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高密度cDNA微阵列技术检测乳腺癌差异表达基因 被引量:1
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作者 张林杰 王曦 罗畅民 《安徽医科大学学报》 CAS 2003年第1期9-11,共3页
目的 描绘乳腺癌的基因差异表达谱 ,以寻找乳腺癌新的肿瘤相关候选基因和分子标志。方法 用含 1 4 0 0 0个cDNA克隆的表达微阵列检测乳腺癌组织、乳腺癌旁组织及乳腺非癌组织的mRNA表达 ,并分析其表达的差异。结果 乳腺癌组织与乳腺... 目的 描绘乳腺癌的基因差异表达谱 ,以寻找乳腺癌新的肿瘤相关候选基因和分子标志。方法 用含 1 4 0 0 0个cDNA克隆的表达微阵列检测乳腺癌组织、乳腺癌旁组织及乳腺非癌组织的mRNA表达 ,并分析其表达的差异。结果 乳腺癌组织与乳腺非癌组织比较有 80个差异表达基因 ,乳腺癌组织与乳腺癌旁组织比较有 57个差异表达基因 ,乳腺癌旁组织与乳腺非癌组织比较有 2 9个差异表达基因 ,在乳腺癌组织与乳腺非癌组织和乳腺癌旁组织比较中有 1 4个差异表达基因是一致的。结论 用微阵列技术对乳腺癌的肿瘤相关基因和分子标志作初步探索 ,为了解中国女性乳腺癌发生发展的分子机制。 展开更多
关键词 高密度cdna微阵列技术 检测 乳腺癌 差异表达基因 基因表达 诊断 治疗
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用高密度cDNA微阵列技术检测鼻咽癌差异表达基因 被引量:7
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作者 张林杰 方嬿 +4 位作者 马英红 鄢践 张晓实 黄必军 曾益新 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第6期588-592,共5页
背景与目的:鼻咽癌的发生与发展涉及多个步骤、多个因素的参与,对此目前尚缺乏了解。本研究试图通过大规模检测鼻咽癌的基因差异表达来揭示鼻咽癌的差异表达基因谱,以发现与鼻咽癌发生、发展相关的新的候选基因。方法:用由18000个基因... 背景与目的:鼻咽癌的发生与发展涉及多个步骤、多个因素的参与,对此目前尚缺乏了解。本研究试图通过大规模检测鼻咽癌的基因差异表达来揭示鼻咽癌的差异表达基因谱,以发现与鼻咽癌发生、发展相关的新的候选基因。方法:用由18000个基因构建的高密度cDNA微阵列对21例鼻咽癌分3个样本池分别检测并与鼻咽非癌组织作对比分析,随机选2个基因用半定量RT-PCR验证检测结果。结果:3个样本池鼻咽癌差异表达基因分别为186个、95个和36个,总数达317个,表达上调的277个,表达下调的40个;差异表达基因中2个样本池以上有共同差异表达的基因有23个,表达上调的16个,表达下调的7个;其中3个样本池表达均有差异者6个,5个上调、1个下调,5个上调的基因中2个是已知基因,3个是未知基因,1个下调的是未知基因。结论:本研究揭示了鼻咽癌的基因表达谱,为了解鼻咽癌发生、发展的分子机理提供了大量信息,为寻找鼻咽癌相关基因提供了重要线索。 展开更多
关键词 cdna微阵列技术 鼻咽癌 差异表达基因
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一种高密度寡核苷酸微阵列芯片的制备技术
3
作者 陆祖宏 《中国家禽》 北大核心 2001年第21期17-17,共1页
21世纪,生命科学将成为整个科学领域带动性学科,生物技术将成为人类解决食物、能源、环境等重大经济和社会问题的关键技术,生物产业仍以医药生物技术产业化为“龙头”,农业生物技术为核心,环境与海洋生物技术为两翼,成为世人关注的焦点... 21世纪,生命科学将成为整个科学领域带动性学科,生物技术将成为人类解决食物、能源、环境等重大经济和社会问题的关键技术,生物产业仍以医药生物技术产业化为“龙头”,农业生物技术为核心,环境与海洋生物技术为两翼,成为世人关注的焦点。本期栏目刊发此类文章,目的在于:一方面向广大读者介绍未来生物技术领域一些基本常识;另一方面,希望加快中国家禽业生物技术的研究与应用。 展开更多
关键词 基因芯片 高密度寡核苷酸微阵列芯片 制备技术
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cDNA微阵列技术在植物功能基因组学研究中的应用 被引量:5
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作者 樊金娟 赵开军 徐正进 《生物技术通报》 CAS CSCD 2004年第3期26-29,共4页
cDNA微阵列 (cDNAMicroarrays)技术是近年发展起来的分子生物学研究新型工具 ,以分子杂交为基本原理 ,在检测植物基因表达水平、研究基因表达图谱、特异基因检测以及发现新基因和分离差异表达基因等方面有着独特的优势 ,已成为植物功能... cDNA微阵列 (cDNAMicroarrays)技术是近年发展起来的分子生物学研究新型工具 ,以分子杂交为基本原理 ,在检测植物基因表达水平、研究基因表达图谱、特异基因检测以及发现新基因和分离差异表达基因等方面有着独特的优势 ,已成为植物功能基因组学研究的重要手段。 展开更多
关键词 cdna微阵列技术 分子生物学 植物 功能基因组学 基因表达
