盐单胞菌属一新种——黄海盐单胞菌

以《伯杰氏系统细菌学手册》第1卷(1984年)等为主要依据,对从江苏省黄海盐场晒盐池分离到的H_5菌株进行了鉴定。结果表明,H_5菌株符合盐单胞菌属(Halomonas)的特征。但该菌株的形态、生理生化特性及DNA中G十C mol％等又不同于该属中的已知种。同时,H_5菌株与该属中的相关种——伸长盐单胞菌(Halomonas elongata ATCC 33173)的DNA杂交率为44.7％。因而将H_5菌株鉴定为盐单胞菌属的一个新种,命名为黄海盐单胞菌(Halomonas huanghaiensis sP. nov.),且H_5菌株作为模式株。

黄单胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss,分别命名为TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号肽而言,仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。

利用等电聚焦电泳研究黄单胞菌分类

对黄单胞菌的4个种及29个致病变种的代表菌株进行了等电聚焦电泳研究,发现所测定的黄单胞菌种间、致病变种间蛋白质图谱差别很大。电泳结果经聚类分析表明,某些致病变种间的差别并不一定比种间的差别小,说明某些致病变种可以上升到种这一分类地位。引起细菌性黑颖病的黄单胞菌禾谷致病变种、小麦致病变种、大麦致病变种间差别很小,仅有6条蛋白质谱带的差别。因此这3个致病变种的分类地位需重新考虑,同时说明等电聚焦电泳对黄单胞菌种下分类具有一定指导意义。

营养因子对黄单胞菌降解聚乙烯醇的影响

基于前期研究分离到的一株能完全降解聚乙烯醇(PVA)的黄单胞菌(Xanthomonas sp),考察了部分简单有机碳源、水溶性维生素、氨基酸对该菌株细胞生长和降解PVA的影响.结果表明,对所考察的3种共代谢基质,0.6 g/L葡萄糖在含2.0 g/L蛋白胨F403条件下,可使1.0g/L PVA完全降解时间缩短至约40 h.0.4 mg/L泛酸钙对细胞生长影响较小,但可促进细胞黄色素的形成,而黄色素含量高的静息细胞对PVA降解量有所增加.20.0 mg/L甲硫氨酸、半胱氨酸可促进细胞明显生长,进而提高PVA降解率.

水稻白叶枯病黄单胞菌中与甘蓝黑腐病黄单胞菌致病因子调控基因(rpf 基因)同源基因的分子克隆

DNA-DNA 杂交结果表明,水稻白叶枯病黄单胞菌总 DNA 中存在着与甘蓝黑腐病黄单胞菌致病因子调控基因(rpf 基因)具有同源性的 DNA 外段.应用广谱性寄主载体pLAFRI,在大肠杆菌中建立了水稻白叶枯病黄单胞菌野生型菌株 T3000的基因文库.从文库中筛选到与 rpf 基因具有同源性的克隆 pGXN3000,将重组质粒 pGXN3000通过三亲本接合转入甘蓝黑腐病黄单胞菌 rpf 基因突变体,发现 pGXN3000能互补甘蓝黑腐病黄单胞菌 rpf突变体,恢复其致病性胞外酶和胞外多糖的产生及致病性.转座子 Tn5诱变,缺失分析及DNA-DNA 杂交实验结果表明,重组质粒 pGXN3000中确实含有与甘蓝黑腐病黄单胞菌编码。双组份调控系统”蛋白的 rpfC 基因功能相同的基因,此基因被定位于 pGXN3000中的3kb BamHl 片段中。

假黄单胞菌株J1的筛选及木质纤维素降解基因的生物信息学分析

[目的]本研究旨在发掘木质纤维素降解菌种资源,并寻找木质纤维素降解关键酶基因和代谢通路。[方法]以纤维素为唯一碳源,从土壤、腐叶混合物中分离出27株具有纤维素降解能力的细菌。通过测定纤维素酶活力,将降解效果最优菌株进行全基因组测序。通过与同属细菌的全基因组序列的比对构建贝叶斯树。[结果]菌株J1内切纤维素酶、滤纸酶和β-葡萄糖苷酶活力峰值分别为0.39、0.18和0.11 IU·m L^(-1),并将菌株J1鉴定为假黄单胞菌(Pseudoxanthomonas sp.)。Clusters of Orthologous Groups(COG)和Carbohydrate-Active Enzyme Database(CAZy)等基因数据库注释结果表明:菌株J1具有木质纤维素降解酶基因。代谢通路预测表明:该菌株具有利用纤维素生成乙醇的代谢通路。[结论]本研究分离筛选到的假黄单胞菌株J1可以作为生物乙醇发酵的候选菌株,同时测序获得的全基因组数据将为假黄单胞菌属降解木质纤维素的途径提供依据。

