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利用ILP标记分析水稻籼粳杂交亲本和衍生系的籼粳分化 被引量:10
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作者 许旭明 梁康迳 +4 位作者 张受刚 尚伟 张瑛英 韦新宇 柯蓓 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期3388-3396,共9页
【目的】揭示水稻籼粳杂交亲本和衍生系的籼粳分化度,为培育实用型籼粳亚种间杂交稻提供理论和实践依据。【方法】以通过不断聚合和累加不同广亲和基因与恢复基因的方法,历时21年,4个育种阶段,涉及18个籼粳杂交亲本和39个衍生系为研究材... 【目的】揭示水稻籼粳杂交亲本和衍生系的籼粳分化度,为培育实用型籼粳亚种间杂交稻提供理论和实践依据。【方法】以通过不断聚合和累加不同广亲和基因与恢复基因的方法,历时21年,4个育种阶段,涉及18个籼粳杂交亲本和39个衍生系为研究材料,采用籼粳特异ILP分子标记(水稻内含子长度多态性分子标记)和程氏形态指数法进行籼粳分化度检测。【结果】57个供试材料基因组DNA在所检测位点上均存在籼粳分化。18个亲本共检测出4个粳稻、5个偏粳、8个偏籼和1个籼稻类型。在18个亲本中,明恢63和9308的粳稻成分分别为12.50%和33.33%;粳型恢复系C418的粳稻成分仅有31.25%。39个籼粳杂交衍生系共检测出1个粳稻、11个偏粳、20个偏籼和7个籼稻类型。其中,粳型衍生系明恢502的粳稻成分仅占10.42%。ILP标记法与形态指数法判定籼粳分类结果的吻合度较好,粳稻成分指数、籼稻成分指数与程氏指数综合值的相关系数分别为r=0.794**和r=-0.7662**。【结论】ILP标记具有准确检测籼(粳)成分比例的功能;研究籼粳分化可以合理解释籼粳型恢复系配组的杂交稻表现明显杂种优势的原因,对有效利用籼粳亚种间优良基因具有重要作用。 展开更多
关键词 水稻 籼粳杂交 籼粳分化 ilp 内含子长度多态性 粳稻成分指数
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水稻ILP标记遗传图谱的构建 被引量:15
2
作者 赵向前 吴为人 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期225-230,共6页
内含子长度多态性(ILP)是一种基于PCR的新型分子标记,具有许多突出的优点。我们先前利用已公布的籼稻品种93-11和粳稻品种日本晴的基因组序列数据,已开发了172个水稻ILP标记。为了检验这些ILP标记的可靠性及其在遗传作图中的可用性,利... 内含子长度多态性(ILP)是一种基于PCR的新型分子标记,具有许多突出的优点。我们先前利用已公布的籼稻品种93-11和粳稻品种日本晴的基因组序列数据,已开发了172个水稻ILP标记。为了检验这些ILP标记的可靠性及其在遗传作图中的可用性,利用一个BC1F1(日本晴/93-11//日本晴)群体,构建了一张含172个ILP标记座位和13个SSR标记座位的水稻遗传图谱,总长度为1905.7cM。比较显示,图谱上所有标记的顺序与其物理顺序完全一致,证明了利用ILP标记进行遗传作图的可行性和有效性。文中还对标记偏分离现象进行了分析,发现在第6号染色体短臂上存在一个严重偏分离的区域。 展开更多
关键词 水稻 ilp标记 遗传图谱
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利用ILP分子标记分析籼粳杂交水稻的遗传多样性 被引量:4
3
作者 赵建亚 张瑛英 梁康迳 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2009年第3期291-294,共4页
采用ILP标记分析了福建地区20个亲本和30个育成品系构建的水稻籼粳亚种间杂交育种系谱的遗传多样性,并对结果进行聚类分析。结果表明,ILP标记可明显区分供试材料的籼粳特征。基于ILP标记聚类结果,以相似系数0.67为阈值,将该育种系谱划分... 采用ILP标记分析了福建地区20个亲本和30个育成品系构建的水稻籼粳亚种间杂交育种系谱的遗传多样性,并对结果进行聚类分析。结果表明,ILP标记可明显区分供试材料的籼粳特征。基于ILP标记聚类结果,以相似系数0.67为阈值,将该育种系谱划分成3个类群,即籼稻型、中间型和粳稻型。 展开更多
关键词 ilp 水稻 育种系谱 聚类分析
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应用EST-ILPs分子标记技术快速鉴定菟丝子属种子 被引量:1
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作者 郭琼霞 庄蓉 +1 位作者 黄振 黄可辉 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期101-104,共4页