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应用cDNA微阵列技术研究MMP1,TIMP1基因在肺癌中的表达 被引量:1
5
作者 欧阳取长 胡成平 +4 位作者 梁清华 石林阶 吴鄂生 杨红忠 潘频华 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第3期227-228,共2页
研究基质金属蛋白酶 1 (MMP1 )和基质金属蛋白酶组织抑制物 1 (TIMP1 )基因在肺鳞癌、肺腺癌中的表达。方法 :利用含 4 0 96个基因的cDNA微阵列检测肺鳞癌、肺腺癌组织与正常肺组织的差异表达基因 ,重点分析MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌与肺... 研究基质金属蛋白酶 1 (MMP1 )和基质金属蛋白酶组织抑制物 1 (TIMP1 )基因在肺鳞癌、肺腺癌中的表达。方法 :利用含 4 0 96个基因的cDNA微阵列检测肺鳞癌、肺腺癌组织与正常肺组织的差异表达基因 ,重点分析MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌与肺腺癌中的表达。结果 :MMP1 ,TIMP1基因在肺鳞癌与肺腺癌中均表达上调。结论 :MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌、肺腺癌中均出现表达上调 ,可作为肺鳞癌。 展开更多
关键词 应用 cdna微阵列技术 研究 MMP1 TIMP1基因 肺癌 表达
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cDNA微阵列技术:一种有效的差别表达基因克隆新方法 被引量:1
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作者 郑琳 赵明光 毕玉蓉 《生命的化学》 CAS CSCD 2003年第1期73-75,共3页
cDNA微阵列技术是以Northern印记杂交为基础 ,采用大规模集成电路点样技术的一种DNA杂交微阵列技术 ,是基因分离鉴定的最有效的方法之一。本文通过对其原理和工艺流程的简单介绍 。
关键词 cdna微阵列技术 差别表达基因 分离鉴定 基因克隆
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cDNA微阵列和组织微阵列技术在食管癌研究中的应用
7
作者 常英 龚均 《中华临床医药杂志(北京)》 CAS 2003年第19期44-46,共3页
关键词 cdna微阵列 组织微阵列技术 食管癌 应用
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用cDNA微阵列分析水稻防卫反应及信号传导相关基因 被引量:4
8
作者 裴雁曦 李德葆 +1 位作者 骆红梅 董海涛 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期399-401,共3页
应用cDNA微阵列技术分析了水稻受白叶枯菌侵染后一对近等基因系(中早14R、9S)的防卫信号传导途径.在mRNA水平,对检测到的相关基因(如病程相关蛋白、信号传导、转录因子等)间相互作用及信号传导途径的分析结果表明:白叶枯菌侵染下,乙烯(... 应用cDNA微阵列技术分析了水稻受白叶枯菌侵染后一对近等基因系(中早14R、9S)的防卫信号传导途径.在mRNA水平,对检测到的相关基因(如病程相关蛋白、信号传导、转录因子等)间相互作用及信号传导途径的分析结果表明:白叶枯菌侵染下,乙烯(ET)介导的信号传导途径在防卫反应中可能起着重要作用.核基因接受信号后改变了一些防卫反应相关基因的表达水平,来应答病原物的侵入.实验结果还提示,水稻的一些基因通过表达丰度的改变对乙烯信号途径产生反馈调节. 展开更多
关键词 cdna微阵列技术 水稻 防卫反应 信号传导 基因 乙烯反应元件结合蛋白 白叶枯菌
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通过cDNA微阵列和原位杂交技术对瘢痕疙瘩组织中上调的NNP-1(新核蛋白-1,D21S2056E)基因测序
9
作者 Na G.-Y. Seo S.-K. +1 位作者 Lee S.-J. 阎小宁 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2005年第5期9-10,共2页
Background:A keloid results from excessive collagen deposition, the cause of which remains elusive. A thorough understanding of the pathophysiology of keloid tissue can help determine the most appropriate treatment st... Background:A keloid results from excessive collagen deposition, the cause of which remains elusive. A thorough understanding of the pathophysiology