几种直接从高温热泉沉积物中提取DNA方法之比较

用酶解法、化学裂解法和微波炉法、冻融法等物理裂解方法组合出 5种方法直接从滇西一个高温热泉沉积物提取DNA。经常规的琼脂糖凝胶电泳检测 ,发现用溶菌酶、蛋白酶K酶解 ,SDS化学裂解结合微波炉法裂解不仅可以得到较大量的DNA ,而且碎片段较少。提取出来的DNA经RNA酶和蛋白酶K处理后可直接进行PCR扩增。同时DGGE(变性梯度凝胶电泳 )电泳检测 ,结果表明 ,此法不仅可以得到该环境中较多微生物分类单位的DNA ,而且还能够较好地体现出它们在量上的差异。

滇西二高温热泉原核生物多样性的比较分析

直接提取腾冲大滚锅热泉壁、龙陵大沸泉泉底沉积物总DNA,PCR扩增获得古菌和细菌16S rDNA的V_8高变区片段,进行DGGE分析。结果显示,细菌和古菌在2个高温热泉中均有一定数量的存在,而且2个热泉古菌的DGGE条带差异度较大,而细菌在2个高温热泉中数量较多,而且相似较大。

云南腾冲热海三热泉细菌多样性的研究

应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)对云南腾冲热海 3个高温热泉中菌藻席和泉底沉积物的细菌多样性进行了初步研究。直接从环境样品中提取总DNA ,用两套细菌通用引物进行PCR扩增 ,分别得到包含V8和V9高变区的 1 6SrDNA片段 ,进行DGGE分析。结果表明 :菌藻席和泉底沉积物中不仅物种组成差异较大 ,而且都存在丰富的细菌多样性 ;一些关键的生态因子 ,如氧气、温度等会对群落中微生物的物种组成有很大影响。

西藏羊八井—宁中盆地地下水深循环三维模拟及对地热异常分布的限定

【研究目的 】高山区大气降水下渗至地下深部,经地下深循环排泄至地表,该过程涉及深部构造和水文地球化学,是形成丰富的地热和矿产资源的流体来源之一。前人使用水化学与同位素和数值模拟等方法研究探讨地下水源区和流动系统等,分析地下水循环深度、地下水循环时间和地下水运移机制,进而评估区域地热和矿产资源分布。【研究方法 】结合西藏羊八井—宁中盆地DEM数据、断层和岩性等资料建立三维有限元几何模型,使用地下水模拟软件求解标准饱和地下水流动方程,探讨研究区典型热泉的循环系统和区域地下水运移规律。【研究结果 】模拟结果表明,地下水在羊八井、拉多岗和曲才热泉的最大循环深度分别为5~7 km、3.5~4 km和3~3.6 km,相应的地下水循环时间为23~80年、5~6年和4~8年。念青唐古拉山地下水入渗深度达10 km,时间达百万年。【结论 】各个热泉的地下水循环深度不同,循环补给时间也差异较大,它们之间的补给源区和循环路径存在较大差异,虽位于同一裂谷,但羊八井、拉多岗和曲才热泉彼此之间没有水力联系,造成物质组成的差异。

腾冲热海四种不同颜色菌藻席的DGGE图谱比较

研究热泉水化学成分与菌藻席群落结构的关系。直接提取四种菌藻席 (mat)总DNA ,PCR扩增获得 16SrDNA的V8高变区片段 ,进行DGGE分析。结果 :四种菌藻席的细菌组成差异很大 ,DGGE条带数目最低为 2 0 ,最高为 4 7;4种菌藻席共有的条带为 1。结合文献报道的 3个热泉的水化学性质分析 ,表明水化学成分是热泉生态系统中重要的生态因子 。