野油菜黄单胞菌L4生产黄单胞菌多糖的适宜条件

研究了野油菜黄单胞L_4生产黄单胞菌多糖的适宜培养基和培养条件。培养基组成(g/L)为:蔗糖40—50,铵盐1.0—1.25,酵母膏2.0—3.0,CaCO_3 3.0,MgSO_4·7H_2O 0.25,Na_2HPO_4·12H_2O 0.1,柠檬酸0.01—0.10,pH7.5。种龄为48小时以上。在30℃于旋转式摇床(200r/min)上培养3天,发酵液粘度高达14000—16000cp。用乙醇沉淀得多糖28g/L以上。

黄颡鱼溃疡病病原菌分离鉴定及药敏试验

溃疡病（Canker）是鱼易患的一种细菌性疾病，主要表现为局部出现红肿、出血、发炎、鱼鳞脱落、生成白色絮状物、继而溃烂，最后死亡，该病发病率高，且死亡情况明显。在鳗鱼、鲈鱼、金鱼、鲫鱼、鲤鱼等均有报道，其致病菌主要有气单胞菌属占59．1％、不动杆菌占13．3％、黄杆菌占10．8％、肠球菌占1．2％、克雷伯氏菌占1．2％。其中气单胞菌属不仅是淡水鱼类出血性败血症的主要病原菌，同时也是中华鳖、牛蛙、三角帆蚌等水生经济动物的重要致病菌。

黄原胶高产菌株及其发酵工艺

黄原胶是由黄单胞菌属(Xanthomonas)的细菌经工业发酵制得的一种细菌胶,其水溶液具有多方面的优良特性,被广泛用于食品、医药、石油开采、陶瓷和化妆品等行业。国外对黄原胶的研究和生产已有近30年的历史,生产水平相对较高。

加拿大批准刺槐豆胶、黄原胶用于甜肉馅

据加拿大卫生部网站消息，9月26日加拿大卫生部发布通告，修订《乳化剂、胶凝剂、稳定剂和增稠剂列表》，批准刺槐豆胶、黄原胶用于甜肉馅。刺槐豆胶也称槐豆胶．是由产于地中海一带的刺槐树种子加工而成的植物子胶。黄原胶，是一种由假黄单胞菌属发酵产生的单孢多糖。之前加拿大禁止这两种胶用于甜肉馅。

XppI调控水稻白叶枯病菌致病力的潜在机制

为了解肽基脯氨酰顺反异构酶XppI(Xanthomonas peptidyl-prolyl isomerase)在Xoo(Xanthomonas oryzae pv.oryzae)与水稻互作中的作用,首先通过体外酶活实验分析了XppI的异构酶活性,随后通过同源重组法构建了xppI的突变体及其互补菌株,并分析了XppI对病原菌生长、致病力、胞外酶活性及抗氧化胁迫能力的调控作用。结果显示:XppI具有肽基脯氨酰顺反异构酶活性,能够正调控Xoo的致病力和抗氧化胁迫的能力,但不影响病原菌的生长和胞外酶活性。以上结果表明,XppI可能通过调控与抗氧化相关途径蛋白的构型影响病原菌应对宿主氧胁迫的能力,进而增强Xoo的致病力。

一株苄嘧磺隆降解菌的分离·筛选与鉴定

[目的]从长期使用苄嘧磺隆的土壤中分离筛选出降解苄嘧磺隆的微生物菌株,并对其进行形态学和生理生化鉴定。[方法]从河北保定农郊被农药污染的土壤中分离筛选出降解苄嘧磺隆的微生物菌株。采用液体发酵的方法筛选降解苄嘧磺隆的菌株,分别于18、48、72 h取发酵液,用结晶紫染液涂片染色,观察细菌的生长情况,对涂片结果中菌体生长较好的菌种进行菌种鉴定。[结果]从含有除草剂苄嘧磺隆的初筛培养基中分离筛选出一株具有较好降解能力的菌株C1-11-2,它能够以苄嘧磺隆作为碳源生长。通过形态学、生理生化鉴定及16S rDNA测序,初步鉴定该菌为黄单胞菌属(Xanthornonas)。[结论]为苄嘧磺隆微生物降解的研究奠定了坚实的基础。

