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题名星状病毒鸽群分离株的全基因分析
被引量:1
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作者
王楷宬
王素春
庄青叶
邱源
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机构
中国动物卫生与流行病学中心
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出处
《中国动物检疫》
CAS
2018年第2期82-86,共5页
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基金
国家重点研发计划项目(2017YFC1200500)
中国动物卫生与流行病学中心创新基金(2015IF-0004FF)
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文摘
为分析鸽星状病毒中国分离株的特性,采用高通量测序方法,测定从山东省青岛市某活禽市场分离的鸽星状病毒基因组,并对其进行特性分析与比较基因组研究。结果显示:该病毒全基因大小为6 872 bp,具有与其他星状病毒相似的结构和基因顺序;5'端有一段非编码区,3'端为聚A尾。与15株代表性毒株的全基因组和衣壳蛋白氨基酸序列同源性分析证实,该病毒与挪威2003年分离的鸽星状病毒同源性高,属于GroupⅠ基因群禽星状病毒,而与我国2011年报道的鸽星状病毒存在差异。分析结果表明,我国鸽群中的星状病毒较为多样。
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关键词
鸽星状病毒
基因组
高通量测序
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Keywords
Pigeon astrovirus
genome
analysis
high-throughput sequencing
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分类号
S851.3
[农业科学—预防兽医学]
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题名高通量测序技术检测鸽群中病毒感染状况
被引量:4
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作者
王楷宬
庄青叶
邱源
刘朔
王素春
彭程
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机构
中国动物卫生与流行病学中心
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出处
《中国动物检疫》
CAS
2018年第5期81-84,共4页
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基金
国家重点研发计划项目(2017YFC120050)
中国动物卫生与流行病学中心创新基金(2015IF-0004FF)
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文摘
为了解我国鸽子病毒感染状况,采用高通量测序方法,对华东地区肉鸽携带的病原进行了检测,共检测到5种主要感染病原,包括禽轮状病毒、鸽圆环病毒、鸽星状病毒、鸽冠状病毒和鸽微RNA病毒B。除鸽圆环病毒外,其余4种病毒均在我国鸽群中首次被发现。该检测结果对我国的鸽群疫病监测和防控具有重要意义,同时证实高通量技术能够检测出动物群体中的主要感染病原,是动物疫病检测的新思路,有利于全面掌握动物病原感染状况,及时预警、处置和防控动物疫病的发生。
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关键词
高通量测序
鸽群
病毒检测
禽轮状病毒
鸽圆环病毒
鸽星状病毒
鸽冠状病毒
鸽微RNA病毒B
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Keywords
high-throughput sequencing
pigeon groups
virus detection
avian rotavirus
pigeon circovirus
pigeon astrovirus
pigeon coronavirus
pigeon piconavirus B
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分类号
S858.31
[农业科学—临床兽医学]
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