of keloid tissue can help determine the most appropriate treatment strategy. Objectives: To assess the differences in gene expression between keloids and adjacent normal skin in order to define the genes involved in keloid formation. Methods:Three Korean patients with keloids underwent excision of the keloid and adjacent norma l skin, which was used as the control. We investigated expression patterns of ge nes in the keloids and the normal skin using cDNA microarray and in situ hybridi zation techniques. Results:Nine genes in the keloid tissue were consistently up -regulated over the 2.0 ratio compared with the normal control from the cDNA microarray composed of 3063 clones:collagen type I αI(NM 000088), DNA segmen t on chromosome 21 (unique) 2056 expressed sequence (D21S2056E, NNP-1, NM 00368 3), suppressor of Ty 5 homologue (NM 003169), phosphoglycerate dehydrogenase (NM 032692), adenosine triphosphatesynthase β(NM 001686), serine (or cysteine) pro teinase inhibitor, clade H (heat shock protein 47, NM 001235), LIV-1 protein, o estrogen regulated (LIV-1, NM 012319), interleukin-11 receptor α(IL11RA, NM 0 04512) and carbonyl reductase 3 (CBR3, NM 001236). From the in situ hybridizatio n study, the staining signals in the keloid tissue hybridized with anti sense pr obes of NNP-1 mRNA were stronger than signals in normal controls. Further, endo thelial epithelium, but not the epidermis, expressed the signal equally in both keloid and normal control tissue. Conclusions:We identified nine upregulated ge nes in keloid tissue using cDNA microarray. Of the nine, the NNP-1 gene was con firmed by topological information using the in situ hybridization technique. We conclude that these nine genes, especially NNP1, probably contribute either dire ctly or indirectly to keloid formation. 展开更多
关键词 瘢痕疙瘩组织 cdna微阵列 NNP-1 D21S2056E 基因测序 原位杂交技术 基因表达 受体Α 抑制因子 三磷酸腺苷酶
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细胞周期相关基因微阵列在中药抑制肝癌细胞增殖作用机理研究中的应用 被引量:13
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作者 王广良 陈成彬 +3 位作者 高建明 倪虹 王同顺 陈力 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期50-54,共5页
目的 :设计DNA微阵列并利用其研究中药抗肿瘤的分子机制。方法 :制备了包含有与细胞周期和DNA损伤调控检测相关的 2 4个基因的cDNA微阵列 ,选择了本实验室已证明对肝癌细胞有抑制效果的中药 ,通过流式细胞仪检测其对细胞周期的影响 ,提... 目的 :设计DNA微阵列并利用其研究中药抗肿瘤的分子机制。方法 :制备了包含有与细胞周期和DNA损伤调控检测相关的 2 4个基因的cDNA微阵列 ,选择了本实验室已证明对肝癌细胞有抑制效果的中药 ,通过流式细胞仪检测其对细胞周期的影响 ,提取药物作用后的RNA ,反转录后标记探针与微阵列杂交 ,检测中药作用细胞后对细胞周期及损伤检测相关基因转录的影响。结果 :4种中药作用SMMC 772 1后 ,细胞周期基因和损伤检测点基因均有不同程度改变 ,表现为部分上调 ,部分下调 ,这些和流式细胞术检测的结果是相符合的。结论 展开更多