为探索应用EST-ILPs分子标记技术快速鉴定菟丝子种子的方法,从网站(http:∥ibi.zju.edu.cn/pgl/pip/index.html)上公布的ILPs标记中选取旋花科番薯属(Ipomoea)已经设计好的引物10对,对菟丝子样品进行PCR扩增,寻找种间特异性条带。对菟... 为探索应用EST-ILPs分子标记技术快速鉴定菟丝子种子的方法,从网站(http:∥ibi.zju.edu.cn/pgl/pip/index.html)上公布的ILPs标记中选取旋花科番薯属(Ipomoea)已经设计好的引物10对,对菟丝子样品进行PCR扩增,寻找种间特异性条带。对菟丝子的5个近似种进行ILPs-PCR反应结果表明:应用引物IP9进行扩增反应,恩氏菟丝子在250bp左右具有一条特异性条带;应用引物IP4进行扩增反应,日本菟丝子在240bp左右显示一条特征条带;通过菟丝子内含子基因型的多态性特征可以区分供试的5种菟丝子。EST-ILPs分子标记检测菟丝子近似种作为菟丝子种间鉴定的一种新的研究途径,为口岸杂草检疫鉴定提供了一种快速、准确的检测方法和科学依据。 展开更多
关键词 内含子长度多态性 菟丝子属 种子 鉴定
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应用于空间关联规则挖掘的ILP方法 被引量:3
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作者 李宏 蔡之华 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2003年第16期188-191,197,共5页
文章介绍了应用于空间关联规则挖掘的ILP方法。ILP方法全称为归纳逻辑程序设计,这种方法有利于从空间领域发现有价值的知识,系统地研究地理层的层次结构,处理诸多空间对象的空间特性。这种方法已在一个ILP系统SPADA中实现,该文将通过SP... 文章介绍了应用于空间关联规则挖掘的ILP方法。ILP方法全称为归纳逻辑程序设计,这种方法有利于从空间领域发现有价值的知识,系统地研究地理层的层次结构,处理诸多空间对象的空间特性。这种方法已在一个ILP系统SPADA中实现,该文将通过SPADA应用空间数据的一些实例来说明ILP方法的特点。 展开更多
关键词 数据挖掘 空间关联规则挖掘 ilp方法 推导式关系型数据库 SPADA
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基于混合推理系统挖掘用户访问模式的ILP方法 被引量:1
6
作者 孙明 陈波 周明天 《微电子学与计算机》 CSCD 北大核心 2010年第1期29-33,37,共6页
提出一种结合DL-safe规则挖掘用户访问模式的ILP方法.该方法首先定义基于事件的日志本体,将DL-safe规则和日志本体构建为一个推理过程可判定的混合日志知识库,在此基础上借助ILP的理论和方法学习生成有效用户访问模式.该方法充分利用日... 提出一种结合DL-safe规则挖掘用户访问模式的ILP方法.该方法首先定义基于事件的日志本体,将DL-safe规则和日志本体构建为一个推理过程可判定的混合日志知识库,在此基础上借助ILP的理论和方法学习生成有效用户访问模式.该方法充分利用日志本体中事件间特定的语义关系有效简化了挖掘过程并提高了挖掘效率,为改进站点结构提供更有效的决策.实验结果表明了该方法的可判定性和有效性. 展开更多
关键词 日志本体 DL-safe规则 混合推理 模式发现 归纳逻辑编程
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解ILP的割平面法的收敛性问题 被引量:5
7
作者 熊义杰 《运筹与管理》 CSCD 2003年第2期36-38,共3页
在整数线性规划即ILP的割平面解法中,一个公认的经常存在的问题便是向最优解的收敛问题,即由于缺少割平面方程选取的准则,因而常常向最优解收敛得很慢。本文根据对偶单纯形方法解题的基本思路,提出了割平面方法应用中选取割平面方程的... 在整数线性规划即ILP的割平面解法中,一个公认的经常存在的问题便是向最优解的收敛问题,即由于缺少割平面方程选取的准则,因而常常向最优解收敛得很慢。本文根据对偶单纯形方法解题的基本思路,提出了割平面方法应用中选取割平面方程的优选准则,因而为解决该方法应用中一直没有解决的收敛性问题提供一种有效手段。 展开更多
关键词 整数线性规划 ilp 割平面法 收敛性 对偶单纯形方法
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扩展AL-log挖掘日志本体的ILP方法
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作者 孙明 陈波 +1 位作者 刘东 周明天 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2009年第6期2328-2331,共4页
为发现W eb使用记录中所蕴涵的用户访问模式,在深入分析日志本体中事件间的抽象关系后,提出适用于原子事件和复合事件间整分关系推理的ALC传播规则扩展已有的推理模式,并在此基础上提出一种挖掘日志本体的ILP方法。该方法结合描述逻辑和... 为发现W eb使用记录中所蕴涵的用户访问模式,在深入分析日志本体中事件间的抽象关系后,提出适用于原子事件和复合事件间整分关系推理的ALC传播规则扩展已有的推理模式,并在此基础上提出一种挖掘日志本体的ILP方法。该方法结合描述逻辑和Horn规则在知识表示和推理过程中互补的特点,采用AL-log混合系统构建知识库,利用约束SLD-反驳消解和扩展ALC传播规则从日志本体中学习用户访问模式,达到站点商业智能和个性化的目的。最后给出验证该方法的实例,实验结果表明了该方法的可行性和有效性。 展开更多
