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滇西二高温温泉中Thermus高温菌的16S rRNA
被引量:
4
1
作者
郭春雷
王涛
+5 位作者
祝伟
柴丽红
张东华
崔晓龙
徐丽华
彭谦
《云南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
2003年第5期458-462,共5页
通过对滇西二温泉纯培养和免培养法获得的Thermus菌株序列进行16SrDNA系统发育及16SrRNA二级结构比较,发现二温泉中至少存在Thermus属的2个潜在新种,它们在系统发育树上形成1个独立的地理簇群分支,它们的16SrRNAhelix10二级结构也与其...
通过对滇西二温泉纯培养和免培养法获得的Thermus菌株序列进行16SrDNA系统发育及16SrRNA二级结构比较,发现二温泉中至少存在Thermus属的2个潜在新种,它们在系统发育树上形成1个独立的地理簇群分支,它们的16SrRNAhelix10二级结构也与其它地区的Thermus属菌株不同,形成明显的地域进化特征.
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关键词
滇西地区
高温温泉
Thermus菌株
高温
菌
16SrRNA
序列分析
系统发育
二级结构
地域进化特征
原文传递
温泉宏基因组来源的D-来苏糖异构酶性质研究
2
作者
苏雅丽
陈凤贞
+1 位作者
石贤爱
王国增
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期27-38,共12页
目的:从高温温泉宏基因组中挖掘能够高效催化合成稀有糖的新耐高温D-来苏糖异构酶。方法:从云南昌宁鸡飞温泉底泥中提取宏基因组DNA并进行高通量测序,经基因注释及序列比对鉴定D-来苏糖异构酶基因,构建大肠杆菌异源表达载体并诱导表达,...
目的:从高温温泉宏基因组中挖掘能够高效催化合成稀有糖的新耐高温D-来苏糖异构酶。方法:从云南昌宁鸡飞温泉底泥中提取宏基因组DNA并进行高通量测序,经基因注释及序列比对鉴定D-来苏糖异构酶基因,构建大肠杆菌异源表达载体并诱导表达,通过亲和层析纯化重组蛋白并对其性质研究。结果:从温泉底泥宏基因组测序结果中鉴定得到8个D-来苏糖异构酶基因,选择4个基因进行异源表达,其中JF-LI1和JF-LI4在大肠杆菌中成功表达并检测到酶活性。研究表明,JF-LI1和JF-LI4的最适温度分别为70℃和75℃。JF-LI4具有较宽的作用温度和良好的热稳定性,在30~100℃的温度范围内剩余40%以上的酶活力。JF-LI1和JF-LI4的最适pH分别为7.0和7.5,在中性偏酸性条件下具有较高的活力和较强的稳定性。重组JF-LI1和JF-LI4具有较宽的底物谱,除了对D-来苏糖活性最高外,对L-核糖、L-核酮糖、D-果糖和D-甘露糖均具有活性。重组JF-LI1和JF-LI4对L-核糖的催化效率分别为0.56 L/(mmol·s^(-1))和0.61 L/(mmol·s^(-1)),是目前已知的D-来苏糖异构酶中最高的。结论:从高温温泉宏基因组中获得8个新的D-来苏糖异构酶基因,对JF-LI1和JF-LI4进行异源表达和性质研究,具有pH稳定性好、热稳定性强以及底物特异性宽泛的特点,在制药、食品、化妆品等工业领域有重要的应用潜力。
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关键词
D-来苏糖异构酶
高温温泉
宏基因组
稀有糖
功能糖
原文传递
题名
滇西二高温温泉中Thermus高温菌的16S rRNA
被引量:
4
1
作者
郭春雷
王涛
祝伟
柴丽红
张东华
崔晓龙
徐丽华
彭谦
机构
教育部微生物资源开放研究重点实验室云南大学云南省微生物研究所
出处
《云南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
2003年第5期458-462,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(3996003)
云南省应用基础基金资助项目(98C095M).
文摘
通过对滇西二温泉纯培养和免培养法获得的Thermus菌株序列进行16SrDNA系统发育及16SrRNA二级结构比较,发现二温泉中至少存在Thermus属的2个潜在新种,它们在系统发育树上形成1个独立的地理簇群分支,它们的16SrRNAhelix10二级结构也与其它地区的Thermus属菌株不同,形成明显的地域进化特征.
关键词
滇西地区
高温温泉
Thermus菌株
高温
菌
16SrRNA
序列分析
系统发育
二级结构
地域进化特征
Keywords
West Yunnan
Thermus
16S rRNA
secondary structure
分类号
Q939.1 [生物学—微生物学]
Q522.3 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
温泉宏基因组来源的D-来苏糖异构酶性质研究
2
作者
苏雅丽
陈凤贞
石贤爱
王国增
机构
福州大学生物科学与工程学院
福州大学福建省医疗器械和医药技术重点实验室
出处
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期27-38,共12页
基金
福建省自然科学基金(2019J01237)资助项目。
文摘
目的:从高温温泉宏基因组中挖掘能够高效催化合成稀有糖的新耐高温D-来苏糖异构酶。方法:从云南昌宁鸡飞温泉底泥中提取宏基因组DNA并进行高通量测序,经基因注释及序列比对鉴定D-来苏糖异构酶基因,构建大肠杆菌异源表达载体并诱导表达,通过亲和层析纯化重组蛋白并对其性质研究。结果:从温泉底泥宏基因组测序结果中鉴定得到8个D-来苏糖异构酶基因,选择4个基因进行异源表达,其中JF-LI1和JF-LI4在大肠杆菌中成功表达并检测到酶活性。研究表明,JF-LI1和JF-LI4的最适温度分别为70℃和75℃。JF-LI4具有较宽的作用温度和良好的热稳定性,在30~100℃的温度范围内剩余40%以上的酶活力。JF-LI1和JF-LI4的最适pH分别为7.0和7.5,在中性偏酸性条件下具有较高的活力和较强的稳定性。重组JF-LI1和JF-LI4具有较宽的底物谱,除了对D-来苏糖活性最高外,对L-核糖、L-核酮糖、D-果糖和D-甘露糖均具有活性。重组JF-LI1和JF-LI4对L-核糖的催化效率分别为0.56 L/(mmol·s^(-1))和0.61 L/(mmol·s^(-1)),是目前已知的D-来苏糖异构酶中最高的。结论:从高温温泉宏基因组中获得8个新的D-来苏糖异构酶基因,对JF-LI1和JF-LI4进行异源表达和性质研究,具有pH稳定性好、热稳定性强以及底物特异性宽泛的特点,在制药、食品、化妆品等工业领域有重要的应用潜力。
关键词
D-来苏糖异构酶
高温温泉
宏基因组
稀有糖
功能糖
Keywords
D-lyxose isomerase
High temperature hot springs
Metagenome
Rare sugars
Functional sugars
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
滇西二高温温泉中Thermus高温菌的16S rRNA
郭春雷
王涛
祝伟
柴丽红
张东华
崔晓龙
徐丽华
彭谦
《云南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
2003
4
原文传递
2
温泉宏基因组来源的D-来苏糖异构酶性质研究
苏雅丽
陈凤贞
石贤爱
王国增
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
原文传递
已选择
0
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参考文献
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