关键词 细胞周期 中药 肝癌细胞 DNA微阵列技术 相关基因 增殖作用 流式细胞仪检测 反转录 RNA cdna微阵列
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应用cDNA微阵列技术检测子宫内膜癌组织中基因表达图谱的变化 被引量:11
11
作者 孟元光 魏丽惠 王建六 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第11期665-668,共4页
目的 通过研究正常子宫内膜和子宫内膜癌组织基因表达的变化 ,来探讨子宫内膜癌的发生机制。方法 应用cDNA微阵列技术 (含 5 88基因 ) ,对 30例子宫内膜癌患者的癌组织及同一患者的正常子宫内膜组织进行分析。由两种组织中分别提取总... 目的 通过研究正常子宫内膜和子宫内膜癌组织基因表达的变化 ,来探讨子宫内膜癌的发生机制。方法 应用cDNA微阵列技术 (含 5 88基因 ) ,对 30例子宫内膜癌患者的癌组织及同一患者的正常子宫内膜组织进行分析。由两种组织中分别提取总RNA后 ,制备探针 ,与cDNA微阵列膜进行杂交 ,杂交结果经计算机软件分析 ,采用免疫组织化学的方法对结果进行鉴定。结果  (1)与细胞死亡和增殖有关的基因———IRP、Wnt 5A及癌胚抗原前体在癌组织中表达的明显增高 ;(2 )与细胞粘附、浸润有关的基因———聚集蛋白聚糖核蛋白前体在癌组织中的表达明显增高 ;(3)与浸润有关的调节因子基因———CD147、TIMP 2基因在癌组织中的表达异常增高。结论 用cDNA微阵列可同时检测两种不同组织中多个基因的差异表达 ;CD147可能与子宫内膜癌的发生与浸润有关。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 cdna微阵列技术 基因表达 聚合酶链反应
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cDNA微阵列技术检测胃肠安复方对人胃癌细胞基因表达谱的影响 被引量:10
12
作者 赵爱光 赵海磊 +1 位作者 杨金坤 唐莱娣 《中国中西医结合消化杂志》 CAS 2004年第2期67-70,共4页
目的:观察健脾类中药胃肠安复方对人胃癌细胞裸小鼠移植瘤的抑瘤作用,探讨基因表达谱芯片在中药复方对胃癌细胞多基因表达影响研究中的应用。方法:采用人胃癌细胞SGC-7901裸小鼠皮下移植瘤模型。造模1周后选瘤块直径1.5mm以上者共16只,... 目的:观察健脾类中药胃肠安复方对人胃癌细胞裸小鼠移植瘤的抑瘤作用,探讨基因表达谱芯片在中药复方对胃癌细胞多基因表达影响研究中的应用。方法:采用人胃癌细胞SGC-7901裸小鼠皮下移植瘤模型。造模1周后选瘤块直径1.5mm以上者共16只,随机分为胃肠安复方组及0.85%氯化钠溶液对照组,每组8只。造模后41 d处死动物。通过RT-PCR反转录、同位素标记、全基因表达谱芯片方法研究胃肠安复方组与对照组人胃癌移植瘤细胞mRNA的表达差异。结果:胃肠安复方组瘤重低于对照组[(0.99±0.49)g:(1.93±0.52)g,P<0.05].胃肠安复方组抑瘤率为48.64%。全基因表达谱芯片检测比较分析示,胃肠安复方组与对照组样品间共有45个显著性差异表达基因,其中上调表达24个,下调表达21个,35个已克隆基因,10个表达序列标签。结论:健脾中药胃肠安复方抑制人胃癌细胞裸小鼠移植瘤生长,并可能对肿瘤细胞多基因表达有影响。 展开更多
关键词 cdna微阵列技术 胃肠安复方 胃癌细胞 基因表达谱 动物模型 RT-PCR
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应用cDNA微阵列技术初步分析中枢神经系统血管母细胞瘤的基因表达谱 被引量:5
13
作者 丁兴华 周良辅 +2 位作者 毛颖 赵曜 龚佳蕾 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期251-251,共1页
关键词 中枢神经系统血管母细胞瘤 cdna微阵列技术 基因表达谱 初步
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抑制性消减杂交技术的应用 被引量:8
14
作者 李小庆 景志忠 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期46-50,共5页
基因的差异表达是调控各种生命活动的核心分子机制,而分离、克隆并进一步研究差异表达基因已成为现代分子生物学研究的热点,也是功能基因组学研究的重要内容。在研究差异表达基因的诸多项技术中,抑制性消减杂交(SSH)技术具有特异性强、... 基因的差异表达是调控各种生命活动的核心分子机制,而分离、克隆并进一步研究差异表达基因已成为现代分子生物学研究的热点,也是功能基因组学研究的重要内容。在研究差异表达基因的诸多项技术中,抑制性消减杂交(SSH)技术具有特异性强、假阳性率低、灵敏度高和快速简便等优点,被广泛地应用于生命科学和医学领域的基因差异表达的研究中。近年来,抑制性消减杂交(SSH)技术得到了相应的改进和完善,而在许多研究领域,该技术在广度和深度上都有了一些新进展。主要就抑制性消减杂交技术的产生背景、原理、技术流程、特点及其最新应用研究进展等方面作简要综述。 展开更多