关键词 语义网使用挖掘 归纳逻辑程序设计 日志本体 AL-log 混合推理
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凋亡抑制蛋白ILP-2的研究现状及展望 被引量:1
9
作者 向明钧 严闹 +1 位作者 何翔 吕昊琴 《赣南医学院学报》 2012年第4期626-628,共3页
ILP-2(inhibitor of apoptosis protein-like protein-2)是新发现的凋亡抑制蛋白IAPs(inhibitor of apoptosis pro-teins),其过度表达会抑制Bax或Apaf-1/caspase-9途径所致的凋亡,从而使细胞增殖与凋亡失衡,进而促进癌细胞生长。本文从I... ILP-2(inhibitor of apoptosis protein-like protein-2)是新发现的凋亡抑制蛋白IAPs(inhibitor of apoptosis pro-teins),其过度表达会抑制Bax或Apaf-1/caspase-9途径所致的凋亡,从而使细胞增殖与凋亡失衡,进而促进癌细胞生长。本文从ILP-2的分子生物学特性、抗细胞凋亡作用机制及促进癌细胞生长等方面进行了综述,可为深入研究ILP-2提供参考。 展开更多
关键词 ilp-2
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基于线性优化的移动边缘计算中任务迁移算法的设计与实现
10
作者 沈欣 叶宇皓 司迎利 《郑州航空工业管理学院学报》 2024年第3期95-103,共9页
移动边缘计算(MEC)是一种可以提高移动端计算速度和安全性的重要技术。用户将移动端任务卸载到附近边缘设备上,以达到减少移动端负载及计算耗能等的效果,如何设计移动端任务在边缘设备中的迁移算法是提高MEC效率的关键问题。文章提出了... 移动边缘计算(MEC)是一种可以提高移动端计算速度和安全性的重要技术。用户将移动端任务卸载到附近边缘设备上,以达到减少移动端负载及计算耗能等的效果,如何设计移动端任务在边缘设备中的迁移算法是提高MEC效率的关键问题。文章提出了目前在边缘计算中两种比较普遍的任务迁移算法:整数线性规划(ILP)和贪心启发式算法。这两种迁移解决方案除考虑位置、带宽、用户、迁移等方面带来的能量损耗外,还考虑了由于车辆的机动性所带来的损耗,并使用马尔科夫链预测车辆位置,将位置预测和任务迁移相融合。实验结果表明,首先,ILP算法与贪心启发式算法的耗能近乎相同,但在同样耗能的情况下,贪心启发式算法的求解延迟远远小于ILP算法,从而确立了贪心算法在迁移方案中的优势;其次,通过任务刷新频率的选择,可进一步降低贪心启发式算法的耗能,优化后的算法比初始算法耗能降低了约20%。 展开更多
关键词 ilp 贪心算法 马尔可夫链 刷新频率
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基于ILP和最优光路的智能电网实时虚拟拓扑模型
11
作者 余战秋 《安阳师范学院学报》 2018年第5期32-36,共5页
为了满足智能电网骨干网络的实时延迟和最优光路的相关网络要求,提出一种基于整数线性规划(ILP)的虚拟拓扑模型。该模型包括网络延迟相关目标函数和光路路由、波长分配、波长连续性、流路由和流量损失约束,采用网络流量矩阵解决相应的... 为了满足智能电网骨干网络的实时延迟和最优光路的相关网络要求,提出一种基于整数线性规划(ILP)的虚拟拓扑模型。该模型包括网络延迟相关目标函数和光路路由、波长分配、波长连续性、流路由和流量损失约束,采用网络流量矩阵解决相应的虚拟拓扑问题。通过对时变网络流量数据和运行约束的自适应响应,来保持最优虚拟拓扑,从而为智能电网运营提供智能化感知和网络学习。仿真结果表明所提模型可以为智能电网实现优良的网络性能。 展开更多
关键词 整数线性规划 网络延迟 智能电网 最优光路 虚拟拓扑
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时间敏感网络中基于ILP的动态流量均衡调度算法 被引量:12
12
作者 冯泽坤 龚龙庆 +1 位作者 徐丹妮 刘扬 《微电子学与计算机》 2021年第6期33-37,共5页
针对目前时间敏感网络(Time Sensitive Network,TSN)中多采用离线调度,在处理动态需求时调度开销过大的问题,提出了一种适用于TSN的基于整数线性规划(Integer Linear Programming,ILP)的动态流量均衡调度算法.该算法以已生成的离线调度... 针对目前时间敏感网络(Time Sensitive Network,TSN)中多采用离线调度,在处理动态需求时调度开销过大的问题,提出了一种适用于TSN的基于整数线性规划(Integer Linear Programming,ILP)的动态流量均衡调度算法.该算法以已生成的离线调度表为基础,通过一种增量计算方式,有效降低拓扑和业务变化带来的开销;同时,针对链路负载可能出现的极端情况,制订了流量均衡策略,避免出现延时瓶颈问题,进而提升通信实时性.实验数据表明,与传统静态调度算法相比,在处理动态流量时的运算时间减少,链路负载更加均衡. 展开更多
