基于线粒体细胞色素b基因对大耳姬鼠和龙姬鼠分类关系的探讨

大耳姬鼠Apodemus latronum的分类地位,尤其它和龙姬鼠A.draco的关系,还存在着争议。用PCR扩增了采集自5个不同地点的大耳姬鼠的线粒体细胞色素b(cytb)基因,并和GenBank已有的3条大耳姬鼠cytb序列一起分析其碱基组成和变异情况。采用邻接法(Neighbor-joining,NJ)、最大简约法(Maximum parsimony,MP)、最大似然法(Maximum likelihood,ML)和贝叶斯法(Bayesian inference,BI)构建了大耳姬鼠和龙姬鼠的系统发育树。4种方法构建的系统发育树拓扑结构一致,大耳姬鼠和龙姬鼠均各自形成单系,龙姬鼠先与台湾森鼠A.semotus聚在一起,再与大耳姬鼠形成姐妹群。此外,大耳姬鼠和龙姬鼠两者间的K2P平均遗传距离达到0.14。因此,认为大耳姬鼠是一个独立的种,而不是龙姬鼠的一个亚种。