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黄荆坪竹根椒叶绿体基因组密码子使用偏好性及影响因素分析
被引量:
1
1
作者
龚意辉
唐诗眙
+3 位作者
周桂花
陈磊
张斌
李鹏
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第20期28-34,共7页
为了解黄荆坪竹根椒(Capsicum annuum L. cv Huang Jingping)叶绿体基因组密码子使用模式,以其51条蛋白编码序列(coding sequence, CDS)为研究对象,采用Codon W 1.4.2、CUSP、 Excel 2010、SPSS 16.0等软件对黄荆坪竹根椒密码子的GC含...
为了解黄荆坪竹根椒(Capsicum annuum L. cv Huang Jingping)叶绿体基因组密码子使用模式,以其51条蛋白编码序列(coding sequence, CDS)为研究对象,采用Codon W 1.4.2、CUSP、 Excel 2010、SPSS 16.0等软件对黄荆坪竹根椒密码子的GC含量、有效密码子值(ENC)、RSCU、中性绘图、ENC-plot、PR2-plot、最优密码子及其影响因素进行详细的分析。结果表明,黄荆坪竹根椒密码子第1位(GC1)、第2位(GC2)、第3位(GC3)中的GC含量分别为42.68%、36.25%、27.89%,其中GC1>GC2>GC3,表明密码子第3位碱基以A/U结尾为主;ENC值介于34.10%~54.31%之间,平均值为46.55%,表明黄荆坪竹根椒密码子偏好性较弱。相关性分析结果表明:(1)GC1与GC2呈极显著正相关,GCall与GC1、GC2、GC3均为极显著正相关;(2)ENC与GC1、GC2均不存在显著相关关系,但与GC3存在极显著相关关系。RSCU分析结果显示:在黄荆坪竹根椒叶绿体基因组中共有30个高频密码子的RSCU>1,其中以U、A、G结尾的高频密码子数分别为16、13、1个,表明黄荆坪竹根椒密码子第3位偏好以A或U结尾。ENC-plot绘图分析结果表明,黄荆坪竹根椒基因组中大多数基因位于标准曲线下方,有13个基因的ENC比值介于-0.05~0.05之间,说明选择压力主要影响黄荆坪竹根椒密码子的偏好性;PR2-plot分析结果表明,黄荆坪竹根椒叶绿体基因组中大部分基因位于平面图的右下方,即T>A、G>C,表明碱基突变、自然选择压力等多种因素共同影响黄荆坪竹根椒密码子的偏好性。在黄荆坪竹根椒叶绿体基因组中共筛选出GCA、GCU、AGA等19个最优密码子并全部以A/U结尾。本研究结果可为进一步开展黄荆坪竹根椒性状改良、遗传进化及叶绿体基因工程的应用提供分子理论支撑。
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关键词
黄荆坪
竹根椒
叶绿体基因组
密码子偏好性
最优密码子
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职称材料
设施大棚内黄荆坪竹根椒生长期间主要病虫害的调查
被引量:
1
2
作者
姚国辉
吴剑
+3 位作者
龚意辉
李静怡
肖建平
李鹏
《现代园艺》
2023年第17期88-91,共4页
为明确设施大棚内黄荆坪竹根椒生长期间主要病虫害的发生及防治情况,采用随机取样法,对设施大棚内黄荆坪竹根椒不同发育时期病虫害种类、为害症状及其发生规律进行了调查分析。结果表明,在黄荆坪竹根椒生长发育期间发生的主要病害有病...
