以期为中西医的治疗方案提供理论基础。展开更多
文摘目的通过小样本外显子测序与公用数据库比对进行生物信息挖掘,探寻汉族人群高原红细胞增多症(high altitude polycythemia,HAPC)变异与发病的相关性。方法纳入汉族高原红细胞增多症男性患者4例和高原健康男性5例,采集静脉血并提取DNA进行全外显子组测序;将测序数据进行功能学富集分析(gene ontology,GO&kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)构建突变基因蛋白质互作网络(protein protein interaction,PPI),选择显著性最高的基因,筛选潜在关键HAPC相关变异位点,初步探究相关变异与HAPC发病可能的机制。结果通过全外显子测序,发现HAPC相关的突变基因216个,其中表皮生长因子(epidemal growth farctor,EGF)基因在功能学富集分析(GO&KEGG),蛋白质互作网络(PPI)中具有高度显著性,初步筛选出5个潜在关键HAPC相关变异位点,通过生物信息学预测及分析,最终筛选出EGF基因上3个可能的变异c.2124G>A(p.Met708Ile)、c.2351A>T(p.Asp784Val)以及c.2759A>T(p.Glu920Val),可能是HAPC的突变位点,与HAPC发病相关。结论本研究表明汉族EGF基因的变异与HAPC发病存在相关性。EGF基因的变异可能通过干扰RNA剪接,改变RNA二级结构,影响蛋白质结构,进而影响EGF的生成及HAPC的发生发展。
文摘高原红细胞增多症(HAPC, high altitude polycythemia)是由高原低氧引起的以红细胞过度生成为主要表现的病症,该病发病机制复杂,现代医学、藏医学及中医学对HAPC有大量的研究,主要围绕流行病学,细胞生物学及分子生物学方面,但研究方向比较分散,且药物方面的研究明显不足,所以目前对该病的治疗仍然没有系统的认识,因此本文对HAPC的现代研究进行系统的归纳总结,主要包括影响红细胞生成过程中的影响因子,信号通路及低氧条件下红细胞的损伤,为HAPC的机制研究提供方向,以期为中西医的治疗方案提供理论基础。