关键词 TSN ilp 动态均衡调度 链路负载 运算时间
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最新ILP微处理器的设计特点及分析 被引量:1
13
作者 王俊宇 夏宏 王沁 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2001年第5期28-31,共4页
文章综述了指令级并行(ILP)微处理器的特点,着重介绍了第七代X86、Itanium、E2K等ILP微处理器的体系结构和所采用的新技术,分析了它们各自的特点和问题,并对ILP微处理器的发展方向进行了探讨。
关键词 微处理器 体系结构 指令级并行 并行处理 计算机
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ILP-2-ECM1(P85)促进乳腺癌细胞的生长 被引量:3
14
作者 王思源 向思琦 +3 位作者 王雅妮 朱林 朱柳 向明钧 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期996-1005,共10页
凋亡抑制蛋白-2(inhibitor of apoptosis protein-like protein-2,ILP-2)是新发现的凋亡抑制蛋白质,其抑制肿瘤细胞凋亡促进其生长的分子机制有待阐明,而细胞外基质蛋白1(extracellular matrix protein 1,ECM1)所介导的信号通路与肿瘤... 凋亡抑制蛋白-2(inhibitor of apoptosis protein-like protein-2,ILP-2)是新发现的凋亡抑制蛋白质,其抑制肿瘤细胞凋亡促进其生长的分子机制有待阐明,而细胞外基质蛋白1(extracellular matrix protein 1,ECM1)所介导的信号通路与肿瘤细胞的生长密切相关。本研究通过免疫共沉淀法,检测到乳腺癌MCF-7细胞中ILP-2与ECM1(P85)存在相互作用。分别用化学合成的ILP-2-siRNA及ECM1-siRNA干扰处理MCF-7细胞。以未转染的MCF-7细胞和转染阴性对照siRNA的细胞分别作为空白和阴性对照,利用蛋白质印迹法,检测ILP-2-siRNA干扰后ECM1、FAK、Akt蛋白的表达,以及ECM1-siRNA干扰后ILP-2蛋白的表达。其结果显示,与空白对照组相比,ILP-2-siRNA-5(0. 32±0. 095)及ECM1-siRNA-1 (0. 42±0. 024)干扰效率较高(均P<0. 001);ILP-2-siRNA-5组待测蛋白质的相对表达量均显著下调(ECM1,0. 19±0. 013,P<0. 001),FAK (0. 64±0. 069,P<0. 01),Akt (0. 35±0. 120,P<0. 01)),ECM1-siRNA-1组ILP-2 (0. 48±0. 060)蛋白表达也显著下调,表明ILP-2与ECM1-mTOR信号通路联系密切。分别在ILP-2-siRNA和ECM1-siRNA转染24、48和72 h时,使用CCK-8法检测乳腺癌细胞的增殖,并用TUNEL标记荧光法和吖啶橙/溴化乙啶双荧光染色法(AO/EB)检测其凋亡。结果显示,与空白对照组相比,ILP-2-siRNA-5组和ECM1-siRNA-1组的存活率均显著下降(P<0. 001),凋亡率均明显升高(P<0. 001)。利用共转染技术同时敲低ILP-2和ECM1表达,检测细胞的凋亡情况。结果显示,在干扰处理后24 h(0. 55±0. 122),48 h(0. 80±0. 107)和72h(0. 73±0. 091)的凋亡率显著均高于阴性对照组(P <0. 05)。但与只敲低ILP-2或ECM1相比,无显著性差异(P>0. 05)。表明ILP-2可能是通过与ECM1作用激活FAK-mTOR信号通路,影响MCF-7细胞的增殖和凋亡,对乳腺癌细胞MCF-7的生长发挥了积极的作用。 展开更多
关键词 凋亡抑制蛋白-2 细胞外基质蛋白1 乳腺癌细胞MCF-7
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基于ILP的电压岛驱动的多电压分配算法
15
作者 章宏伟 汪振利 +1 位作者 杜世民 张川 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2016年第1期23-28,共6页
为降低芯片功耗和电源布线网络的复杂度,针对可切分的布图结构,提出了一种时序约束下在后布图阶段进行多电压分配的整数线性规划模型,对功耗和电源网络进行协同优化,同时控制插入电平移位器的数目。为构建电源网络复杂度的度量模型,提... 为降低芯片功耗和电源布线网络的复杂度,针对可切分的布图结构,提出了一种时序约束下在后布图阶段进行多电压分配的整数线性规划模型,对功耗和电源网络进行协同优化,同时控制插入电平移位器的数目。为构建电源网络复杂度的度量模型,提出了一种时间复杂度仅为O(n)的模块相邻图构建方法来获得模块之间的相邻信息。模型中还考虑了在不同电压差的模块之间连线上插入不同延时和功耗的电平移位器,以进一步降低功耗。对5个GSRC电路的实验结果表明:所提出算法不仅可降低16.7-31.5%不等的功耗,还可将相同电压的模块有效集中在一起,形成电压岛。 展开更多
关键词 低功耗 多电压分配 整数线性规划 电压岛 模块相邻图
