基于线粒体基因组全序列的鳅科(Cobitidae)鱼类进化关系分析

为了解鳅科(Cobitidae)鱼类线粒体全基因组序列的结构特征和系统发育信息,利用生物信息学方法对已知的40种鳅科鱼类线粒体全基因组进行比对分析,用邻接法(NJ)构建系统发育树。结果显示:(1)鳅科鱼类线粒体基因组全序列长度在16553~16937 bp之间,基因组的结构特征及基因排列顺序与其他硬骨鱼类一致。(2)鳅科鱼类线粒体全基因组一致序列长度为17483 bp,变异位点数为8039(45.9%),Kimura双参数平均遗传距离为0.19。在13个蛋白质编码基因中,ND2的变异程度(58.9%)和平均遗传距离(0.28)最大,变异程度最小的是12S rRNA(30.5%),tRNA拼接序列的平均遗传距离最小(0.07)。(3)Cox1、ND5、Cytb基因是进行鳅科鱼类系统发育分析较为理想的分子标记,NJ系统发育树显示,条鳅亚科(Noemacheilinae)是最早分化出来的一枝群系,位于祖先位置,沙鳅亚科(Botiinae)和花鳅亚科(Cobitinae)亲缘关系更近,互为姐妹群系。本研究为鳅科鱼类进化学研究和分子标记的选取提供参考依据。

三种鳅科鱼对NaCl盐度和NaHCO_3碱度的耐受能力

以鳅科的黑龙江泥鳅(Misgurnus mohoity Dybowsky)、大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus Sauvage)、达里湖高原鳅(Triplophysa dalaica)为实验材料,采用单因子静态急性毒性实验法和均匀正交设计法对其盐碱耐受能力进行研究。实验结果表明,黑龙江泥鳅、大鳞副泥鳅、达里湖高原鳅的24 h和96 h的氯化钠(Na Cl)盐度半致死浓度(LC50)分别为15.64 g/L和13.58 g/L、15.43 g/L和14.18 g/L、14.00 g/L和11.57 g/L,安全浓度(SC)分别为4.12 g/L、4.03 g/L、3.74 g/L,盐度耐受能力顺序为:黑龙江泥鳅>大鳞副泥鳅>达里湖高原鳅。黑龙江泥鳅、大鳞副泥鳅、达里湖高原鳅的24 h和96 h碳酸氢钠(NaHCO_3)碱度半致死浓度(LC50)分别为117.1 mmol/L和72.62 mmol/L、128.4 mmol/L和88.83 mmol/L、155.2 mmol/L和120.0 mmol/L,安全浓度分别为18.77 mmol/L、23.66 mmol/L、36.30 mmol/L,碱度耐受能力顺序为:达里湖高原鳅>大鳞副泥鳅>黑龙江泥鳅。盐碱交互作用对黑龙江泥鳅、大鳞副泥鳅均表现为协同作用,协同系数0~48 h依次增高,以后逐渐减小;而对达里湖高原鳅在0~48 h内表现为协同作用,在48~96 h时表现为拮抗作用,拮抗系数随着暴露时间的延长而增大。对比分析可知,3种鳅科鱼的盐碱耐受能力比大多数淡水鱼高,可作为盐碱水域的增养殖鱼类;而达里湖高原鳅在耐碱方面表现更突出,可以作为高碳酸盐型盐碱水的增养殖鱼类。

贵州高原鳅属鱼类二新种(鲤形目:鳅科:条鳅亚科)

描记高原鳅属鱼类 2新种 ,即鼻须高原鳅Triplophysanasobarbatulasp .nov .和贞丰高原鳅Triplophysazhenfengensissp .nov .,采自贵州省荔波县和贞丰县 (均属西江水系 )。前者与云南高原鳅TriplophysayunnanensisYang相似 ,后者与鼻须高原鳅Triplophysanasobarbatulasp .nov .相似 ,正模标本均保存在遵义医学院生物学教研室。

鳅科鱼类DNA条形码鉴定及系统进化研究

【目的】为了探讨线粒体COI基因作为DNA条形码在鳅科鱼类物种鉴定中的有效性及在系统进化关系分析中的适用性,对鳅科鱼类3亚科18属61种共358条线粒体COI基因序列进行了分析。【结果】61种鳅科鱼类的种内和种间的平均遗传距离分别为0.010和0.162,种间平均遗传距离是种内平均遗传距离的16.2倍。鳅科鱼类遗传距离在种内、种间重叠较少,能形成一定的DNA条形码间隙。ABGD分类把61个物种划分为66个OTUs,OTUs的划分与距离法基本一致。系统聚类中,有6组鱼类物种个体间相互混杂,不能按各自的物种聚类,有4个物种分化成明显的两支,46个物种能按各自的形态学分类分别聚成单支。南鳅属、花鳅属、似鳞头鳅属、瘦身鳅属和泥鳅属中部分物种没有按其形态学分类的属聚在一起。沙鳅亚科能形成单系,但条鳅亚科和花鳅亚科不能形成单系。在研究中,COI条形码可以鉴定鳅科鱼类75.41%的物种,另外,COI条形码也能够明确大多鳅科鱼类属和亚科的分类地位,研究结果可为鳅科鱼类的物种鉴定和系统分类提供参考。