南海中部海域异养细菌的生态分布

研究了1983年9月和1984年5月南海中部海域海水中,异养细菌的生态分布。结果表明:异养细菌数量范围为7.7×10~3～9.2×10~4个/L;异养细菌属于十六属和一科,革兰氏阴性菌占优势,它们较适应低温;在南海中部海域的异养细菌对有机质的降解和转化有较强的能力;水温和有机质浓度影响异养细菌的分布。

一株聚乙烯醇降解菌的降解特性

从腐败的PVA胶水中分离到一株能高效降解并矿化聚乙烯醇的细菌Xa5,经初步鉴定属于黄单胞菌属(Xanthomonassp.).该菌株生长需要复杂的有机氮,蛋白胨和牛肉膏可提高该菌对聚乙烯醇的降解速率,其中蛋白胨的加量对降解聚乙烯醇影响较大.该菌降解聚乙烯醇要求的pH范围较宽.不同聚合度的聚乙烯醇对其降解速率影响不大.该菌的降解过程可能是聚乙烯醇首先吸附在细胞表面,然后进行氧化降解.在静息细胞降解过程中,以TOC表示,1g·L-1(DCW)菌体可在52h内将1g·L-1聚乙烯醇基本矿化,但该菌株的PVA氧化酶酶活、脱氢酶酶活和PVA降解总酶活则较难测出.

LAS高效降解菌的分离鉴定及其降解性能的初步研究

从环境中筛选分离出能高效降解直链烷基苯磺酸钠（LAS）的菌株,研究其降解性能,以期为LAS污染治理提供菌种资源。利用富集培养技术从重庆市某地区经含洗涤剂污水长期浸泡的污泥中分离获得1株对直链烷基苯磺酸钠（LAS）具有较强降解能力的菌株,命名为L1。通过对菌株形态、生理和生化特性分析,初步鉴定菌株L1为黄单胞菌属（Xanthomona sp.）。经研究,该菌的生长和LAS降解率在pH5.0~7.5之间比较稳定,其中在pH为7.0时效果最佳,并且具有一定的酸碱调节能力。LAS浓度为150mg/L,是该菌生长和LAS降解的最适浓度,48h菌体生长量测定的吸光值可达0.413,LAS降解率可达87.64%,表明菌株L1具有治理LAS污染的潜在应用价值。

红掌细菌性叶枯病病原菌的分离与鉴定

采用组织分离法,从发病的红掌叶片上分离、纯化病原菌,对纯化的病原菌进行菌落形态、致病性、生化特性测定,并对细菌特异基因ABC transporter进行分离及序列分析。结果表明,分离得到的病原菌为地毯草黄单胞菌属细菌,为红掌的致病菌。

一株单宁降解菌的鉴定及其对青海“双低”菜籽粕中单宁降解效果

微生物固态发酵法是简易有效的饲料中单宁处理方法之一。筛选微生物资源是微生物固态发酵法的核心内容。自青海门源高寒草甸土壤中分离到一株单宁降解菌DT-3,对菌种DT-3进行了鉴定,并针对青海“双低”菜籽粕完成固态发酵处理效果研究。结果显示,菌种DT-3具有明显的单宁降解特性。通过形态学检测、生理生化检测及16S rRNA序列比对分析,菌种DT-3属于假黄单胞菌属(Pseudoxanthomonas),命名为Pseudoxanthomonas sp.DT-3(MK 418539)。通过DT-3对青海“双低”菜籽粕中单宁降解效果的研究表明,在料液比、发酵温度及发酵天数等处理条件下,DT-3单宁降解效果差异显著,其中料液比100%、发酵温度25℃、发酵天数5 d时单宁降解率最大,分别达到58.8%、62.95%及61.74%。综上所述,菌种DT-3是有效的“双低”菜籽粕固态发酵处理备选菌种资源。