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服装零售票据的ILP设计在品牌营销中的作用
16
作者 随婷婷 张春明 +2 位作者 毕玉蓓 杨萍 陈建伟 《服装学报》 CAS 2017年第3期273-278,共6页
通过调研不同品牌服装店铺的零售票据,对其信息设计、版面设计及个性化元素设计等进行深入分析,探索服装店铺零售票据ILP设计的应用规律,并总结其在服装品牌营销价值体系中所发挥的作用。
关键词 零售票据 ilp设计 品牌营销 服装店铺 个性化信息
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ILP在语义Web数据挖掘研究中的应用
17
作者 刘宙 程学先 刘宇 《计算机技术与发展》 2006年第11期28-31,共4页
语义网络数据挖掘是基于语义网络环境的数据挖掘,它给数据挖掘技术的应用研究提出了新的课题。归纳逻辑程序设计是由机器学习与逻辑程序设计交叉所形成的一个研究领域,它为知识工程等人工智能的应用领域提供了新的强有力的技术支持。分... 语义网络数据挖掘是基于语义网络环境的数据挖掘,它给数据挖掘技术的应用研究提出了新的课题。归纳逻辑程序设计是由机器学习与逻辑程序设计交叉所形成的一个研究领域,它为知识工程等人工智能的应用领域提供了新的强有力的技术支持。分析了现有几种常用数据挖掘技术在语义Web环境下应用的局限性,提出了采用归纳逻辑程序设计(ILP)作为语义Web上适合的数据挖掘技术,给出了应用这种技术的算法描述,通过具体实例验证了其可行性。 展开更多
关键词 浯义Web 数据挖掘 归纳逻辑程序设计 知识
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使用ILP学习Web信息提取规则
18
作者 郭太飞 何洁月 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2007年第16期4019-4021,共3页
归纳逻辑编程(ILP)可以用于学习各种形式的逻辑规则,但在尝试用于学习Web页面的信息提取规则时存在格式不匹配问题。给出了系统结构的数据流图,重点分析了格式不匹配问题,提出了一种解决方案,主要包括规则的语法定义和动态生长方法。生... 归纳逻辑编程(ILP)可以用于学习各种形式的逻辑规则,但在尝试用于学习Web页面的信息提取规则时存在格式不匹配问题。给出了系统结构的数据流图,重点分析了格式不匹配问题,提出了一种解决方案,主要包括规则的语法定义和动态生长方法。生成的规则结构清晰,可以用于从Web页面提取信息。 展开更多
关键词 归纳逻辑编程 文本上下文规则 格式不匹配 动态生长 关系函数 测试函数 判别函数
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Analysis of Indica-Japonica Differentiation in Rice Parents and Derived Lines Using ILP Markers 被引量:3
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作者 XU Xu-ming LIANG Kang-jin +4 位作者 ZHANG Shou-gang SHANG Wei ZHANG Ying-ying WEI Xin-yu KE Bei 《Agricultural Sciences in China》 CSCD 2009年第12期1409-1418,共10页
Revealing the indica-japonica differentiation in parents of hybridization between indica and japonica rice and their derived lines can provide theoretical and practical bases for the breeding of practical inter-subspe... Revealing the indica-japonica differentiation in parents of hybridization between indica and japonica rice and their derived lines can provide theoretical and practical bases for the breeding of practical inter-subspecific hybrid rice. Using subspeciesspecific molecular markers ILP (intron length polymorphism) and Cheng's index, the indica-japonica differentiation was analyzed with special materials including 18 indica-japonica hybrid parents and 39 derived lines, which accumulated different wide compatibility and restoring genes by convergent cross