3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化

对采自东海的银鲳（Pampus argenteus）、翎鲳（P.punctatissimus）和中国鲳（P.chinensis）3种鲳属鱼类的线粒体COI基因序列片段进行扩增和序列测定，得到603bp的基因片段，编码201个氨基酸，碱基T、C、A、G平均含量分别为34．2％、22．3％、25．9％和17．6％。所得序列共定义12个单倍型，中国鲳只有1个单倍型，银鲳3个单倍型，翎鲳8个单倍型，在这12个单倍型中共检测到109个变异位点。3种鲳密码子的使用均存在明显的偏向性，且同义密码子使用偏向性高度一致。银鲳和中国鲳的遗传距离最大（0．165～0．168），与翎鲳的遗传距离次之（0．151～0．162），翎鲳和中国鲳的遗传距离最小（0．058～0．065）。由进化树可知，翎鲳和中国鲳的进化关系最近，它们与银鲳的进化关系较远，银鲳是最早形成的种。分子水平自然选择的检验结果表明，自然选择在银鲳和翎鲳线粒体COI基因差异形成过程中起一定的作用。本研究从分子水平研究中国东海海域鲳属鱼类的分类、遗传关系和系统进化，以其了解鲳属鱼类以及与鲳科之间的亲缘关系，又为鲳属鱼类保护生物学和系统进化提供分子生物学依据。[中国水产科学，2008，15（3）：392-399]

基于线粒体细胞色素b基因片段序列变异探讨3种鲳属鱼类系统进化

对鲳属3种鱼类共19个个体的细胞色素b(Cytb)基因进行PCR扩增,经比对校正得到1123bp的基因片段,共检测到141个变异位点,总变异为12.56%,5个简约信息位点,未出现插入和(或)缺失,序列中转换(Transition)明显多于颠换(Transversion)。鲳属3种鱼类19个序列共检测到11种单倍型,其T、C、A和G平均含量分别为29.1%、30.5%、27.4%和13.0%。(A+T)%为56.5%,大于(G+C)43.5%。结合来自GenBank中的鲳科的中间低鳍鲳Peprilus medius和星斑真鲳Stromateus stellatus的相应同源序列,并以长鲳科的刺鲳Psenopsis anomala作为外群,构建系统进化树。结果显示,翎鲳和中国鲳亲缘关系较近,二者与银鲳亲缘关系较远,同为鲳科的鱼类聚类后再与作为外群的刺鲳相聚。系统进化树显示,银鲳为3种鲳属鱼类中较早分化出的种,刺鲳位于进化树的基部,是较鲳属鱼类更为原始的类群,与形态分析结果一致。

中国鲳属鱼类同工酶谱分析

对中国近海鲳属鱼类的肌浆蛋白酶（Ｐｍ）、酯酶（ＥＳＴ）、乳酸脱氢酶（ＬＤＨ）和超氧 化物歧化酶（ＳＯＤ）等生化特征作了比较分析。结果表明，中国鲳属鱼类的Ｐｍ，ＥＳＴ和ＳＯＤ 具有明显的种的特异性，而ＬＤＨ则无种间差异。青岛、上海、厦门和珠海４个取样地点银鲳 的Ｐｍ和ＥＳＴ酶谱完全相同，同样，上述４个取样地点的翎鲳Ｐｍ和ＥＳＴ酶谱也完全相同， 从生化学的角度证明了我国沿海鲳属鱼类存在５个种，并且所有海区的银鲳和翎鲳各为同 一个种。

利用COⅠ和Cytb序列探讨东海区3种鲳属鱼类的种群遗传结构

通过对COⅠ和Cytb序列的分析,研究了银鲳(Pampus argenteus)、灰鲳(P.cinereus)和翎鲳(P.punctatissimus)3种东海区重要鲳属鱼类群体的种群遗传结构。在62个鲳属鱼类样本中分别检出COⅠ和Cytb单倍型21个和27个,发现变异位点125个和176个。东海区的3种鲳属鱼类种群中,翎鲳的单倍型多样性(h)与核苷酸多样性(Pi)水平均为最高(在COⅠ序列中分别为0.779和0.003 25,在Cytb序列中分别为0.847和0.003 33),而银鲳和灰鲳的h和Pi水平较低。FU’S FS中性检验和歧点分布分析结果显示,3种鲳属鱼类种群均经历了种群扩张现象。结果表明,3种鲳属鱼类均经历过种群瓶颈效应,处于瓶颈效应后的增长期,遗传多样性水平较低,应采取一些有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果可以为鲳属鱼类资源的合理开发利用和保护提供必要的参考。

