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黄毛纺蚋线粒体基因组全序列测定与分析
被引量:
3
1
作者
王强
陈丽芬
+2 位作者
丁俊杰
刘仰青
王建国
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2016年第2期361-370,共10页
利用PCR步移法对黄毛纺蚋的线粒体基因组全序列进行了测定和分析。黄毛纺蚋线粒体基因组全长15904 bp(Gen Bank序列号KP793690),包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因以及长度为939 bp的非编码区。A、T、C、G碱基含量分别为...
利用PCR步移法对黄毛纺蚋的线粒体基因组全序列进行了测定和分析。黄毛纺蚋线粒体基因组全长15904 bp(Gen Bank序列号KP793690),包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因以及长度为939 bp的非编码区。A、T、C、G碱基含量分别为39.1%、35.8%、10.4%、14.7%。9个蛋白编码基因和14个tRNA基因在J链编码,其余4个蛋白编码基因和8个tRNA基因在N链编码,基因排列顺序与其它已知双翅目昆虫相同。13个蛋白编码基因中除COI以TTG作为起始密码外,其余蛋白质基因均以ATN作为起始密码子,终止密码子多数为典型的TAA、TAG,只有COI和ND4L以单独的T作为终止密码子。在所测得的22个tRNA基因中,除tRNASer(AGN)缺少DHU臂外,其余tRNA均能形成典型的三叶草结构。
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关键词
黄毛纺蚋
双翅目
线粒体基因组
密码子
下载PDF
职称材料
福建省五条蚋和黄毛纺蚋nrDNA-ITS序列分析(双翅目:蚋科)
被引量:
1
2
作者
王宇平
高博
+2 位作者
张建庆
王光辉
黄恩炯
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2010年第1期29-33,共5页
克隆并测定福建省五条蚋Simulium(Simulium)quinquestriatum和黄毛纺蚋Simulium(Nevermannia)aureohirtumnr DNA—ITS序列,分别与GenBank中发表的Simulium亚属和Nevermannia亚属序列进行系统进化树分析,探讨其在蚋类分子分类中的...
克隆并测定福建省五条蚋Simulium(Simulium)quinquestriatum和黄毛纺蚋Simulium(Nevermannia)aureohirtumnr DNA—ITS序列,分别与GenBank中发表的Simulium亚属和Nevermannia亚属序列进行系统进化树分析,探讨其在蚋类分子分类中的作用。结果表明,各蚋种克隆株ITS2序列均与相应物种聚类,符合形态学鉴定结果,可作为蚋种鉴定和近缘种类鉴别的遗传标记之一;ITS1序列在五条蚋中同源性较低(88.3%),不适合做分类遗传标记;黄毛纺蚋泉州、漳浦两地理株间存在变异。
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关键词
五条
蚋
黄毛纺蚋
RDNA
ITS
序列
系统进化树
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职称材料
题名
黄毛纺蚋线粒体基因组全序列测定与分析
被引量:
3
1
作者
王强
陈丽芬
丁俊杰
刘仰青
王建国
机构
江西农业大学农学院
江西省疾病预防控制中心
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2016年第2期361-370,共10页
基金
国家自然科学基金(31160380
31360457)
文摘
利用PCR步移法对黄毛纺蚋的线粒体基因组全序列进行了测定和分析。黄毛纺蚋线粒体基因组全长15904 bp(Gen Bank序列号KP793690),包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因以及长度为939 bp的非编码区。A、T、C、G碱基含量分别为39.1%、35.8%、10.4%、14.7%。9个蛋白编码基因和14个tRNA基因在J链编码,其余4个蛋白编码基因和8个tRNA基因在N链编码,基因排列顺序与其它已知双翅目昆虫相同。13个蛋白编码基因中除COI以TTG作为起始密码外,其余蛋白质基因均以ATN作为起始密码子,终止密码子多数为典型的TAA、TAG,只有COI和ND4L以单独的T作为终止密码子。在所测得的22个tRNA基因中,除tRNASer(AGN)缺少DHU臂外,其余tRNA均能形成典型的三叶草结构。
关键词
黄毛纺蚋
双翅目
线粒体基因组
密码子
Keywords
Simulium aureohirtum
Diptera
mitochondrial genome
codon
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
福建省五条蚋和黄毛纺蚋nrDNA-ITS序列分析(双翅目:蚋科)
被引量:
1
2
作者
王宇平
高博
张建庆
王光辉
黄恩炯
机构
福建省国际旅行卫生保健中心
出处
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2010年第1期29-33,共5页
基金
基金项目:国家质量监督检验检疫总局科研基金项目(20071K199)
文摘
克隆并测定福建省五条蚋Simulium(Simulium)quinquestriatum和黄毛纺蚋Simulium(Nevermannia)aureohirtumnr DNA—ITS序列,分别与GenBank中发表的Simulium亚属和Nevermannia亚属序列进行系统进化树分析,探讨其在蚋类分子分类中的作用。结果表明,各蚋种克隆株ITS2序列均与相应物种聚类,符合形态学鉴定结果,可作为蚋种鉴定和近缘种类鉴别的遗传标记之一;ITS1序列在五条蚋中同源性较低(88.3%),不适合做分类遗传标记;黄毛纺蚋泉州、漳浦两地理株间存在变异。
关键词
五条
蚋
黄毛纺蚋
RDNA
ITS
序列
系统进化树
Keywords
Simulium quinquestriatum
Simulium aureohirtum
rDNA
Sequence
Phylogeny tree
分类号
Q969.442.9 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄毛纺蚋线粒体基因组全序列测定与分析
王强
陈丽芬
丁俊杰
刘仰青
王建国
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2016
3
下载PDF
职称材料
2
福建省五条蚋和黄毛纺蚋nrDNA-ITS序列分析(双翅目:蚋科)
王宇平
高博
张建庆
王光辉
黄恩炯
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2010
1
下载PDF
职称材料
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