期刊导航
期刊开放获取
河南省图书馆
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
2
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
高黎贡牛樟芝线粒体全基因组特征及系统发育分析
1
作者
尹以杭
原晓龙
+3 位作者
陈自宏
杨宇明
郑元
王毅
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024年第3期1-11,共11页
为了解高黎贡牛樟芝线粒体基因组的特征及系统发育,本研究利用高通量测序技术对高黎贡牛樟芝线粒体基因组进行测序组装、注释并对其组成特征与其他多孔菌目真菌的线粒体基因组进行比较分析。结果显示:(1)获得完整的高黎贡牛樟芝线粒体...
为了解高黎贡牛樟芝线粒体基因组的特征及系统发育,本研究利用高通量测序技术对高黎贡牛樟芝线粒体基因组进行测序组装、注释并对其组成特征与其他多孔菌目真菌的线粒体基因组进行比较分析。结果显示:(1)获得完整的高黎贡牛樟芝线粒体基因组,其大小为110713 bp。共编码82个基因(53个蛋白编码基因、27个tRNA基因、2个rRNA基因),有较为显著的A-T偏好。(2)与11个近缘物种线粒体基因组共线性分析,发现高黎贡牛樟芝线粒体基因组与其他线粒体基因组有32个同源区域,同源区域的相对位置在多孔菌目种间变化很大,在进化过程中发生频繁的基因重排。(3)选择压力分析显示,15个核心编码基因的Ka/Ks<1,各物种在氨基酸水平上纯化选择起主导作用;系统发育分析表明,高黎贡牛樟芝线粒体基因组与台湾牛樟芝关系最近,形成独立分支。结果表明:高黎贡牛樟芝线粒体基因组与台湾牛樟芝线粒体基因组相比基因顺序没有发生变化,但存在一段4209 bp的片段缺失,该分析支持高黎贡牛樟芝成为一个独立新种。
展开更多
关键词
高黎贡牛樟芝
线粒体基因组
比较基因组
三代测序
下载PDF
职称材料
添加牛樟和阴香基质对高黎贡牛樟芝萜类化合物生物合成途径的影响
2
作者
康祖江
陈娇娇
+3 位作者
原晓龙
杨宇明
郑元
王毅
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024年第3期12-22,共11页
为了研究添加牛樟和阴香嫩枝叶粉末对高黎贡牛樟芝萜类化合物的影响,使用Illumina高通量测序平台对添加牛樟、阴香嫩枝叶和薏仁(对照组)粉末培养液体培养后的菌丝体进行转录组测序,并分析萜类化合物合成途径关键基因表达情况。结果显示:...
为了研究添加牛樟和阴香嫩枝叶粉末对高黎贡牛樟芝萜类化合物的影响,使用Illumina高通量测序平台对添加牛樟、阴香嫩枝叶和薏仁(对照组)粉末培养液体培养后的菌丝体进行转录组测序,并分析萜类化合物合成途径关键基因表达情况。结果显示:(1)在添加牛樟枝叶粉末(BSNZZ-NF)和阴香枝叶粉末(BSNZZ-YF)下,共有446个差异表达基因,261个上调、185个下调;对差异表达基因的GO富集分析发现,与氧化还原过程及各种氧化还原酶相关的基因被显著富集;KEGG pathway富集分析发现,DEGs显著富集在酪氨酸、乙醛酸和二羧酸、丙酸三个代谢通路中。(2)在高黎贡牛樟芝转录组数据中,共筛选出43条参与萜类化合物合成的甲羟戊酸(MVA)途径的转录序列,添加牛樟基质后,HBD9、HMG-CoA、GGT3和OCS表达量明显上调,HBD12、TPS5和SE基因表达量下调;添加阴香基质后,AACT1、HBD5、HBD8、HBD12、FPPS1表达量明显上调,HMGS、HMG-CoA、IDI表达量下调。(3)有bHLH、bZIP、MYB等14个转录因子与高黎贡牛樟芝萜类化合物生物合成相关,14个转录因子在添加牛樟和阴香粉末后均具有不同程度的表达。本研究为进一步揭示参与高黎贡牛樟芝萜类生物合成相关转录因子反应机制提供了参考。
展开更多
关键词
高黎贡牛樟芝
转录组分析
萜类化合物生物合成
转录因子
下载PDF
职称材料
题名
高黎贡牛樟芝线粒体全基因组特征及系统发育分析
1
作者
尹以杭
原晓龙
陈自宏
杨宇明
郑元
王毅
机构
西南林业大学林学院
云南省林业和草原科学院
保山学院
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024年第3期1-11,共11页
基金
云南省基础研究项目(202401AS070043)
国家自然科学基金项目(32160736,31860177)
云南省真菌多样性与绿色发展重点实验室开放课题(E03A311261-3)。