为明确设施大棚内黄荆坪竹根椒生长期间主要病虫害的发生及防治情况,采用随机取样法,对设施大棚内黄荆坪竹根椒不同发育时期病虫害种类、为害症状及其发生规律进行了调查分析。结果表明,在黄荆坪竹根椒生长发育期间发生的主要病害有病毒病、褐斑病、炭疽病等,病害发病率随着黄荆坪竹根椒的生长发育总体上呈现先升高后降低的趋势,在7月20日发病率最高,其中病毒病对辣椒的为害最为严重,主要为害辣椒叶片。主要虫害有甜菜夜蛾、烟青虫、白粉虱等,虫害指数随着黄荆坪竹根椒的生长发育总体上呈现出先升高后降低的趋势,在7月10日虫害指数达最大值,其中甜菜夜蛾为害最为严重。在黄荆坪竹根椒生长期间喷施2.5%溴氰菊酯能有效抑制虫害的发生。本研究结果有助于对黄荆坪竹根椒病虫害进行绿色防控,减少病虫害的发生,为提高黄荆坪竹根椒产量和经济效益打下良好的基础,同时也为茄科作物的绿色防控提供理论基础。
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关键词
黄荆坪
竹根椒
病虫害
发生规律
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职称材料
这么好的树,你们舍得砍掉它?
3
《新湘评论》
2019年第9期46-46,共1页
1958年,彭德怀回湖南作调查研究。一路上,他看到不少地方砍树大炼钢铁,昔日茂密的山林变得光秃秃的,心情很是沉重。当他来到湘潭县一个叫黄荆坪的小山村时,看见一群人正围在一起砍一棵大树,便急步走上前去说:'这么好的树,长成这个...
1958年,彭德怀回湖南作调查研究。一路上,他看到不少地方砍树大炼钢铁,昔日茂密的山林变得光秃秃的,心情很是沉重。当他来到湘潭县一个叫黄荆坪的小山村时,看见一群人正围在一起砍一棵大树,便急步走上前去说:'这么好的树,长成这个样子不容易啊.你们舍得砍掉它?让它留下来在这儿给过路的人遮风挡雨不好吗?'这时大树的齐根处已被斧子砍进一道深沟,陪同彭老总调研的湖南省委一位领导同志连忙吩咐干部停止砍树。
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关键词
砍树
湘潭县
黄荆坪
研究
大树
调查
深沟
斧子
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职称材料
题名
黄荆坪竹根椒叶绿体基因组密码子使用偏好性及影响因素分析
被引量:
1
1
作者
龚意辉
唐诗眙
周桂花
陈磊
张斌
李鹏
机构
湖南人文科技学院农业与生物技术学院
湘潭市农业科学研究所
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第20期28-34,共7页
基金
湖南省教育厅科学研究重点项目(编号:20A281)
湖南省自然科学基金面上项目(编号:2021JJ30376)
+1 种基金
湖南省科技特派员服务乡村振兴项目(编号:2022NK4218)
湘潭市农业科学研究所横向项目(编号:380220590112)。
文摘
为了解黄荆坪竹根椒(Capsicum annuum L. cv Huang Jingping)叶绿体基因组密码子使用模式,以其51条蛋白编码序列(coding sequence, CDS)为研究对象,采用Codon W 1.4.2、CUSP、 Excel 2010、SPSS 16.0等软件对黄荆坪竹根椒密码子的GC含量、有效密码子值(ENC)、RSCU、中性绘图、ENC-plot、PR2-plot、最优密码子及其影响因素进行详细的分析。结果表明,黄荆坪竹根椒密码子第1位(GC1)、第2位(GC2)、第3位(GC3)中的GC含量分别为42.68%、36.25%、27.89%,其中GC1>GC2>GC3,表明密码子第3位碱基以A/U结尾为主;ENC值介于34.10%~54.31%之间,平均值为46.55%,表明黄荆坪竹根椒密码子偏好性较弱。相关性分析结果表明:(1)GC1与GC2呈极显著正相关,GCall与GC1、GC2、GC3均为极显著正相关;(2)ENC与GC1、GC2均不存在显著相关关系,但与GC3存在极显著相关关系。