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广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株监测与基因进化分析
被引量:
6
1
作者
曹蓝
李魁彪
+7 位作者
陆剑云
陈艺韵
刘艳慧
鲁恩洁
马钰
夏丹
刘文辉
狄飚
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期107-112,119,共7页
目的通过对广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株基因变异和进化特点进行分析,掌握本地区H7N9病毒病原学特点,为疾病防控提供参考。方法选取2017年广州市人感染H7N9禽流感病毒阳性标本10份,提取核酸扩增HA、NA、M基因进行测序,通...
目的通过对广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株基因变异和进化特点进行分析,掌握本地区H7N9病毒病原学特点,为疾病防控提供参考。方法选取2017年广州市人感染H7N9禽流感病毒阳性标本10份,提取核酸扩增HA、NA、M基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒重要蛋白突变情况和遗传进化特点。结果广州地区H7N9禽流感病毒基因同源性差异较大,大部分毒株基因与广东毒株同源性最高,部分毒株基因与河南、内蒙古等地毒株同源性最高。监测到5株病毒为H7N9禽流感病毒高致病性变异株,部分病毒出现了HA蛋白Q226L的突变,提示对人呼吸道上皮细胞SAα-2, 6Gal受体结合能力增加。HA蛋白和NA蛋白上糖基化位点均有一定的增加和缺失突变。HA、NA和M1蛋白上毒力相关位点均突变增强。M2蛋白均呈现耐药突变,同时监测到2株高致病性突变株出现对神经氨酸酶抑制剂的耐药突变。遗传进化结果显示,HA基因和NA基因在华南和华东分支均有分布,M1基因进化特点相对复杂,分别与华南地区H9N2、H7N9病毒,及北方地区的H7N9病毒重组。结论 2017年广州地区发现2株对达菲耐药的人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株。H7N9禽流感病毒在广州地区不断发生进化重组,具有遗传多样性和复杂性,提示高致病性耐药株有向华南以外地区传播的风险。
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关键词
人感染H7N9禽流感病毒
高致病性突变株
耐药
基因变异
遗传进化
下载PDF
职称材料
贵州省首例人感染高致病性禽流感H7N9突变株血凝素分子特征与溯源分析
被引量:
1
2
作者
万永虎
杨桃梅
+6 位作者
郑勤妮
庄丽
任丽娟
付琳
米飞
唐光鹏
李世军
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
2018年第5期280-285,共6页
目的了解贵州省人感染H7N9禽流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因的分子特征、溯源和疾病风险,为高致病性禽流感H7N9病毒的预防和控制提供依据。方法采用实时PCR对5株高致病性禽流感H7N9毒株标本(1株人感染鼻咽拭子标本,4株活...
目的了解贵州省人感染H7N9禽流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因的分子特征、溯源和疾病风险,为高致病性禽流感H7N9病毒的预防和控制提供依据。方法采用实时PCR对5株高致病性禽流感H7N9毒株标本(1株人感染鼻咽拭子标本,4株活禽市场环境标本)进行核酸的提取、HA基因的扩增和测序,运用生物信息学软件对H7N9禽流感病毒HA基因的同源性、遗传进化、受体结合关键位点、致病相关位点和糖基化位点变异情况进行分析。结果贵州省威宁县人感染H7N9禽流感病毒HA基因与当地活禽市场环境中H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%和99.6%,而4株活禽市场环境中的H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为100.0%和100.0%。与2017年广西人感染的A/Guangxi/5/2017毒株同源性最高,分别为99.7%~99.9%和99.4%~99.8%;与2016年底广东环境中分离的毒株A/Environment/Guangdong/ C16283222/2016同源性为99.0%~99.2%和98.9%~99.2%,而与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013候选疫苗株的同源性为96.8%~97.0%和95.8%~96.2%。与广西毒株A/Guangxi/5/2017遗传进化距离最近。5株毒株HA蛋白裂解位点突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,为高致病性禽流感突变株;受体结合关键位点均发生了G186V的突变,均未发生Q226L突变,5株毒株均发生的新突变为A363S,仅感染人的毒株发生的突变是R56K和I297V;5个潜在糖基化位点中仅421NWT和493NNT发生位置后移的变异。结论贵州省威宁县5株H7N9禽流感病毒均为高致病性禽流感突变株,候选疫苗株匹配保护效果可能已经降低,HA蛋白裂解位点、G186V和新的突变位点的变异可能增强了H7N9禽流感病毒对人体的易感性和致病性。
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关键词
高
致病
性
禽流感H7N9
突变
株
血凝素基因
分子特征
溯源
原文传递
题名
广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株监测与基因进化分析
被引量:
6
1
作者
曹蓝
李魁彪
陆剑云
陈艺韵
刘艳慧
鲁恩洁
马钰
夏丹
刘文辉
狄飚
机构
广州市疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期107-112,119,共7页