关键词 抑制性消减杂交 差异表达 功能基因DSN均一化技术 cdna微阵列
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抑制消减杂交(SSH)技术的研究与应用 被引量:8
15
作者 杨霞 孙建义 钱利纯 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2008年第2期24-26,共3页
关键词 MRNA差异显示技术 抑制消减杂交技术 基因表达系列分析 应用 cdna微阵列技术 人类基因组计划 代表性差异分析 后基因组计划
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基因芯片技术与微生物学 被引量:10
16
作者 靳连群 李君文 《微生物学免疫学进展》 2002年第1期85-89,共5页
:基因芯片技术作为生物芯片技术一个发展最完备的分支 ,近十年来 ,已经成为国内外研究的一个热点。基因芯片可以分为cDNA芯片和寡核苷酸芯片。cDNA芯片有多种制备方法 ,在基因表达相关研究方面具有重大价值 ;寡核苷酸芯片以美国Affymet... :基因芯片技术作为生物芯片技术一个发展最完备的分支 ,近十年来 ,已经成为国内外研究的一个热点。基因芯片可以分为cDNA芯片和寡核苷酸芯片。cDNA芯片有多种制备方法 ,在基因表达相关研究方面具有重大价值 ;寡核苷酸芯片以美国Affymetrix公司的GeneChip 为代表 ,主要应用于杂交测序、单核苷酸多态性分析和突变检测。本文分别对这两种芯片的制备、样品处理、杂交和信号检测分析技术作一综述 。 展开更多
关键词 基因芯片 微生物学 高密度寡核苷酸微阵列 cdna芯片
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差异表达基因克隆技术的研究进展 被引量:6
17
作者 徐德全 熊远著 《中国畜牧兽医》 CAS 2004年第3期31-34,共4页
随着基因组计划的顺利实施 ,大量的生物信息被解析 ,分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点。近些年来 ,国内外学者发展了多种分析差异表达基因的技术。现就目前主要使用的一些技术作一综述。
关键词 差异表达基因 克隆 消减杂交法 MRNA差异显示技术 代表性序列差别分析 抑制消减杂交法 基因表达系列分析 基因鉴定集成法 cdna微阵列
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DNA芯片技术及其农业应用 被引量:2
18
作者 刘国栋 《科技导报》 CAS CSCD 2001年第6期20-24,共5页
关键词 DNA芯片技术 农业 应用 显微杂交 寡核苷酸显微阵列 功能基因组学 cdna显微陈列
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组织芯片技术及其在体育生物中应用展望 被引量:3
19
作者 南广友 胡柏平 《四川体育科学》 2005年第1期26-28,31,共4页
组织芯片是cDNA 微阵列的基础上发明的一种特殊的生物芯片。本文介绍了组织芯片技术的制作原理、流程、发展历史、现状、特点和功能。并对组织芯片技术在运动选材、机能评定、运动营养等方面的应用前景进行了讨论,旨在促进组织芯片技术... 组织芯片是cDNA 微阵列的基础上发明的一种特殊的生物芯片。本文介绍了组织芯片技术的制作原理、流程、发展历史、现状、特点和功能。并对组织芯片技术在运动选材、机能评定、运动营养等方面的应用前景进行了讨论,旨在促进组织芯片技术与体育生物学的进一步结合,推动体育生物科学的发展。 展开更多
关键词 体育生物科学 生物学 运动选材 机能评定 运动营养 制作原理 特点 组织芯片技术 cdna微阵列 生物芯片
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高密度微阵列在复杂疾病研究中的应用
20
作者 Greg Yap 魏荣瑄(译) 《生物技术世界》 2006年第5期21-23,共3页
上世纪90年代的基因组测亭革命将科学研究推进到现代遗传学时代。DNA自动测亭技术可靠性强,而又花费不多,科学家可以借此测定生物体基因组的全顺序,从低等的细菌或病毒到高等值物、动物和人类基因组都可囊括。在这些信息流的驱动下... 上世纪90年代的基因组测亭革命将科学研究推进到现代遗传学时代。DNA自动测亭技术可靠性强,而又花费不多,科学家可以借此测定生物体基因组的全顺序,从低等的细菌或病毒到高等值物、动物和人类基因组都可囊括。在这些信息流的驱动下,我们现在面临的任务就是,如何把这些亿万计的核苷酸碱基知识用于改善人类健康和疾病冶疗,这是一项艰苦卓绝的任务。Stephen P.A.Fodor及其同事发明的高密度微阵列技术,可以使科学家审视庞大的基因组顺序,辨别重要的生物学信息。 展开更多
关键词 微阵列技术 复杂疾病 高密度 人类基因组 应用 技术可靠性 科学研究 人类健康
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