RSCU分析结果显示:在黄荆坪竹根椒叶绿体基因组中共有30个高频密码子的RSCU>1,其中以U、A、G结尾的高频密码子数分别为16、13、1个,表明黄荆坪竹根椒密码子第3位偏好以A或U结尾。ENC-plot绘图分析结果表明,黄荆坪竹根椒基因组中大多数基因位于标准曲线下方,有13个基因的ENC比值介于-0.05~0.05之间,说明选择压力主要影响黄荆坪竹根椒密码子的偏好性;PR2-plot分析结果表明,黄荆坪竹根椒叶绿体基因组中大部分基因位于平面图的右下方,即T>A、G>C,表明碱基突变、自然选择压力等多种因素共同影响黄荆坪竹根椒密码子的偏好性。在黄荆坪竹根椒叶绿体基因组中共筛选出GCA、GCU、AGA等19个最优密码子并全部以A/U结尾。本研究结果可为进一步开展黄荆坪竹根椒性状改良、遗传进化及叶绿体基因工程的应用提供分子理论支撑。
关键词
黄荆坪
竹根椒
叶绿体基因组
密码子偏好性
最优密码子
分类号
S641.301 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
设施大棚内黄荆坪竹根椒生长期间主要病虫害的调查
被引量:
1
2
作者
姚国辉
吴剑
龚意辉
李静怡
肖建平
李鹏
机构
和平街道办事处经济发展和农业农村办
湖南人文科技学院农业与生物技术学院
湖南省湘潭市农业科学研究所
湖南省湘潭县七兴生态蔬菜种植专业合作社
出处
《现代园艺》
2023年第17期88-91,共4页
基金
湖南省科技特派员服务乡村振兴项目(2022NK4218)。
文摘
为明确设施大棚内黄荆坪竹根椒生长期间主要病虫害的发生及防治情况,采用随机取样法,对设施大棚内黄荆坪竹根椒不同发育时期病虫害种类、为害症状及其发生规律进行了调查分析。结果表明,在黄荆坪竹根椒生长发育期间发生的主要病害有病毒病、褐斑病、炭疽病等,病害发病率随着黄荆坪竹根椒的生长发育总体上呈现先升高后降低的趋势,在7月20日发病率最高,其中病毒病对辣椒的为害最为严重,主要为害辣椒叶片。主要虫害有甜菜夜蛾、烟青虫、白粉虱等,虫害指数随着黄荆坪竹根椒的生长发育总体上呈现出先升高后降低的趋势,在7月10日虫害指数达最大值,其中甜菜夜蛾为害最为严重。在黄荆坪竹根椒生长期间喷施2.5%溴氰菊酯能有效抑制虫害的发生。本研究结果有助于对黄荆坪竹根椒病虫害进行绿色防控,减少病虫害的发生,为提高黄荆坪竹根椒产量和经济效益打下良好的基础,同时也为茄科作物的绿色防控提供理论基础。
关键词
黄荆坪
竹根椒
病虫害
发生规律
分类号
S43 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
这么好的树,你们舍得砍掉它?
3
出处
《新湘评论》
2019年第9期46-46,共1页
文摘
1958年,彭德怀回湖南作调查研究。一路上,他看到不少地方砍树大炼钢铁,昔日茂密的山林变得光秃秃的,心情很是沉重。当他来到湘潭县一个叫黄荆坪的小山村时,看见一群人正围在一起砍一棵大树,便急步走上前去说:'这么好的树,长成这个样子不容易啊.你们舍得砍掉它?让它留下来在这儿给过路的人遮风挡雨不好吗?'这时大树的齐根处已被斧子砍进一道深沟,陪同彭老总调研的湖南省委一位领导同志连忙吩咐干部停止砍树。
关键词
砍树
湘潭县
黄荆坪
研究
大树
调查
深沟
斧子
分类号
D232 [政治法律—中共党史]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄荆坪竹根椒叶绿体基因组密码子使用偏好性及影响因素分析
龚意辉
唐诗眙
周桂花
陈磊
张斌
李鹏
《江苏农业科学》
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
设施大棚内黄荆坪竹根椒生长期间主要病虫害的调查
姚国辉
吴剑
龚意辉
李静怡
肖建平
李鹏
《现代园艺》
2023
1
下载PDF
职称材料
3
这么好的树,你们舍得砍掉它?
《新湘评论》
2019
0
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职称材料
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