method in 21 years spanning four breeding phases. The indica-japonica differentiation was detected on all tested loci in 57 materials. Among the 18 parental lines, 4 were japonica type, 5 japonicaclinous type, 8 indicaclinous type and one indica type. The japonica proportion indexes in indica restorer lines Minghui 63 and 9308 were 12.50 and 33.33 %, respectively, while that in japonica restorer line C418 was only 31.25%. Among the 39 derived lines from indica-japonica hybridization, one was japonica type, 11 japonicaclinous type, 20 indicaclinous type and 7 indica type. The japonica proportion index in Minghui 502 was only 10.42%. The results of indica and japonica classification by ILP molecular markers and Cheng's index were relatively consistent. The correlation coefficient between the japonica proportion index and morphology index was 0.794**, while that between the indica proportion index and morphology index was -0.7662**. ILP markers could be used to accurately detect the proportion of indica/japonica content in the genome of a rice variety. The results of indica-japonica differentiation analysis could make reasonable explanation for that the hybrids obtained from indica-japonica type restorer lines had obvious heterosis. This conclusion would provide important guidance in efficient use of beneficial genes of inter-subspecific hybrid rice. 展开更多
关键词 rice hybrids between indica and japonica indica-japonica differentiation ilp japonica proportion index
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C2株蓝氏贾第鞭毛虫ILP基因的克隆表达及蛋白结构分析
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作者 张亚粉 刘岩 +7 位作者 王皓钰 郝金童 高红丹 林志强 刘阿倩 雷田田 王一同 余源 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期618-622,共5页
目的利用大肠杆菌对C2株蓝氏贾第鞭毛虫ILP蛋白(Impact-like protein)进行克隆表达,运用生物信息学软件进行蛋白结构分析。方法提取C2株蓝氏贾第鞭毛虫基因组DNA,PCR扩增ILP基因,构建pGM-T重组载体,挑选阳性克隆并进行序列分析;将ILP基... 目的利用大肠杆菌对C2株蓝氏贾第鞭毛虫ILP蛋白(Impact-like protein)进行克隆表达,运用生物信息学软件进行蛋白结构分析。方法提取C2株蓝氏贾第鞭毛虫基因组DNA,PCR扩增ILP基因,构建pGM-T重组载体,挑选阳性克隆并进行序列分析;将ILP基因连入原核表达载体pET-28a(+),并转化大肠杆菌Rosetta(DE3),IPTG诱导表达。运用PSIPRED和SWISS-MODEL进行蛋白结构分析。结果成功构建了原核表达载体pET-28a(+)-ILP,该基因全长831bp。SDS-PAGE结果显示,目的蛋白条带出现在相对分子量约33kD的位置,与预期相符。Western blot结果表明,大肠杆菌成功表达了重组蛋白。结论成功克隆、表达并分析C2株蓝氏贾第鞭毛虫ILP蛋白,为蓝氏贾第鞭毛虫ILP蛋白结构与功能的研究提供了有价值的资料。 展开更多
关键词 C2株蓝氏贾第鞭毛虫 克隆 表达 ilp蛋白
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