爬岩鳅属鱼类一新种(鲤形目:平鳍鳅科)

本文记述了采自贵州三都县的平鳍鳅科鱼类１新种，由于其在侧线鳞数目、背鳍起点和肛门的相对位置等特征都处于近缘种四川爬岩鳅Ｂｅａｕｆｏｒｔｉａｓｚｅｃｈｕａｎｅｎｓｉｓ和贵州爬岩鳅Ｂ．ｋｗｅｉｃｈｏｗｅｎｓｉｓ之间，故命名为中间爬岩鳅，新种ＢｅａｕｆｏｒｔｉａｉｎｔｅｒｍｅｄｉａＴａｎｇｅｔＷａｎｇ，ｓｐ．ｎｏｖ．。

云南平鳍鳅科鱼类二新种

在编写《云南省动物志》的准备工作中,我们又一次整理了云南境内的平鳍鳅科鱼类标本,从中发现平鳍鳅亚科鱼类二新种,现描述于下。长体爬鳅Balitora elongata Chen et Li,新种(图1)正模编号839072,全长80毫米,体长62毫米。1983年9月采自云南漾濞河(属澜沧江水系)。副模编号748791,839073,839074分别于1974年8月、1983年9月采自漾濞河。745049,745050于1974年5月采自勐腊县曼庄(属澜沧江水系)。

四川省高原鳅属鱼类一新种（鲤形目：鳅科）

本文记述产于凉山西溪河的高原鳅属Ｔｒｉｐｌｏｐｈｙｓａ鱼类一新种，西溪高原鳅ＴｒｉｐｌｏＰｈｙｓａｘｉｑｉｅｎｓｉｓｓｐ．ｎｏｖ．，描述了其形态和生态特征，并与近似种进行了比较。

鳅科鱼类DNA条形码分析及泥鳅和大鳞副泥鳅的分子鉴定

采集了23种鳅科鱼类89尾个体的线粒体COI基因5端序列,分析了碱基组成以及不同鳅科鱼类之间的种间遗传距离和种内遗传距离。结果显示,鳅科鱼类的种间遗传距离显著大于种内遗传距离,表明以COI作为鳅科鱼类DNA条形码进行品种鉴定具有一定的可行性。在建立鳅科鱼类DNA条形码的基础上,设计了主要物种泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)和大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)特异性引物,结果显示,该引物具有较高的特异性和灵敏度,能够实现对泥鳅、大鳞副泥鳅及其混合样品的物种鉴定。

云南牛栏江云南鳅属鱼类二新种记述(鲤形目,爬鳅科,条鳅亚科)

记述了1992～2003年间采自云南牛栏江(属金沙江下游南侧直流)的云南鳅属Yunnanilus2新种,横斑云南鳅Y.spanisbripes sp.nov.和干河云南鳅Y.ganheensis sp.nov.。两新种均具不完全的侧线,应归属侧纹云南鳅组群Y.pleurotaenia group。

中国爬岩鳅属鱼类一新种记述(鲤形目,平鳍鳅科)

记述了采自云南省沾益县德泽乡牛栏江水域的平鳍鳅科爬岩鳅属鱼类1新种,牛栏爬岩鳅Beaufortia niulanensis Chen,Huang et Yang,sp.nov.。其特征:背鳍分支鳍条7,腹鳍分支鳍条21,侧线鳞90～95,胸鳍起点相对于鼻孔和眼前缘之间,背鳍起点相对于腹鳍起点至其基部后缘的中点稍后,肛门位于腹鳍基后缘至臀鳍起点间的中点,腹鳍末端接近肛门,这些特征组合可以将新种与同属的其他2个相近种,即四川爬岩鳅B.szechuanensis(Fang)和中间爬岩鳅B.intermedia Tang et Wang区别开来。

陕西省高原鳅一新种(鲤形目,爬鳅科)

描述了爬鳅科、条鳅亚科鱼类1新种,该种分布于陕西省西乡县大河镇楼房村通江上游的巴水河,隶属嘉陵江水系。

西藏条鳅亚科高原鳅属鱼类一新种（鲤形目：鳅科）

本文报道采自西藏金沙江鳅科条鳅亚科高原鳅属鱼类一新种，姚氏高原鳅Ｔｒｉｐｌｏｐｈｙｓａ（Ｔｒｉｐｌｏｐｈｓａ）ｙａｏｐｅｉｚｈｉｉｓｐ．ｎｏｖ。对其形态特征进行了描述，并与相近种做了比较。

广西岭鳅属鱼类一新种——罗城岭鳅(鲤形目:爬鳅科)