基金
国家科技重大专项(No.2017ZX10103011-005)
广州市医药卫生科技项目(No.20181A011052)
+1 种基金
广东省医学科研基金(No.A2018196)
广州市医学重点学科建设项目(No.2017-2019-07)联合资助~~
文摘
目的通过对广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株基因变异和进化特点进行分析,掌握本地区H7N9病毒病原学特点,为疾病防控提供参考。方法选取2017年广州市人感染H7N9禽流感病毒阳性标本10份,提取核酸扩增HA、NA、M基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒重要蛋白突变情况和遗传进化特点。结果广州地区H7N9禽流感病毒基因同源性差异较大,大部分毒株基因与广东毒株同源性最高,部分毒株基因与河南、内蒙古等地毒株同源性最高。监测到5株病毒为H7N9禽流感病毒高致病性变异株,部分病毒出现了HA蛋白Q226L的突变,提示对人呼吸道上皮细胞SAα-2, 6Gal受体结合能力增加。HA蛋白和NA蛋白上糖基化位点均有一定的增加和缺失突变。HA、NA和M1蛋白上毒力相关位点均突变增强。M2蛋白均呈现耐药突变,同时监测到2株高致病性突变株出现对神经氨酸酶抑制剂的耐药突变。遗传进化结果显示,HA基因和NA基因在华南和华东分支均有分布,M1基因进化特点相对复杂,分别与华南地区H9N2、H7N9病毒,及北方地区的H7N9病毒重组。结论 2017年广州地区发现2株对达菲耐药的人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株。H7N9禽流感病毒在广州地区不断发生进化重组,具有遗传多样性和复杂性,提示高致病性耐药株有向华南以外地区传播的风险。
关键词
人感染H7N9禽流感病毒
高致病性突变株
耐药
基因变异
遗传进化
Keywords
human infection with avian influenza A(H7N9)virus
highly pathogenic mutant
drug resistance
gene mutation
genetic evolution
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
贵州省首例人感染高致病性禽流感H7N9突变株血凝素分子特征与溯源分析
被引量:
1
2
作者
万永虎
杨桃梅
郑勤妮
庄丽
任丽娟
付琳
米飞
唐光鹏
李世军
机构
贵州省疾病预防控制中心传染病防治研究所检验科
山东大学医学院
出处
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
2018年第5期280-285,共6页
基金
贵州省高层次创新型人才培养项目[黔科合人才(2016)4021]
贵州省卫生计生委科学技术基金项目(gzwjkj2016-1-056)
文摘
目的了解贵州省人感染H7N9禽流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因的分子特征、溯源和疾病风险,为高致病性禽流感H7N9病毒的预防和控制提供依据。方法采用实时PCR对5株高致病性禽流感H7N9毒株标本(1株人感染鼻咽拭子标本,4株活禽市场环境标本)进行核酸的提取、HA基因的扩增和测序,运用生物信息学软件对H7N9禽流感病毒HA基因的同源性、遗传进化、受体结合关键位点、致病相关位点和糖基化位点变异情况进行分析。结果贵州省威宁县人感染H7N9禽流感病毒HA基因与当地活禽市场环境中H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%和99.6%,而4株活禽市场环境中的H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为100.0%和100.0%。与2017年广西人感染的A/Guangxi/5/2017毒株同源性最高,分别为99.7%~99.9%和99.4%~99.8%;与2016年底广东环境中分离的毒株A/Environment/Guangdong/ C16283222/2016同源性为99.0%~99.2%和98.9%~99.2%,而与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013候选疫苗株的同源性为96.8%~97.0%和95.8%~96.2%。与广西毒株A/Guangxi/5/2017遗传进化距离最近。5株毒株HA蛋白裂解位点突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,为高致病性禽流感突变株;受体结合关键位点均发生了G186V的突变,均未发生Q226L突变,5株毒株均发生的新突变为A363S,仅感染人的毒株发生的突变是R56K和I297V;5个潜在糖基化位点中仅421NWT和493NNT发生位置后移的变异。结论贵州省威宁县5株H7N9禽流感病毒均为高致病性禽流感突变株,候选疫苗株匹配保护效果可能已经降低,HA蛋白裂解位点、G186V和新的突变位点的变异可能增强了H7N9禽流感病毒对人体的易感性和致病性。
关键词
高
致病
性
禽流感H7N9
突变
株
血凝素基因
分子特征
溯源
Keywords
High pathogenic avian influenza A (H7N9)virus
Hemagglutinin gene
Molecular characteristic
Tracing
分类号
R511.7 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株监测与基因进化分析
曹蓝
李魁彪
陆剑云
陈艺韵
刘艳慧
鲁恩洁
马钰
夏丹
刘文辉
狄飚
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
下载PDF
职称材料
2
贵州省首例人感染高致病性禽流感H7N9突变株血凝素分子特征与溯源分析
万永虎
杨桃梅
郑勤妮
庄丽
任丽娟
付琳
米飞
唐光鹏
李世军
《中华传染病杂志》
CAS
CSCD
2018
1
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