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3种鲍16S rRNA基因片段分析及系统发育研究
1
作者
郭战胜
张军伟
+3 位作者
李亮
侯旭光
张海涛
张学进
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期1-8,共8页
运用PCR技术对皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)、黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)3种鲍16S rRNA基因扩增,纯化后测序。结果表明:皱纹盘鲍、黑足鲍和黑唇鲍序列长度分别为544、546、550 bp,序列AT含量分别为58.1%、56.1%和55.9%,三者...
运用PCR技术对皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)、黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)3种鲍16S rRNA基因扩增,纯化后测序。结果表明:皱纹盘鲍、黑足鲍和黑唇鲍序列长度分别为544、546、550 bp,序列AT含量分别为58.1%、56.1%和55.9%,三者序列同源性高达94.18%,碱基变异位点分别集中在9~34 bp、248~295 bp、326~375 bp。所得结果与Genebank中22种鲍相应序列进行对比分析,25种鲍遗传距离距离在0.00~0.14之间;用NJ和ML法绘制系统发育树分析其亲缘关系,结果表明鲍科系统发育呈现出一定的区域性,并且染色体数目相同的物种容易聚为一支。
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关键词
皱纹盘
鲍
黑
足
鲍
黑唇鲍
16S
RRNA
系统发育
原文传递
题名
3种鲍16S rRNA基因片段分析及系统发育研究
1
作者
郭战胜
张军伟
李亮
侯旭光
张海涛
张学进
机构
山东大学(威海)海洋学院
威海市环翠区海洋与渔业研究所
出处
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期1-8,共8页
基金
山东省科技发展计划资助项目(2014GHY115014)
文摘
运用PCR技术对皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)、黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)3种鲍16S rRNA基因扩增,纯化后测序。结果表明:皱纹盘鲍、黑足鲍和黑唇鲍序列长度分别为544、546、550 bp,序列AT含量分别为58.1%、56.1%和55.9%,三者序列同源性高达94.18%,碱基变异位点分别集中在9~34 bp、248~295 bp、326~375 bp。所得结果与Genebank中22种鲍相应序列进行对比分析,25种鲍遗传距离距离在0.00~0.14之间;用NJ和ML法绘制系统发育树分析其亲缘关系,结果表明鲍科系统发育呈现出一定的区域性,并且染色体数目相同的物种容易聚为一支。
关键词
皱纹盘
鲍
黑
足
鲍
黑唇鲍
16S
RRNA
系统发育
Keywords
H. discus hannai
H. iris
H. rubra
16S rRNA
phylogeny
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
3种鲍16S rRNA基因片段分析及系统发育研究
郭战胜
张军伟
李亮
侯旭光
张海涛
张学进
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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