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华西牛与雪龙黑牛背最长肌重量的全基因组关联分析
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作者 杜悦莹 安炳星 +6 位作者 邓天宇 杜丽丽 梁忙 李柯安宁 曹晟 高会江 闵令江 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第6期32-40,共9页
为了筛选华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量相关的遗传标记和候选基因,试验以1478头华西牛和452头雪龙黑牛为研究对象,对其背最长肌重量性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),即测定其屠宰后背最长肌重量表型数据... 为了筛选华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量相关的遗传标记和候选基因,试验以1478头华西牛和452头雪龙黑牛为研究对象,对其背最长肌重量性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),即测定其屠宰后背最长肌重量表型数据,利用Illumina Bovine-HD(770K)芯片对其基因组进行基因分型,采用FarmCPU模型和GEMMA模型对质控后的芯片数据进行GWAS,挖掘与华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点和候选基因。结果表明:华西牛与雪龙黑牛群体背最长肌重量表型性状均符合正态分布,且二者芯片数据经过质控后分别得到607198,511320个SNP位点,这些SNP位点在二者各个染色体上的分布比较均匀;利用FarmCPU模型在华西牛与雪龙黑牛群体分别检测到12个和9个与其背最长肌重量显著相关的SNP位点,且华西牛群体的显著SNP位点分别位于1,5,7,11,12,13,15,16,22,23号染色体上,鉴定到KCNAB1、PFN2、RNF13、TTLL1、MCAT、CREB3L3、ZBTB7A、MAP2K2、CAMKMT、ZC3H13、OPTN、MCM10、UCMA、OVOL2、PET117、KAT14、MAML2、HHAT、FHIT和LY86共20个候选基因;雪龙黑牛群体的SNP位点分别位于4,16,27号染色体上,鉴定到PCLO、DCTD、WWC2共3个候选基因;利用GEMMA模型在华西牛与雪龙黑牛群体中分别检测到6个与其背最长肌重量显著相关的SNP位点,其中华西牛群体的SNP位点位于13号染色体上,鉴定到GATA3、TAF3、ODAD2、SNX5、MGME1、OVOL2、KAT14、PET117共8个候选基因;雪龙黑牛群体的SNP位点位于1,4,5,25号染色体上,但未鉴定到有效的候选基因。说明在华西牛和雪龙黑牛群体中分别检测到的18个和15个SNP位点与注释到的25个和3个候选基因可作为改良牛背最长肌重量的新的分子标记和候选基因。 展开更多
关键词 全基因组关联分析(GWAS) 华西牛 雪龙黑牛 背最长肌 重量 候选基因
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雪龙黑牛GH、CAPN1和CAST基因多态性及其与经济性状的相关性研究 被引量:3
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作者 赵敬贤 陈晓杰 +4 位作者 高雪 许尚忠 李俊雅 高会江 张路培 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第12期190-196,共7页
本研究以大连雪龙产业集团的F2代商品雪龙黑牛为试验动物,利用PCR-RFLP技术研究生长激素(GH)、钙激活蛋白酶(CAPN1)、钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因的遗传多态性,并用最小二乘法拟合线性模型对各标记基因型与肉牛经济性状进行关联分析。... 本研究以大连雪龙产业集团的F2代商品雪龙黑牛为试验动物,利用PCR-RFLP技术研究生长激素(GH)、钙激活蛋白酶(CAPN1)、钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因的遗传多态性,并用最小二乘法拟合线性模型对各标记基因型与肉牛经济性状进行关联分析。结果显示,GH-P3、CAPN1 316和CAST-UoG SNPs位点属于中度多态。GH-P3位点与三角牛腩厚极显著相关(P<0.01),与上脑盖重、脂色等级显著相关(P<0.05),其中AA基因型个体三角牛腩厚分别比AB和BB基因型个体厚0.42、0.60cm,上脑盖重分别比AB和BB基因型个体重0.52、0.78kg,脂色等级分别比AB和BB基因型个体高0.95、1.16;CAST-UoG位点与三角牛腩厚和脂肪厚显著相关(P<0.05),其中AA基因型个体三角牛腩厚分别比AB和BB基因型个体厚0.32、0.30cm,脂肪厚分别比AB和BB基因型个体厚0.80、0.47cm;CAPN1 316位点与所研究的经济性状无明显的相关性(P>0.05)。因此,在雪龙黑牛选育过程中可以把AA基因型作为标记基因型进行品种选育。 展开更多
关键词 雪龙黑牛 GH基因 CAPN1基因 CAST基因 经济性状
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ctsd、ctsl基因的多态性与“雪龙”黑牛胴体性状相关性研究 被引量:1
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作者 陈晓杰 吴蒙 +12 位作者 张立敏 陈翠 刘喜冬 周正奎 张猛 黄萌 刘利 高雪 许尚忠 李俊雅 高会江 张路培 李姣 《中国农学通报》 CSCD 2012年第2期6-9,共4页
为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS9.2软件采用最小二乘拟合线性模型进行分析,结果表明,ctsd、c... 为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS9.2软件采用最小二乘拟合线性模型进行分析,结果表明,ctsd、c581t位点与雪龙黑牛的经济性状无明显的相关性,ctsl基因Xma I位点与雪龙黑牛的三角牛腩厚显著相关,且AB型个体三角牛腩厚与AA和BB型个体三角牛腩厚差异显著。 展开更多
关键词 雪龙黑牛 ctsd基因 ctsl基因 胴体性状
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雪花型沃金黑牛肉滴水损失率的分析研究 被引量:3
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作者 刘笑笑 赵云辉 +3 位作者 王多伽 金香淑 吴健 赵玉民 《现代食品》 2022年第7期172-174,共3页
为探究雪花型沃金黑牛宰后成熟期间滴水损失率情况,对同一饲养条件、健康无病、发育正常、30月龄的沃金黑牛母牛、阉牛各9头,均取背最长肌西冷部位在宰后成熟24 h、48 h、72 h、96 h、120 h和144 h测定肌肉的滴水损失率。结果表明,随着... 为探究雪花型沃金黑牛宰后成熟期间滴水损失率情况,对同一饲养条件、健康无病、发育正常、30月龄的沃金黑牛母牛、阉牛各9头,均取背最长肌西冷部位在宰后成熟24 h、48 h、72 h、96 h、120 h和144 h测定肌肉的滴水损失率。结果表明,随着宰后成熟时间的增加,沃金黑牛母牛和阉牛肉的滴水损失率显著增加(P<0.05);从性别来看,阉牛的滴水损失率低于母牛。 展开更多
关键词 沃金黑牛肉 滴水损失 雪花型 性别
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