基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构

利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COI)部分序列研究了南海区鲳属鱼类(Pampus)银鲳(P.ar-genteus)、珍鲳(P.minor)和中国鲳(P.chinensis)的系统进化与种群遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为643 bp的COI基因片段,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为25.4%、33.6%、18.9%和22.1%,A+T含量高于G+C含量。64条序列共定义了20种单倍型,包含152个变异位点,简约信息位点148个,单变异位点4个,产生169个点突变。结果表明,银鲳与中国鲳的遗传差异最小,银鲳与珍鲳的其次,而珍鲳与中国鲳的遗传差异最大,3种鲳属鱼类的遗传多样性均呈现较低的水平,应采取有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果为鲳属鱼类资源保护和合理开发利用提供必要的参考。

中国近海鲳属鱼类的形态分类学研究(英文)

作者于1989年～1990年对中国科学院海洋研究所1954年以来所采集的鲳属鱼类标本进行了形态比较解剖。并总结了近二百余年来有关中国海鲳属鱼类研究的国内外文献,结合地理分布特征。对中国近海鲳属鱼类的形态分类学进行了更深入的分析研究。结果表明:南海区的银鲳与黄渤海、东海区的银鲳在背鳍、臀鳍的鳍条数、椎骨数、椎体形态和耳石的形态上存在着不同程度的差异,可认为是种内群体的分化,应把两者视为一个有效种的两个并列亚种。

基于线粒体全基因组结构的鲳属鱼类分子分类研究

为明确鲳属鱼类的线粒体全基因组序列结构、寻找有效的种间鉴别分子标记,并剖析其系统发育信息,从而为鲳属鱼类的分类学、进化遗传学和种质鉴定提供参考依据,测定了鲳属5种鱼类(中国鲳Pampus chinensis、灰鲳P.cinereus、银鲳P.argenteus、珍鲳P.minor、翎鲳P.punctatissimus)的线粒体全基因组序列,并结合NCBI数据库中已有的鲳属鱼类线粒体全基因组序列进行分析。结果显示:1)鲳属线粒体基因组全序列长度在16551 bp到18062 bp之间,其基因组结构与大多数硬骨鱼类一致;比较特别的是,银鲳和镰鲳具有两个tRNA;结构,珍鲳出现ND1基因重排以及两个重复的D-loop结构。2)银鲳与镰鲳的D-loop区出现重复CSB3结构,灰鲳与翎鲳D-loop区出现重复TAS结构。3)ND2基因条形码及其微型条形码均可将鲳属鱼类区分开,可作为有效的鲳属鉴别分子标记。4)东海区的银鲳与镰鲳应为同一物种,灰鲳可能为翎鲳的同物异名。

中国鲳属鱼类一新种(鲈形目,鲳科)(英文)

描述了分布于中国东南沿海的鲳科鲳属鱼类I新种，刘氏鲳Pampuliuorumsp．nov．。与鲳属其它已知种比较，刘氏鲳体为长椭圆形，个体大而强壮；背鳍具37～4l鳍条；臀鳍具36—40鳍条，前部鳍条延长超过尾柄；鳃耙退化，第1鳃弓上具8～12结节状鳃耙；脊椎骨38个；新鲜标本体为银灰色并带金黄色或铜蓝色金属光泽。

海洋所揭示世界鲳属鱼类物种多样性和地理分布格局

近日,中国科学院海洋研究所鱼类分类与系统发育研究团队在世界鲳科(Stromateidae)鲳属(Pampus)鱼类分类及地理分布格局研究方面获得新进展。该研究基于分子系统学和物种界定方法,综合分析了全球鲳属线粒体序列和分布数据,首次揭示世界鲳属鱼类物种多样性和地理分布格局。相关研究成果发表在Frontiers in Marine Science上。

银鲳分类鉴别及新模标本指定(英文)

银鲳为我国重要海洋渔业资源之一,被认为广泛分布于中国沿海以及印度-西太平洋海域。1788年,Euphrasen基于在中国广东虎门采集的1尾标本首次对银鲳进行描述,后来被世界众多学者报道。由于Euphrasen当初描述银鲳时缺乏重要的形态鉴别特征,加之其模式标本存放地点至今不详,因此导致银鲳的分类鉴定和命名出现许多错误和混乱,有必要对其澄清。2011年4月至2012年5月,作者在银鲳模式标本产地广东虎门和珠海共采到19尾鲳属鱼类标本,经鉴定与Euphrasen在1788年对银鲳的描述及附图十分吻合。因此,本文对银鲳进行重新描述,并指定其中1尾标本为新模标本。