文摘
为了解高黎贡牛樟芝线粒体基因组的特征及系统发育,本研究利用高通量测序技术对高黎贡牛樟芝线粒体基因组进行测序组装、注释并对其组成特征与其他多孔菌目真菌的线粒体基因组进行比较分析。结果显示:(1)获得完整的高黎贡牛樟芝线粒体基因组,其大小为110713 bp。共编码82个基因(53个蛋白编码基因、27个tRNA基因、2个rRNA基因),有较为显著的A-T偏好。(2)与11个近缘物种线粒体基因组共线性分析,发现高黎贡牛樟芝线粒体基因组与其他线粒体基因组有32个同源区域,同源区域的相对位置在多孔菌目种间变化很大,在进化过程中发生频繁的基因重排。(3)选择压力分析显示,15个核心编码基因的Ka/Ks<1,各物种在氨基酸水平上纯化选择起主导作用;系统发育分析表明,高黎贡牛樟芝线粒体基因组与台湾牛樟芝关系最近,形成独立分支。结果表明:高黎贡牛樟芝线粒体基因组与台湾牛樟芝线粒体基因组相比基因顺序没有发生变化,但存在一段4209 bp的片段缺失,该分析支持高黎贡牛樟芝成为一个独立新种。
关键词
高黎贡牛樟芝
线粒体基因组
比较基因组
三代测序
Keywords
Taiwanofungus gaoligongensis
mitochondrial genome
comparative genomes
third generation sequencing
分类号
R284 [医药卫生—中药学]
R285 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
添加牛樟和阴香基质对高黎贡牛樟芝萜类化合物生物合成途径的影响
2
作者
康祖江
陈娇娇
原晓龙
杨宇明
郑元
王毅
机构
西南林业大学林学院
云南省林业和草原科学院高黎贡重点实验室
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024年第3期12-22,共11页
基金
云南省基础研究项目(202401AS070043,202101AT070218,202101AT070044)
国家自然科学基金项目(32160736,31860177)
云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202205AC160044)。
文摘
为了研究添加牛樟和阴香嫩枝叶粉末对高黎贡牛樟芝萜类化合物的影响,使用Illumina高通量测序平台对添加牛樟、阴香嫩枝叶和薏仁(对照组)粉末培养液体培养后的菌丝体进行转录组测序,并分析萜类化合物合成途径关键基因表达情况。结果显示:(1)在添加牛樟枝叶粉末(BSNZZ-NF)和阴香枝叶粉末(BSNZZ-YF)下,共有446个差异表达基因,261个上调、185个下调;对差异表达基因的GO富集分析发现,与氧化还原过程及各种氧化还原酶相关的基因被显著富集;KEGG pathway富集分析发现,DEGs显著富集在酪氨酸、乙醛酸和二羧酸、丙酸三个代谢通路中。(2)在高黎贡牛樟芝转录组数据中,共筛选出43条参与萜类化合物合成的甲羟戊酸(MVA)途径的转录序列,添加牛樟基质后,HBD9、HMG-CoA、GGT3和OCS表达量明显上调,HBD12、TPS5和SE基因表达量下调;添加阴香基质后,AACT1、HBD5、HBD8、HBD12、FPPS1表达量明显上调,HMGS、HMG-CoA、IDI表达量下调。(3)有bHLH、bZIP、MYB等14个转录因子与高黎贡牛樟芝萜类化合物生物合成相关,14个转录因子在添加牛樟和阴香粉末后均具有不同程度的表达。本研究为进一步揭示参与高黎贡牛樟芝萜类生物合成相关转录因子反应机制提供了参考。
关键词
高黎贡牛樟芝
转录组分析
萜类化合物生物合成
转录因子
Keywords
Taiwanofungus gaoligongensis
transcriptome analysis
biosynthesis of terpenoids
transcription factor
分类号
R284 [医药卫生—中药学]
R285 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高黎贡牛樟芝线粒体全基因组特征及系统发育分析
尹以杭
原晓龙
陈自宏
杨宇明
郑元
王毅
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
添加牛樟和阴香基质对高黎贡牛樟芝萜类化合物生物合成途径的影响
康祖江
陈娇娇
原晓龙
杨宇明
郑元
王毅
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部