2008年9月,在广西壮族自治区罗城县天河镇附近一洞穴采集到一批条鳅亚科鱼类标本。经鉴定,为岭鳅属(Oreonectes)一新种。新种与岭鳅属的其他已知种类在以下组合特征上有区别:背鳍条3,7;臀鳍条2,5;胸鳍条1,11～12;腹鳍条1,7;尾鳍分枝鳍条为14～16。头平扁;眼正常;下唇表面具浅皱。腹鳍起点位于背鳍起点垂线下方之前,尾柄上、下缘无明显鳍褶;尾鳍后缘平截。体侧具不明显的细小鳞片,或鳞片隐于皮下。头部无侧线感觉系统管孔。成体粉红色,无色素,各鳍透明;浸泡标本体呈乳黄色,不透明,通体无色斑。

西藏鱼类一新纪录科——平鳍鳅科

2008年8月在西藏境内进行鱼类资源调查时,采到澜沧江西藏芒康县江段的彭氏爬鳅(Balitora pengiHuang),这是西藏境内首次记录的平鳍鳅科(Homalopteridae)鱼类。采集到的两尾彭氏爬鳅标本特征如下:体稍长,前部较平扁,后部渐显侧扁。口下位,中等大,呈弧形。吻端圆钝,边缘较薄。唇较薄。口前具吻沟和吻褶。吻褶发达,吻褶分3叶,中叶较大,叶间有吻须2对,外侧1对较长,口角须1对,唇具有明显乳突。眼小,侧上位。侧线完全,自体侧中部平直的延伸到尾鳍基部。背鳍短,起点距吻端较距尾鳍基部为近,腹鳍起点显著在背鳍起点之前。臀鳍末端压倒后缘不及尾鳍基部。偶鳍宽大平展,末端圆钝,鳍基部具肉质鳍柄。腹鳍左右分开,不连成吸盘。尾鳍叉形,下叶较长,其长度约等于头长。标本保存于西南大学生命科学学院。平鳍鳅科鱼类已知分布于长江以南的云南等省区,彭氏爬鳅主要分布于澜沧江水系支流流沙河南,此次在西藏境内采到彭氏爬鳅,使西藏自治区成为平鳍鳅科鱼类新的省级分布区,并增加了彭氏爬鳅在西藏境内澜沧江上游的分布记录。

广西鱼类一新属三新种(鲤形目:鲤科、鳅科)

在广西河池地区鱼类资源调查中,我们发现鲤科鱼类一新属二新种和鳅科鱼类一新种。描述如下:

云南鳅科鱼类3新种记述

描记采于云南省石林县境内的鳅科鱼类3新种.其中,条鳅亚科2新种,花鳅亚科1新种.以采集地名分别命名为响水箐高原鳅Triplophysaxiangshuingensis,spnov,巴江云南鳅Yunnanilusbajiangensis,spnov和圭山细头Paralepidocephalusguis hanensis,spnov.所有模式标本均保存在云南省石林县黑龙潭水库.

广西薄鳅属鱼类一新种(鲤形目,鳅科)

2007年10月,在广西桂平黔江采集到鳅科鱼类6尾,经鉴定为薄鳅属Leptobotia1新种,定名为斑点薄鳅Leptobotia punctatus sp.nov.。新种须3对,眼下刺不分叉,颊部有鳞。这些特征与薄鳅属一致。新种颏下无1对纽状突起,眼小,口角须短,背鳍起点位于腹鳍起点后方等特征与同属的桂林薄鳅L.guilinensis和后鳍薄鳅L.posterodorsalis最为相似。但有如下鉴别特征：新种体侧无垂直条纹,脊椎数目多,腹鳍末端不达肛门等特征,与桂林薄鳅相区别;体侧有斑点,外侧鳃耙数多,体较高,尾鳍深分叉,有3-4道黑色条纹等特征,与后鳍薄鳅相区别。新种仅分布于西江水系黔江。

四川西部高原鳅属鱼类两新种(鲤形目:鳅科)

本文报道采自四川西部安宁河的高原鳅属 Triplophysa Rendahl,1933 鱼类两新种:大桥高原鳅 Triplophysa daqiaoensis sp.nov.和短须高原鳅 Triplophysa brevibarba sp.nov。对新种的特征进行了描述,并与近似种的形态学特征作了比较。

贵州省云南鳅属鱼类一新种记述(鲤形目:鳅科)

本文报道产于贵州草海的云南鳅属(Yunnanilus)鱼类一新种,定名为草海云南鳅Y.caohaiensls sp.nov.。对新种的形态特征作了详细描述,并与相似种黑斑云南鳅Y.nigromaculatus(Regan)进行了比较研究。

河北省三种鳅科鱼类的染色体组型

本文采用给鱼腹腔注射PHA和秋水仙碱的方法,制得泥鳅、北方条鳅和北鳅的肾乃鳃细胞的染色体玻片标本。通过计数及组型分析得到:泥鳅2n=50,核型公式为:2n=6m+8sm+36t,NF=64;北方条鳅2n=50,核型公式为:2n=6m+6sm+6st+32t,NF=62;北鳅 2n=50。